EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM059-05456 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E11.5 
Coordinate
chr3:127446940-127454660 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr3:127450390-127450409ACACCAGAAGAGGGCACCA+6.07
CrxMA0467.1chr3:127453249-127453260CTAATCCTCTT-6.62
Foxd3MA0041.1chr3:127447857-127447869AAACAAACAAAC-6.32
HNF4GMA0484.1chr3:127447012-127447027GGAGAACAAAGTCCA+6.14
JUN(var.2)MA0489.1chr3:127447074-127447088GGGAGATGACTCAG+6.08
POU1F1MA0784.1chr3:127453190-127453204CTCATTAGCATATT-7.58
POU3F2MA0787.1chr3:127453191-127453203TCATTAGCATAT-6.27
POU3F3MA0788.1chr3:127453191-127453204TCATTAGCATATT-6.11
RAXMA0718.1chr3:127449119-127449129GCCAATTAAC+6.02
RREB1MA0073.1chr3:127446955-127446975CCCCCAGCCTCCCCCCCCCC+6.21
RREB1MA0073.1chr3:127449132-127449152GGGTGGGGGGAGGTGGGGGT-6.27
ZNF263MA0528.1chr3:127449137-127449158GGGGGAGGTGGGGGTGGGGAG+6.55
ZNF740MA0753.2chr3:127446965-127446978CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:127446966-127446979CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:127446967-127446980CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:127446968-127446981CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:127446969-127446982CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
CCACTTGTTT TTGCTCCCCC AGCCTCCCCC CCCCCCCCCC CCGCAGGTTT ACCTTGTTCT 60
GACATCACAA TAGGAGAACA AAGTCCATCT ATAAGAAGCC CTTTGCACTC TAAAACCTCT 120
GTGTTCCACG CGAGGGGAGA TGACTCAGAG GGATGGCTGG CAGCAAGGCC ACAGAACAGA 180
CTCACTCTCG CCTGTTTCGT ATATAATGGC CTCACATATC GAACTTCATT CGAAGCCGAT 240
GGGTTGGTTA GAAAAAATAT ATATTTTTTT CTAATAGTAA ATTATATACA CAATCTATTA 300
TAATAGTGTT TCATGCAACG TGCCTGGATT TTTATGTGGG TGCTAGGGAT TCGAAATCAG 360
CCCTCATGCT TGCACAGGAA ACATACTCAC TAAGTCACCC TGTACCCTCA ATTCTGAAAT 420
TATTTTTTTT TCTGGTCCCT GGTTTTGGTA GTAAACAGCC TTGGATGTCA GCCCGTGCCT 480
ATTTGCCTAC AAAATACAAT TCCTACTTCA TCCGGTTCTG CAATTAAACC CACACTGTGC 540
CCATTTGGAC CATCTACTCT GTGTGTGACG GAGGATACAT TGTATTTTCA ATCAGGGTCC 600
AAGGGCCTCC AGCCCTGCCA CAGAACGTTC TTAGAGATTC CTCTGTTTGC AAGGTCTAGT 660
