EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM057-07055 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_R1 
Coordinate
chr4:140258350-140262380 
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr4:140261309-140261326CGCACTAATTAAAACTT+6.05
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:140261095-140261113CCCTCCCTCCCTCCCTCC-6.03
EsrraMA0592.2chr4:140260229-140260240TTCAAGGTCAA+6.14
GLIS1MA0735.1chr4:140258814-140258830CGACCCCCCGCGGAGC+6.11
GLIS2MA0736.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+7.73
GLIS3MA0737.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+6.08
KLF16MA0741.1chr4:140258656-140258667GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr4:140258406-140258416GCCCCGCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr4:140258657-140258667GGGGCGGGGC-6.02
RREB1MA0073.1chr4:140262130-140262150TCCCACCCCACCCCCACCCC+6.75
SP1MA0079.4chr4:140258655-140258670GGGGGGCGGGGCCTG-6.65
SP2MA0516.2chr4:140258654-140258671GGGGGGGCGGGGCCTGG-6.26
SP3MA0746.2chr4:140258655-140258668GGGGGGCGGGGCC-6.11
SP4MA0685.1chr4:140258653-140258670CGGGGGGGCGGGGCCTG-6.47
ZEB1MA0103.3chr4:140261910-140261921CCCACCTGCCC+6.14
ZIC1MA0696.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+6.65
ZIC3MA0697.1chr4:140258815-140258830GACCCCCCGCGGAGC+7.03
ZIC4MA0751.1chr4:140258815-140258830GACCCCCCGCGGAGC+7.37
ZNF263MA0528.1chr4:140258535-140258556CCCCTCCTCCCCCCCACCCCC-6.09
ZNF263MA0528.1chr4:140261087-140261108GCTTTTTCCCCTCCCTCCCTC-6.12
ZNF263MA0528.1chr4:140259033-140259054CCCTCTACCCCCTCCGCCTCT-6.26
ZNF263MA0528.1chr4:140261930-140261951GGAGAAGGAAGGGAAAGTAGG+6.33
ZNF263MA0528.1chr4:140258527-140258548CGTCCACCCCCCTCCTCCCCC-6.33
ZNF263MA0528.1chr4:140261091-140261112TTTCCCCTCCCTCCCTCCCTC-7.02
ZNF263MA0528.1chr4:140261095-140261116CCCTCCCTCCCTCCCTCCACC-8.03
ZfxMA0146.2chr4:140258656-140258670GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_06341chr4:140258775-140260632E14.5_Liver
mSE_09854chr4:140258736-140259613MEF
mSE_10193chr4:140258722-140259716Embryonic_stem_cells
mSE_10193chr4:140259772-140261059Embryonic_stem_cells
mSE_10193chr4:140261216-140262729Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
GTGAGTGGGG CGGGGGCGGT TGGCGGTTTT GGGGGGGAGG GGCGCCGTGG GGTCACGCCC 60
CGCCCCTCCC CCACGCCGCG CGGGGGAACT CCGGGGAGCC AGTCCCGGGC CGGGGGAGGG 120
