EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM059-05294 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E11.5 
Coordinate
chr3:88033450-88038800 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOSL1MA0477.1chr3:88038129-88038140GGTGACTCATG+6.62
FOXP2MA0593.1chr3:88038713-88038724AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr3:88038710-88038727GATAAGTAAACAAAAAA+6.18
JUNDMA0491.1chr3:88038129-88038140GGTGACTCATG+6.02
Nr5a2MA0505.1chr3:88033516-88033531GCTGGCCTTGAACTC-8.25
Nr5a2MA0505.1chr3:88038479-88038494GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RREB1MA0073.1chr3:88036243-88036263CCCCCACCCCACCCCCCACC+6.64
RREB1MA0073.1chr3:88036244-88036264CCCCACCCCACCCCCCACCA+8.54
Stat6MA0520.1chr3:88037013-88037028GAGTTCCAGAGAACT+6.63
ZNF263MA0528.1chr3:88037265-88037286GGGGGAAGAAAGGGAGAGAAA+6.09
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04018chr3:88033723-88035495Cortex
mSE_04384chr3:88031326-88038230E14.5_Brain
mSE_10788chr3:88033557-88035082Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGGTGTCTTG AAATAAAGTC CTGTTGTGTG 60
GTTCAGGCTG GCCTTGAACT CAGAGCACTC CTCCTATGAT TCCCCTATGC TGGGATAACA 120
GGCCTTTTCC CCACACTTGA CAATTTCTCT TTACAGACCA AAAAGAAGAC CTGACGTCAT 180
CCTGAGCACC CCCGCCATGC AGAGTGTGTT CGCAGACTGC CAACGGGCTG GCTCCGGCCA 240
GCAGAAGTGA ACAGAGGTGG AGGTTCAGCC TGACAGCTTC TCCCCAAAGC CATGGAGAGA 300
AAACCTTACC ACCCCCACCG CCCAGCTACT TCCAGCAAGT TGTCCAGCCT GACCCCTCTA 360
TTTCCCCTGT TGTCTCTTAT CTGGGTCCCT GAGACCCACC CCATCTCCAA TAAAGAACAT 420
TGCATACTGT GCATCAGTGT TGCCTTGGGT GTGCCAGGCA GGGTCGGGGG CGTGCTGGGT 480
TCTCCATACT AGAACACCAC TACTGAACAA CATAGTCACA CCAGGCAGGG CTCCCTAAAG 540
CCTACCTGCA TGGCCAGCGT GGTCCGAGGA CAGTGTGCTC TCCCCACCCT GTCTGCTAGC 600
CTCCAGCTTC ATGGGAACTC CATTAATCAT GGGATTCCGA GATCATCAGA GCAATAGGAT 660
CACTCCGTCT CCAGGGGAGC ACAAGGCAAG AGCCAGAGCG GGACTGTTCT TCAGTCAAGG 720
GGCAGGGGTT GCTGCCTCTC TCAGTAGAGG CTTTTTCTCA GAAATGGCTT CCTGGTCTGA 780
CAGTCCATAG ATGAGGAACA CCGCTGTCCT GCAGGCTACA CACTACCATT CTCTCTAGCC 840
TCTCCATGAC ACAGAAGGAA AGGAATAGGG CTAGCAAGTC AGACAACAGG CAAGACTTGT 900
CAGCCATAAA CCTGACACAG CTCAAGGGAG CACGGAAGAG CCACAGCAAG CAATTGTGCT 960
CTTGACCTCA TTTCCCCTGT AACACCCACA TCCAACGCTG TGCTCCTGAA CGCGTTGCTG 1020
GGAGCAGGAG CAGAGCCCAG ACTCCCCCTC TTCGAGCTCT CTTGCCCTCA CCCAGAGTTC 1080
TTCCTGTCTG AACACCTCCT TGAAACTTCA GTTGGAATCC CAGAATTTGT CTAAACACAG 1140
AAAATACAGG ATCACACGTG GCGTGATTGC TACGACCTAG AAAGCAAAAG GGGGTATCCA 1200
CCACCATCTA CCCTCCCTCC CAAGAGGCAG CCCTTAGCCC CAAGCCCTCC AGGAACAATC 1260