TAGTGTGTAC TTGGAAATCA TACTGGGGTT TAATACTATC TTAAGCAAAA TACAAACAAA 720
AGGTTAAACG CACAAAACAA TCATCCCAGT ATCCTTCAAA GTTATTCGTA CAAGCGAATG 780
AGCATGGTCT CCCCGGAAGC ATGCTGCCCA GTGACACCGT CCTGGGAAGT CAGAAGCTGT 840
AACTGAACGA GGAGAGGAGT CAGGCTTTCT CTGACCCAGG TGTATGCATT TCTGCAGAAA 900
AACAAAACAG AACAGAAAAA CAAACAAACA ACCTCAACAA CTGAAAACAA AAGTTATGAA 960
CTGTGAAAAG GAAAACTCTC ATTTTATCTC CCCTTAACAT TTCTTTTTTT AAGATATGGA 1020
AAAACCTTGT AGTGATCAGA ATGATGAAGG CTTTTGTACT ATTGTCACCT CCTTTTCAAC 1080
ATACAATTTG CTGTCCCAGG CACAGAGAAG AAGAGACAAC TGCCAGTGGC TAAGTACTTC 1140
CTGTGGTGTA GATATTGTGT TGTCCACCTT AGATTCAAAT CTGTAAGATG TGGGCTTCAT 1200
CCCCACTCTA GAGATGAGAA AATTAAGGGT CATGAAGGTT AATAACTTGC CAAGGTCATA 1260
CACACTAAAG AGGCTGTAAT CGGAATCTCA AAGCCACTTT GATCCCAAGT GTATTTTCAA 1320
AGCCATTTGC CCACCAGCCT ATGGCCACAA ACCTGAATAT TTCAAAATAT ATCAATACCC 1380
AGAAAGACAG GATCCATTGA AGTTCTTTGA ATTGCTCTCA GACTCGCACC AAAATCACAC 1440
CCTCTTTCCA CTTTTACCGA TGAATCAATT TCTACCTACC TTGTTCTTAA TAAAAGAAAT 1500
CCAATCCCCT CATCCCCTCC ATCTACACTA AAAAAAGACA GTTGAAAAGT CAGGAGACTA 1560
ATTCAATGGG ACAGTCCTGC CGTTTTCACA CTGAAAGATA ATTGCTCACA ACTGAATTCT 1620
CTCTAGACCT CTACTTCGAT AATTCAACCC AGAACAGCTC TCCTGTCAGA GTCTCTCAGA 1680
GGGCGGGGGC ACCCTGTCTC CTAACAGATA ATTACCGATG AGTTACTGCC TCTTGCTAGG 1740
ATTTCTCTCC TTCGCTTGCG CCTCTTATAA AAGAAGAAAC TTTAGAGATT AAGGTTTTCT 1800
TTTCCTCCTT CTTCTTATTC TTTTTTTTTC CCCCCTCCAA AGCTGGGTAC ACCAACTGGC 1860
ATGGGCTGTA TTAAAACCAG GGGGAAGCTC AGTCAAAAAG CCTTTCGGAA GGCAGACGTT 1920
CTTCTTAATA TGCACCAACA TGAAAGGCTT TCTTTTCATC CTATACAACT ACAGTGTGTG 1980
TAAATTGCAG GGGGCTCACT GGCGTAAATC TCGGCTGCGA CCTCTGAGGT AAACTGGATT 2040
TACATTACTT TCTGACAAGA ATTAAATGAA GGCCTTGTGG ATATATGAAC AGCCTTCTCG 2100
GCTGCAACAG ATGGGCATGA ATGTGCTCCC TAGGAAAACT ATCAGTAACA TCTGTGCCCT 2160
CCGAATTCTG GTGGTCTCAG CCAATTAACA GGGGGTGGGG GGAGGTGGGG GTGGGGAGGC 2220
CACCGCACAG CCCCCAAGCC AAAACCCAGG CAGAAGTGTT TGTGTTTGGA GATGGGATCA 2280
GGCTGGCCTG CGGCCTCGAG GTTAGCACTT CATTGTCACC ATTCAAAATG GGGAATGTGG 2340
CTTACAAGCT ATTTGTATAC CACAGTGAGG ATAATATGAT TTTTCTCATT TGACCGGAGG 2400
AGATGGCCCT CTCTTGCAGC TGATATCATA TTTCGGCGCA ATCTCTTTGA GAGTGTTTAC 2460