GGGGGACCGG GTGTGCGCGG CCACGCGGGG GCTGTCAGTC CCTCCTTCCC CCCCGTGCGT 180
CCACCCCCCT CCTCCCCCCC ACCCCCGCGT CTCTTCCTCC CCCCGAGGGG GGAGGGCAGT 240
CCGCGGGGAG CAGCCGGCTC GCGCCGGGGC TTTGAGGTTC CCGCCGCTGC GGCTCGGGCG 300
CCCCGGGGGG GCGGGGCCTG GCGCGCGGCG CGCATGCTCC GTGTTAGCCC GGCGCGGTCG 360
GCCCGGCCGG TGCGCGCGGG GCATGGTGGG GGCCCGCGCG GCGCGGCCGT GAGCGCGCAT 420
GCTCCTCGGA GGCCCTCCCC ACCCCGGGGC TCCCCTCCCA CCCGCGACCC CCCGCGGAGC 480
GGCGCTGGGC TTTGTCTGCC TCGGGTCCTC GCGGCGTGGG GGCCAGTGGG GTCGGTGCTC 540
CCCTGAGGCT CCGGTCTGGG CCGTGGAACT TGAGCTTTCG CGGGGGCGGG GGTGGTGGTG 600
GAGAGGAAGC CCCGCAGAGC CGGGCCCAGG GTCCGCTTGA GTCTCCGCCA GAACTTTGTA 660
AAAGCAAGTT TTCGGTGATA CACCCCTCTA CCCCCTCCGC CTCTGTGTCC CGGAGATCAC 720
GTTCTCTGTT AACTCTAAGA AAGAGATGGA GCTTGACCCT CGGGAGAGTG TTGCCCATGT 780
TCCCAAGGGT GTTCTGCAAA AGGTGGCAAG GGCACACTAA GAGGGGTAGA AGAGTCCTAA 840
CCATCTTGCA GTAGAAGAAA GGTTCCCGCT AGGCATGCAG AGGGGCCCTG CATGAGGTAG 900
GCTCGCCAGG TAGACCGGTC TTAGCCAGAG TATTGGAAGG GTAACTCACA AGCTGCTCTA 960
TTTATTGCCT AGTGGGTTTG GACAAGGCTA AGAAGTTGGG CATGATAGGG TCTTTTCTCT 1020
GCTGCATCGG GTTGTCCTGA AGTTTAGGAA AGCCATGTGG AGTTGGATTA TTTTGTGAGT 1080
AGGAAAAAAA AAATCAGTAA GACAATGACT GCTCGTAGGG GTGGCAGAGG GAAGGCATTT 1140
ATTGTGGATT AAACAGAGAC ACAGGCAGGG ACATCAGAGA AGTCTGACCC TTGGGGGGAG 1200
TGAGGATAGG AACCAGGTGC AGGAGCCGCC CGAGTAAAAG AGGGGACCAA AATGGTCGGG 1260
TTATATAGAG AAGAGTAGGT AGGGGGAGAG GGTAGCTTAG CCTGTGGGCT GGATTAAGTT 1320
TAGGGTAAGG GGCGGGGGTA TATCTGCCTG GAGTGTCCGG TAACAGGTAC TGTGAGGGAT 1380
GCCGGGAGAT CCTAGTTACC AGTTCTGCTT TGATATGTTA AATAGTCCCC TCCGCTCTTT 1440
GTCCTGGTTT TGAGACTTCT GCCAGGGCCT GGTGAGTTCC AGGGTCTGCA GGCTGTTAAC 1500
CCTCTCAGGG ATGCACGTGA GTGGAGTGGA GGAGGGGCTC AGAGGCCTCT ATCTCCAAGG 1560
GTCTTGTATC AGAATTGGCA CCTTGTGTGC TATGAGGAGA TGCCATGTCT GAGAGGAGGC 1620
AGTCCCCTGT AGTTTGTGCT TGTTCTGTGT GTACAGCTAA CTTCCCATAT CTGTGTAGAA 1680
CCGGAGCTTA AAAAGGGCTT TGTGTCCATC CCCTTAAAGC TAGGGGGACT ATCACTGTAG 1740
AACCGACCCC TCAGTGGTCA GTTAGGGGGT GGTTGGATAA GTGAACCCAG GGGCCTCTGG 1800
GGACTTAACT TTCTCGCTGT TACACCTGGG AAGTGTGTGC TTCCAGCTTC TGCCCCTGTT 1860
AGGGTCAGGT TGAGTTTGGT TCAAGGTCAA GAACACAGCC TTGCAGCCTA GGCTGGCAGA 1920
CTGCCCAGTG TCTCTGGCCT AAGGGCTGTG GTCTCCCTCT GCTAGGCAGA CACAGGACTG 1980
TCTCTGCAGT CGGCCACTAT CCTGGATATT TCAGAAAGCT ACTTAACTCG GCAGAGACCA 2040
GCCTCTCCCC TGAGGGAGGC TCCTCTGCCA GTGTCTGGGC CTCCTGCCTT CACTTTTCCC 2100
