EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM056-00107 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_R 
Coordinate
chr1:53007990-53009450 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:53008311-53008332GCTTTCTTTCTTTTTCTTTTC+6.23
IRF1MA0050.2chr1:53008676-53008697AAAGAAAAAAAGAAAGAAAAG-6.5
NFYAMA0060.3chr1:53008544-53008555GGCCAATCAGA+6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:53009401-53009416AAAGTCAAAAGGTCA+7.1
RarbMA0857.1chr1:53009400-53009416GAAAGTCAAAAGGTCA+6.99
TFAP2A(var.2)MA0810.1chr1:53008599-53008611TGCCTGAGGGCA-6.32
Enhancer Sequence
GTTTAAAGTA ATATAAACCA AGAGAGAAAG CGTTCCCCCT CAAAACCACC AAGCTGCACA 60
GATTAAAGAG GAAGAAAGTC AGCTTGACAA CAACAGGGAC GTATGAGTTT TTAGTCAAGC 120
TCAGAGTATT TGCTTGATGG TTTCAGGATA AGCTGATGTG TTTAACTCGA GTTTGGTTAC 180
TCATTAAAGA AAAGTAAAAC ATTCTGTCTC CCGAGCACCT GTATGCACTG TGTGGGTTAA 240
CAGTTTCATC CTTACAGCAG CCAGCTAAAG CAGACAGAAA CTCTATCACC ACACATCTTT 300
CCTTTCTCTA CTGTCTTCTC TGCTTTCTTT CTTTTTCTTT TCTTTACTTT TTTTTAGGGA 360
GTGAGCTCCA AATTTAAAGT TTTAGACTTT CTTTTCAAAG AGAAGTAGAC ATCCTGAATG 420
TAATCTTGGA AGTTGAAAGG TTGTTGGCTG GGGCAGGACT GAGGAGACAC AAGCAGAAGT 480
CAGCTCAGTG TAAACACGGC TTTTCTGACA GGAGCAGGAT ATAACTCCAA ACACTGAGTT 540
CCTCACACTG AAGTGGCCAA TCAGAACCTG GCTTCTGGCA GCAGTGCTGT GTGGACAGCA 600
TACTGAAATT GCCTGAGGGC AGACCACAGT TTAAAGTACC CTTATTATCT CATAATGTAC 660
CTACAGTTAT TTTTCTTACA CAGCAAAAAG AAAAAAAGAA AGAAAAGAGT AAATATGAAG 720
TTACTATTTT TCCCAGAACC TTTCTGCTAT ACTTAATACC ATTTCCCATC CATACATACA 780
AGATAGCTGT GTCAGGAAAT AAAACCCCTT TCAAAGGAAA AACGGATTTT CTTGACTCGT 840
GCTTAGCTAT ATTATCCCCC TGAAATTTTG CCAAAAATCT CCATCTCATA TATACGGGCA 900
GTGACGGATC TTTAAAAAGA GGTGGACAGT TTACCCACTA GTTTATGTTG TTTTGTTACC 960
TTCAGTAAAA GATGGGGGAG GGGTCAAAAC AGCAATAGAA GAGAAACGAC TGGACTGCGT 1020
CTGGAGCTTT CTCTGGTAGC TGGGCTCCCA CTGTCTATTC TTTCATTTCT CTTTCATTTG 1080
CATCATTTCC CCTCAGGATT CAGCCTCCCA CAGCTTCCAA GAGTACAGAC ACTCTGCTAA 1140
TCATGTGCCA CTCAGCACAA GCCTGACAGC TTGACTTGTG CATGTAGTGT CCTTACCGGA 1200
AAACCTCCAT TCATTCTTCA GGTGGGGAGG AGGATGAACC TGCATCTTGC AATGAGCAAT 1260
GAAATACTTT AGTTTGTGGG CTCGGAACAA GATCAGAAGA TGGAGCTAAA GGCTCAATTA 1320
AGGAACCTAG GATGTGAGGT TGTGTCCAGG ACAGCTGGCT GTGAAATGTT AGATAAAATT 1380
AACTACTGCA ACTCCGGCTT TCCTGGGTTG GAAAGTCAAA AGGTCACAGC ATCGGAGCAG 1440
GACACCCACC TTCCAGATGT 1460