TTTTGTCTCC TCCGAGGCAG GCTGATGGTG TTGCTGTCTG CCAGCTTCTG TGGCTCATTT 2520
ACATGTCACA GAGCAGGTGA ACCCTGCTCT GTGCAGAGAC CCTCCGACGA TGATGGAAAG 2580
CCTCTGATGT GATTTCTTTC CCCTCTGTAG ACCAGGCTAC CTTCCTCTTC CTTTCACCAA 2640
TTTCACAAGG AAAGCCAAAT CAAGGTTTCC GGGTTTCACC GACATGGAAA GAAATCACAT 2700
CAGAGTTCTT CGGTCATCAT TAGAGGGACC GATGAGTGGC TGTTTGTGAC ACAAAGCCAT 2760
GGATCCTGAA TCCTGTTGTC CCACTGAGCA AACCTCAGAG GTCAATCTCT TGTGTCTGCA 2820
AGAGGGAGAA AGAACACTGG AGAAACCAGA GAGAAGCCGT GGTTCCTCTT CAGCCCTCCT 2880
TGTCTTCACA TCTCAGTCTA CATGTCAGAA GCTCACAGGG AAGGAGACTG GGAGGAGCTA 2940
AAGGAATTGG GACTGAAGAC CGGTGCAACA TGTCCTTGCT TGGTGTTAGT GGCGAACAGG 3000
AGAGGCTGTT CGCAGAGCTT AAGTCCTGTG CCTTCTGGCC CCACATTAGC AACACAGTTT 3060
GAGATCCCAG GCTCCCAAAT CTGGATTCTG GTTGTACCAT TGACTGGGTG TGAGAAATGG 3120
GTACATCACT TGGACTTTCA GAACCTCCGT TTCCTTGTGG GTAAACCTGA GCTAATCCCA 3180
GTACCTCCCT CTCAGTCGGG TTGAACTGAC TAACAAAGGG AGATGCTATG GGAACCCTGG 3240
AACATGACGG GGTGGGAGTG GGGGGATGGA GGGCGCTAAA GGTACACTGG TTCCCTTTCA 3300
AGACAAATTC AGGGAAGTGA TTTTTCCAAA AGAAGCAATT TCTATTGCTT TTAGAAGCCT 3360
AAAGACAAGT TTTAACAATA CATGATAAAC ATGGTTTTTT TTTTCCTCTT TAATTTGTCT 3420
ATTTCATGTA TAGGATTGCT GTTTTCATGC ACACCAGAAG AGGGCACCAG ATCTCATTAC 3480
AGATGGTTAT GAGCGACCAT GTGGGTGCTG AGAATTGAAC TCAGGACCTC TGGAAAAACA 3540
TCCAGTGCTC TTAACCGCTG AGCCATCTCT CCAGCCCCTT GTTTTAATGT TTCCATACTG 3600
GGGATGTAAC TTAGCAGAGA CGCCAGGATT GATCTCCAGC ACTGGGAGGA GAAATTACAT 3660
AATTTCCTTA ATGCCTAAGA CTTTGAAATT ATGACTTGCC AAAATTATCT TCCTAACCAT 3720
CAGAAATACC TAGGTATTTT GAAACTGTGA GGCAGAGTGT TCTTGGGGCA AGAAAACTGG 3780
GGTTAAGCTG TTTAAACTTT TCTTCCCTGC ATGCAGGAAT GAACCCTGGC ACTGTGCTTG 3840
GTTGGAAACT GAGTGCTCTA TGTGAAGTTT CTGACGTGAA TGGTTGATTG TGATACTTCT 3900
CACGGGACCT GTTTCCCCCT TTGTTCTGTT GTTTAAAAAC ACCGATTTCA TGTAACTGTG 3960
GCTCAGAACA GCAAGCACAA AAGGAAATGT AGAGAGGCGA AGCCTCCAGG AAGAGGTCCT 4020
ACTCCCCACA TAATGAATGT CCCTCACACT GAAGCCCTTG CTCTCTCTTC CTCTAATATT 4080
TTATTTTGAA TTTTTTTGTA TTATGAAAAA TTTTTAATTT ATATACGGTA AAGTTCAAAG 4140
AATAATGAAG TCTAATTAAT TACCCTGTGC ATAACATTTT GCCACATACA CTTATTTATA 4200
