EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM058-10870 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Fibroblast 
Coordinate
chr3:60302430-60305100 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
TTAGATAGTT TGTTTTTTTT TTTCTCCTAG TGGTTCAAAC TTTTCAATAA TAACAGGTTA 60
GGCTTACTGA TGGCAACATT GTTTCAGGCC TTACTTTATT TTGGCTCACG TCTAAGGTTT 120
AGATTGGCTT GGATGCCTTG TCATGGCTTT CTTTTTCTCT TTATCTCTGT AAAATAACAT 180
TTTCCTTTGA TTTGCTCTTT CCTAGACTAT TGTATTGTTT CTAACATTCA GGTGCCTTTC 240
TTGTATTCCT TTTTTGTTCT ATTTGATGGA GCAGAAAATT TGAGTTTGTT TCGATTTTTC 300
TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT GATAGTTTCC CCTCTTGTAC 360
TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC AAATTTTCTA 420
GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC CAAAAAACCC AAAACCAAAA 480
AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA CTGTAAATTA ATCCTTCAAA 540
CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG GTGCAAAGGT 600
AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA CTGAAAACAA 660
GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC AAGGCCCATC 720
CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT TACCCTTCCT 780
TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA AGATCTTTCT 840
AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT CATAGTTTGC 900
TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC CTTTTAAAGA 960
AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC TTCTTGCACG 1020
TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC TGTGCCTATG 1080
ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT TACCTTCCAT 1140
CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT TAACTGGCTA 1200
ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA CAGACACTTG 1260
CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG 1320
GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC 1380
TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT 1440
CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA 1500
CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT 1560
ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT 1620
GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT 1680
CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT 1740
TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA 1800
GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT 1860
CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG 1920
TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA 1980
ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT 2040
ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT 2100
CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT 2160
AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT 2220
ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG 2280
TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA 2340
TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC 2400
CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC 2460
TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT 2520
CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA 2580
GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT 2640
GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2670