CGCACGCATC TGGGCACTCA CACCCAACAC TGCAGTGCTT CTCCGCAGCA TTCCTTCACA 1320
GACACACACC GGACATTGAC TGCTCCGGAG CAGCCGCAAC CTCAACCTGC TCGGGGGTGG 1380
AGAGTCTACC TTGCACGCTC AGGCCCTGCA TGGTTCAGCA AATCAAAAAG TGCCCTCATT 1440
TTCCAGAGGA ACTGAGGCTG TGGAGGGAAA GGACCAGCCT CAGGGTCCTC AGTTCCTCAG 1500
CATCAGGAAA GCCCCATGAG CCCTAGCGTT CCCCAAAAGG ACAGAGCCTG GGATCTGACC 1560
AGGGCTATGG ATGCTACTGG TCCAGCAAGC TTGTGAGCAC TGGGGTCCCA AGGGCAGGTC 1620
CCTGTGTGAG CAAGTGAAAG CTGCCACCCC CTCCCCCTAC TAGGCTGGAG CATCAATCTT 1680
CAGGGACATG GGGGTGGGAA GTAGTGGTCA GCCCTGAGCC AATCCCATGC TTGCACTAGC 1740
AGCTCCTTAG GAAGCCCATG GGATCTGTAG AGAATCTGGT GGGTGTGCTG GTCTCCGCCC 1800
AACCAGGAAA GGGTTTGGGG TGGCAGCAAG CAGAGGCAGG GGGTGAGCTG CCTTTTAGTA 1860
ACTGAAAGAC CTAGCCAGAC CCAGTTGGGG TCAGGAGGGC AAGAGGGCAG GGAGGAGTTC 1920
TTCCCTAAAA AGGGATTCCA CAGACTGACT GAAGTGGGAG GAACCAGGCA GGCCCTCACT 1980
TATATGCTCT CAGAGTCCCA CTGAGCATAT GCAGATGAGT CTGTCTGTAT GCAGATGAGT 2040
CTGTCTATAT GCAGATGAGG AGAGAAGGCA TTCTCTTCTC TGGGTTACCA TAGAGCCTGT 2100
CACCCCCTCC CTTTCCCTTT GGGTTCCAGC TGCAGGGTAG CTTGGGAAAA AGGCTAGCCC 2160
CTAGGGAGGG GCAACTTACA AATAAAAGGT TAGACTTCAG GAAGGACTGA CCAAAGGAAA 2220
AAACTAATCA GTCTGGGGAG GAACTAGAGA TGGAAGAGAA TATAGAGAGG TTTCTGAATA 2280
GGTGAGACCA AACCATGCCC TACGGAACCG TGAAAGAACA ACCCAGGCTC TAAGTTCACA 2340
GACGGGCAGA AAGCTCTTGG ACACACAGGC TAGCAGAGGA AAGGGCCCCA GAGAGCAGCT 2400
GTGCTGATCT AGTGCCATCC TGGTCCCTCA CAGGTCACTG GCTCCTGACC TCAGACCCTT 2460
CACAGACAGG CCTGGGGCTC CTGCAGGTCA CATAGATCCC AAATAGCAAG TCCCTGGCCA 2520
CTGATTTGCA ACAACTTAGG CTATGGTGGG CAGGTTGGAA TGACAGTTCC TGCATAGGTC 2580
TTAGGACTTC CGTCAGGGGA TAGGGGCAGA GACATCAAGA GGGGAGAGAA CACCAGGGCC 2640
TGGGGAAACT GAGACCCAGA AATGCTAAGA AAGTTGCCTC TTCTTTCAGC TGATTTAAGC 2700
CAAGTTGGGC CTGAGCCCAG GGCTTCTCCT AGGAGTGTAG AGGCCTTTGG AAAAATCTCA 2760
CTTTTCCTCG GGTGGCCCGA GTTCCCTTTT CCACCCCCAC CCCACCCCCC ACCATTCAAT 2820
GGTGTAGCCA AGGCCTTTGT GGAGAGGCCC TGGGGAAGAG AGGGCCCTTG TCATCCATTC 2880
ATCTTGCAGG AGGCTTGGCC CATGCCAGAC TCGCTGGACT CTCCTTCCTG GGAGGTGCCA 2940
GGCAACCCCC ACCTCCCCTC GTGGCTGCTC CCCCACTTCT ATCATTTCCT GGGGCCTCAG 3000
GGGTTTGGCT GTGATCCCAG CCAAAAGATG GTGGGGAGTC CCACCTCCCA CACTTCCTCA 3060
TTCACACACT GGCACCAGAC CTGTGGGAAC GCCGGACAGC AGCTGGGCAT TGGTGCCCGG 3120
CTCTCCCCTC AGCCCACAGA CCTTAGAGAA GGCACGAGGA ACAGGGCCTT CCCCCCCTGC 3180
GCTGTCCTCA GCACTGATTG TGAATCTGGG TACAAACAAG GCCTGTAACC TGGATAGTAA 3240
CAGACCTTTC CCAGGAAACC TTCTGACAGG CATATATTCT GGGTCACCTT AACCCTCCCC 3300