TATGTATGCA TGCATGTGTA TGGATTTAAA CTATTTGAAA GTAAGTTAAA AATACCACAA 4260
AATGTTCTTC TCAAACCATT CCGAATATTT CGTCTATGAG TAAAATGACG ATTTTTTGCA 4320
TTTTATTCCT TCTTTGAGAA TTTCATACAA AGTATTTTGA CCATATCACC CCCTCACTGC 4380
TCCTGGGGCC CCTCCCAGAT CAGCCCTGAG CTATTATTTT AAAGTACATT TTCATGTGTT 4440
TACGAAGAGA TTTTTATCCC GTTGTTTTCT GCCTTGTATA ACCTTCCGTC TATGCCATTA 4500
CGTAAACTTA ACGCAAGCTA ACCGCCAGCT CAGGGGAAGA GTGTTCCTGG TGGAAGTCAA 4560
ATTCTTCATT CACAAAGGAA TCTCTCCATT CCTGCACCAT CCCTGTGAGC TGGCTTTCCA 4620
CACCATGGGC ACAGCAGGGC GTGGTGTGAG CAGGGCATGG TGCAAGATGA CCATTGCCAT 4680
AAGTTTGGTA TAGAGGTTTT TTTCCTCATT GAGCCGCAAT ATCAAACGTT GTTCTGTCTT 4740
ATATGCTGGG GCTGGCATCA CTAAGAGCAC TGGCAAGCAG GAGTGGGGCT CTGTTGCTCA 4800
GGGACTCAGA AGAGGGGAAA CAAAAGCACC TGTTGTTTGG TTCTTGTAAT GACCTTAGAA 4860
GTGGCCAGTT GGCTGCAGCC CCCAACTCCT CCTTAGGCTC TTCCCAACAC TGCGCCTCAT 4920
ACATCCTTAC TGGATGTAAA AGGAGAAGAA TTGAGGAGAA GATCAATAAA TTTAAAAGCT 4980
CTTTAAGGAA AGACATAATG AATTTGGTAC AGCACATATT TTTAGATCAA AGATGCCTTT 5040
GAAGTGGCAA AGCCCTGACC CTCGGGAAGC GCTTCCTCTC TCGCCCACAG TGCTTGTCGT 5100
CAAATAAAAT GGAAGTTAAG GAAATTATCT TTATCTGAAA ATGGCCAAAA GAAGCCATCA 5160
CCTAGTGACA GCCTTGTCAC AAGCGACAAT TGGGGAAATT GTCAGGAAGG GAAGGCCTAA 5220
CAAGCAGAGG AGAGGGCTCG CTGTTTGCAC TAATCTGGCC ATGCAGCCCC CCACACACAA 5280
TCCCAGTCAG CTTGCTGTGT GAAACAGCTA AGGCTTTGTC AGCGCTAACA GGGAGTGGAG 5340
AGTGCGTTCT TTCATGAATA TGTATCACCG TCCTTCTGTG TCCACAGACA AACCCTTCAC 5400
AACTTTGATA AACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACCATTT CTAACCAACA 5460
AAAAGCCAAG GGATTCTAAG CCCCTCAGTC AAGTGCAGCG AAATGATCAT AGCTGATGAA 5520
AGCTCACGCA TTAGAAATGA AGCCAGGGGC AGCGGGCGCC ATGTGTTGGC TGGCTCCATA 5580
TTTCCCAGGC ATTGCTAGGA AATCTTCAGG GGGTTTTCAA TCTCCGAGAG CCATGTGCAC 5640
GTTCGCAAAG ATGATGTACG TGGCTACGTG TGGCTTGTAG TCACATCCTG GCAATGAATT 5700
CGCCGACTAG GTCCTGAAAC TGAAATACCA AGTTGAAAGA AACTGATGTG TCTTCAGGCA 5760
AGCACGTAGC CACCACCTCT AAGAAGCTGC AAATCTCTAA TCTGAAGGAG CAGAGACACT 5820
TCCCAACTCT AAGCAGGGGA ACACTGGCCA GGGGAAAAAA ATTCTAAACA GAAGTTGGAG 5880
AATGTGGTCT CCGTTAGTTA GCCTTTGTGT TCCTAATTTT TTTCTTTAAA AAAAAAAAAA 5940