TTACCTTGAA CTTGAAGTTG TCTTGGGCTT GGGAAGATGA GCCATGTGTT CTGTTGAGTT 2160
GTCCTGCTAG AGTTAGGTGG GTTAGGAAAA TCAAACAGTA GTCCTTAAGA GTCGATGTGT 2220
GGAAAACGAG CCTTCAGTCT TGTCCTATGA TATTCAAGGA CCTGAGGCTC AGGCGCAGGC 2280
ATCCAGCTCT GTGTGTTAAA TCGGGGTTGC TAGGGTTTCA CGGACCCTGC AACATAGTGT 2340
TGGTTCTTAG TGCAGTGGGA GGAGGGTTGG TAGGGATGGT TGTTGCCAGC CTCTTGCTCC 2400
CTGGTTCTCC TAGTCCCTGA GCATCAGTCT CCTAAATGGA TGTGTTTAAA GGTGGACTCT 2460
CGGCCTCACT CAGGGAGTGT ATGTACTTGG GTGGTAAGTC AGAAACTGCG GTGGCCAGGA 2520
AGCCCCCGTT TGCTGATTGG AGACACTTGG TGCATTTTCT GCCTTGGCCA CTCATCTGCA 2580
TTCAGGTCAC ATTCAGGTGA CCTGTCCTGG AGAGGTAGCT AGGTGAGGTT GAGTTCACCC 2640
GACCTGGACT GTTGGTTGGG GTACAAGTGT AGGCTGTCAG ACAGATGCAG TCATGTCCAG 2700
GCTGAGTTAG CCCCGGAGAG CAGGAAGACC TCTGCTTGCT TTTTCCCCTC CCTCCCTCCC 2760
TCCACCTGTC CATTCCTCCG TCCTTTTGAT GCTGGGGACT GAACCCAGGG CTAAGCACAA 2820
GCTCTTGCAC TGAGCCCCCA TTTGTTCACT GGGATGGCCT CTCCCCCCAT TAAGGCCAGC 2880
AGGCTTATGG GATATGTTGT TGATAGTCTG TGGATGAGGG GTTTGTTTGG ACAGGGGCTT 2940
GACTGAAAGT GAGTTGAATC GCACTAATTA AAACTTTGTA TTCCATAAGG AGGGGAGAGT 3000
AAGTAAGCTG TAGAGGGGTG AACAGTTGAG TTAATAGCAA ACGGGGTGTA GGTGCTCGCA 3060
GTGGATACGG TGAGCTGTGA GAATGGGGTT TGTGATGGAG AAGCTGGGGC CAGGGTAGCA 3120
GTTAGTGTTC TTGGGAAGCC AGGCAAGGTT GTCCACAGGT CTCTTTTTCC GAAGGGTGGG 3180
ACTTTCGAGT CCCTGTCTAT CAGCCATCGC GAGTTTGAGG AGCCACAGGG ATGGCAGTGG 3240
ATATTGGCTA CCAGCATTCT GCACCCTGCA TCCTGCCCAA GCCCGTGGCC TGGTGGCGCT 3300
CTGGGATCGG AGTGACCACA TCTCGGTGTT GGTGAAGGTC GAGCTTGGGA ACCTCCCAGC 3360
TTCTCTCCCC TCAGAACCTG CTAGCGCAGC GCTGTTGGGC CTGGGCTTGT GCTGGTTTTG 3420
AGGCCTCTCC CCTATGTTTC TGGGGCCCCT TCAAAGTGCA GACCTGAAGA GTAGAGTGAA 3480
TGTATGTGTC CGTGCACAAG TAAGTGTTGG CCCTACTGCG GGCCCAGTGC CATGGGCTGA 3540
GCCTGGTAGG ATATTCCAGC CCCACCTGCC CTTCAACAAA GGAGAAGGAA GGGAAAGTAG 3600
GCTTCCATCC CGTTCAGGTA ACTTGAGTCT GGCCCCACAC CCCACAGGAG GTCTGAATAA 3660
TTGAACTGGG TGGCTACTCC ATCCTTGTGA GGCCTGGGTT GGCCAGGCAG GTCCTGAAGC 3720
TTGATCCTGG CCTCTGCCTT TTGGACCTGA CTGGAAGTAG GGGACACCGG GGAGATCAGG 3780
TCCCACCCCA CCCCCACCCC CCCAAAAAAG TGTGCCTGCT GGGGACTTGT AGGATGCATT 3840
GGGTGTGTTG GGACAGCCAG CCAGGGGCCA TTGTGGGGTG GAAACTATTG GAGCTGCGGC 3900
CACTGTTCAG GGGCAGGCGC ACAGATTGAG CCTAGCAGCC CGTTTATTTA TCTGCTTTTA 3960
TTTATCATGT GTTTGCTTAC TGTTCTGGGG ATGGAACCTA AGCTTACTCT GCCCAGGCTA 4020
GACCTAATTA 4030