ATAATTCTGC TCTGCTCGAA GCTCCAAGGA CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAACCC 3360
TTGAGGTTCT CCTGACCTCT CTGTGGCTAA AGGCCCTAGG GCCCGAGAAC AGGGAATCAA 3420
CATGGGGCTA CTAGTAGAAG GTATCTATCC AATCAGGGCT CTGGCCTAAA TTCCATTATG 3480
ACAGGTCTTG GTGGCTTCTG GCCCAGGCAG TGTGGGTGAG TTGGAAGGAA TGTAGAAGTC 3540
ATTATGAAAG GACCAAGGGA AGAGAGTTCC AGAGAACTCT GAGAAACTGG ATCAAGAAGA 3600
GACAAAGGAA AGACATCCTA TTGTAGACAT CCTAGCCATT GTACCCAGGC CAGGTCACAG 3660
GGTGGCAGCT TCCTCTGTGC AAAGACTTCT AGGGAGAGTC AAATGGTTAC TGGGAGTCAT 3720
TTCAAGACCA GAGACAGCCC AGCATTTTAT TTCTCATAGG CGGGGAGGCC TTTAGCTGAG 3780
ATAGGCTCTC TGTGAAAGAG AAGGGCTCCT AATTGGGGGG AAGAAAGGGA GAGAAAGAGA 3840
GGGAAGGGGC TCTGCAGGGC AAAAAAACCC AGAGCCAGCC TGCCATGGAG GGAGATTAAG 3900
GGATTAGAGT TAAAACAAAG TGGTCGGGCT GGAGCAGGTG GGCTGGGGCC CCGTGCTAAC 3960
GATCTAATTG CTTGCTGCCT TTAGCAGGGT GTGAGCCAGG CCTGGCTGTA GATCTCTAAT 4020
GAGTCCGGGT GTTTTACAAG GGAGGTAAGT GAGAAGGTGC AGAAACGAGG GGCCAGTCAG 4080
GAAGGTCTTT TTCCTCTCTT GAAGGGAATC AAACTCTTGT GCTCAAGTAC AGAACCTCGA 4140
GTTCATGTGC TCTGCCCCTG CCTTGTGCCT ACCCAGGGAA ACCACGGGAG AAGATACAGC 4200
CTGTGCAGAA GGATGCCTAG GTCCCCACCA AGTAGGTATG GAGCCAGGGG AGAGATCATG 4260
ATCTCTGCAG CATTAACTGG GCACACACTC AATGTCGGTA TTGTACTAAG CTTTCATCAG 4320
TTTATCAACT CTCCCAAACA CACAGTAAAG GTTGAGGGAC TCCTTGTAGA TACCAGGGTC 4380
TTTCTGATCA GGACTGGCTC CTTTCAGACC CTTCCATCTT CCTAGGAAGG GACAGGTCTT 4440
CCAACCTTCT CTATCAGTGC TGAGAGAGTT CAGTCTGCAG CTGACTGTAC CCCAGAAGCC 4500
CCTGGCTGTA GGGTTCTAGC TCAGCCAGCC TGCTTGCTTC CCCCTTGCTC ACATTCCAAA 4560
AGAATAGCAC AGTCCCGGAG ACACGGCCGG CCATGCCCCC TCTCCAAGCC TGTGCACACA 4620
CCGTGCCCTC TCCTTAGACA GTCACCTCTG CCCACTAACA GTCATGTGAC AACCACTTCG 4680
GTGACTCATG TAGAGTCTTC TCTTTGCCTG CTGGGTTCCC CTGAGAGTTG AGCATCAGTG 4740
GCTGCCTCGT GTCATGGGTG ACCTGGTCAC GGGTGACTGT TTACTTTTAT AAGTAAGAGG 4800
CCTGGGGGCA GGAACTCTGA GAGCCCTGTG GGGGGAAGGT GTGGGAGCCT CTTCTGGTCC 4860
GCATGAAATA AGTGTTTATT CAGAAATAGT TTTTTCCTTG TCCTGGGCAT AGAACCCAGT 4920
GCCGTATTTG TACTCATCTC AGTTTAATTT AAAATATTAT TTTTTATTTT ATTTATTTGG 4980
GTTTTGTGAG ACGACGTTTC TCTGTCCTGG GACTCTCTCT GTACACCAGG CTGGCCTTGA 5040
ACTCATGGAG TTCCCAAGCA CTGGGATGAA TAGTGTGTGC CACCATGCCC AGCTGATTTT 5100
TATTTTTAAA ATTAAGGAAG GTGCTCTGGG GTTGGTTGCA CATGCCTTTC ATCCCAGCAG 5160
TCAGAAAGCA GAGGCGGGTA GAGCTATGTG AGTTTGAGGT CTGGTTTACC TAGGGAGATC 5220
CAGGTCAACC AAGGCTACAT AGTGAGACCC TGACTTTCAA GATAAGTAAA CAAAAAAAAA 5280
ATTTTTTTTA AGCGGGGATG GAAGAATAGT GTTTGGCTGT GAAGGTCAGG ATATCAGAGA 5340
CCCTCAGACT 5350