AATTCCATGT TATAGCTATT ACTTTCTGCA AGGATAAATA TTTCACATTC AACTCTGTGG 6000
GCAGGTAGAC GTAGTTATTT TTGGAGTGAC TGTCTATAAA CAGGCTTTGA TTTTCAGCTT 6060
ACACTGGAAT TGAATTTGTC TTAAATATGA CTGTACATAT AATTATCTCC ATCTTTTATC 6120
TAAGCAGATA AATAAGGGAG GAAAACTAGT CCTTCTGATA TGATAAAGTT TGGTTTCCCA 6180
CTGTGGGAGG GACAAAGCTG AGTTCGGAGG GGATTTCATA TTACGAAATG TTTGCCTTAC 6240
ACATTACCAT CTCATTAGCA TATTCGGCTC TACGTGAAAT CCAGCTCTGA ATGGTCTCAG 6300
CACGCTGGGC TAATCCTCTT TAAAGAGCTA CAGGCGATAT TACATGTGGC CACAGCAGCA 6360
GCCATGCCTT TCCTGCCTCA CTTTGAAGAC CATGAACAGA GTCCTCTTGT GCGGCTGTCT 6420
GTACGGCCCT CCTAAACCGC TGCTTTCTGT GCTGTGAGAC CCTTCTGTTT GCTTCAAGGA 6480
GAATTACGAG GCTGAAATCC ACGCCCCATT CTGAAGGCTG CACAGCACTT GAAGGGGAGA 6540
TATTATGCTG CCTTCACTTT CTCCTAAGTG TCCATCCACA CTCTTTTCAA CTAAGATTAA 6600
AATGAACTAG ATCCAAGTAT TTTGGGTCCT TTGATTAGGA TCAAGTGCTA ACCACATCTT 6660
CTAACCAGGG AATCTGTTCC TGAATAAGGA GGAGAGGCAG GCTTAGTGAT GTCACCGGCC 6720
TCTCTCCCTG GACTTTACTG GATAGCATTA AACTTTTATG CAGTTTGTAG GTAGCTCATT 6780
TTCCCACAAG GCAGCTGAGC TGACAACAGC CAGGTAAGCA GTAGATAGAT AATTCAGGGA 6840
TCAGAAGCCA ACAAACAAAA CAAATGAGAA ATTGTACAAC GTTGCAGAAA AAACACGGTT 6900
TTGTTGTTGT TTGCTTGTTT GTTCCTTGAG ATGAAAGCAA AGAAAGAAGG CTACTAAGAT 6960
GGATGAGCAA AGGTGTTTGC TGCCAAACCT GAGGACCAGA GGAGAAGGGG AAATCAGATT 7020
CTCACAAGAT GTCCTCTGAC CTCCACATGA GGAAACCCAC ACACACACAC ACATCATACA 7080
CATCCCTCAT ATATACATAC ACATACCACA CACAACCACA CACCATACAC ATCCCTCATA 7140
CACATCCCTC ATATATACAT ACACATACCA CACACACACA CATCACACAC ACACACACAT 7200
ACTACATACC TTACATACAC ACACACAAAC ATCTACACAC ACACACACAC CACACACATA 7260
TCATACACAC CACACACACA CTTCACATAC TCACACCATA TATACTATAC ACACACACAA 7320
CATACACATC CCTCATATAC ACATACATGC ACCATGTACA CATACACACC ATACACTACA 7380
CACACACACA AACACACACA CACAAACACA CACACACACA CTACACACAT ATCTTACATA 7440
CACATACTAC ATGCATAACT TCCCATAACA CCACATACAT ATACATACAC ACATACATAC 7500
ATTACACCAC ACACACACAG AAATTTACAT GATGCTCCCT TAATATTTAG ACTGTACAAG 7560
AACAAGACAG TCCTATATCA CAAATAAGCC TGGCCATGTT TTCCTTATTT TTGATAACTA 7620
ACATAAATAT ATAACTGGTT ATAAAATTAT TGGTTTGCAG TTTTGAAAAT TACTGTGTAA 7680
AAATTGATAC CCAAGGTCTG CTATACTAAT CACACAATTT 7720