EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM055-03890 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_NPC 
Coordinate
chr4:88581580-88584740 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr4:88582078-88582090GTTTGTTTGTTT+6.32
KLF5MA0599.1chr4:88584415-88584425GCCCCGCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr4:88584426-88584436GCCCCGCCCC+6.02
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03166chr4:88574471-88588217TACs
mSE_09506chr4:88579660-88582260MEF
mSE_09506chr4:88582781-88585193MEF
Enhancer Sequence
CATAGTATGA GCATTGGCAG TCATGTACAT TGCATTTTCC CTGCTAAAAG TGTAGTTTTA 60
AATTACTAGG ACAATTATTG TTTTGCTCAG AAGATTGGTG CTATTTGGGA TATTAAAATA 120
ATGGTGTCTC AAAAGAGTAT TTCTCTGAAA ATAGAAATCA CCTAGCGAAT TCTCTGTAAT 180
CTGCAAGTTG GCTTCAAGTG CTCAGTAGCT AGGATCGGCT AGAAAATACG AAACAGAACA 240
TACTTGATAA AGCCAGAATC AGGGTTTCAA GGTTATTGGA AGAGGACTTT CCCCCCTCTG 300
CTGTCATGCA TGCAATAACT GTATATTGCT TAAAATGTTA ATCCCAGGAA AAGCAGAAGG 360
TCCTAGAGAA TGAATCTACA AGTAAATCTT GACCCTACAC TCTACCTTTT AACCTCCTTA 420
CTCCTGAAGT CAACACAGAT TTCCCCCACA CCCATGTGCA ATGGAAAGCT TCCTCCATCA 480
TCTCCAACCT CCTCCCAAGT TTGTTTGTTT TTTTTTTTGT TGTTGTTGTT TTGTTTTTTT 540
AAGCCTGGAG TGAAAGACAG CCGGAGACTC TACAAATGAA GCAAGCACAT TAGGGTACTT 600
ACATGTACAG ATTAAATAAC TGATCTACTT TCTATACAAT TTACTGTCAT TGTTTAAAAG 660
CCCCCAGTGA AAATGTAGCT CAAAATGCAA AGATCAAATT TCACCATTTC TTTTACTTAA 720
GCTGCATCTA TTCTAGATTC AACAAAAGTT TTTTTTTCCC TACATTGCAG AACTATGTAA 780
TAACAAAATT TATCACTCAT TAAAACTTTT GAGACATTTG GGGGTTACTT TTTAAGCAAC 840
TAGTTATTAA ATATATCAAG AAGATGTTTT AAAGCATTAT TACTAGCCCT TTCTTGTTTA 900
TGATTAGAGA ATTATCTATC CTAAAATGCC TTCAAATTCC ATATTGTCTT TTAATACTAT 960
ATTTTATCCC TTAAATGTTA GTAATCAGAG GTTACATTTT CGCCTTTTTA CGTTTAAAGT 1020
TAAGAGCCCC CACAATGTTC AAATGATAAA AATACTTAGA CACAAGTAAT GCAATTGTGG 1080
CAATTACGAA GAATTTAATG TTTTCTAATC TCAAGGCGTC AATATTCCCA GCAAAACACA 1140
TTTAACAAAA ACCTATCACT GAAGAAAATT ATTGTTAAAA CAAATCAATT AATGTTCTAT 1200
AAGTACCCTA AATAGTTAAC AACGGTATTT AATATAGCTT CAGTTCTGGG GCAAATCAAG 1260
AAAAATGATT TCAAAATGAG GGGAAAATGA TACACATTTC TTGTTCTCCA TTTTTTTCCA 1320
CTTCCATTTT TATAAAGATA TTCAAATAGT AGATGTCTCA TAGCTTTCGT CCTATAATAA 1380
CCTATTTAAA ACAAGCCGAG TCCACACTGT CCGTCAAGGA TTTAGTCACT ACTATGTACT 1440
CTTCAGAATT TATAAAACTT CAAGAGCCTT CTAGGCTCTT CTAGCTTTCA GGCTTCTTGC 1500
TCTCTCTCAC ATCAACCATG AAGGCAATAC CTACGTATAA AATAAAGACC TAATATGATG 1560
TAAAAGAAAA GTTTCCAGAA GGCCCACCCC ACCTCCAAAA AAAAGTCTAT TAAACACGAA 1620
TCAAAAATGC CTATTTGGGG ACCCAACCTA GTTTTCAAGA GGCCCTGTAC AAGTTACAAA 1680
GGAGAAAGGA AGCGAACTAT ATTACTTCCT TGGTGGGGGA CAACCGCACA ATATTATTTT 1740
AAGCCTTTTT TTTTTTGATG ATAAAAATCA AAATAAAATA CCTACGGAAC TGCCTCTGGA 1800
GATACTGAAC AATAACCAGA ATGACAGTGG GAAACAACTT AAAAAGTTAG CTCCCCTCCA 1860
ACCAAACACG AGAAACTCAA TAAACCTAAA GTCGAGCGTC ACTTTTAAAT CACTTAAAAC 1920
AAAAATCAAG TCAACCAAAA CTTTCTCAAA ACAAATGATA AAACTGAGCA TTGTCGAAAC 1980
TCCCGTTCAC CAAGTATTTT AATCCACAGG TAATAAACTC CCGCAAAATA AATAAATAAA 2040
TAAAAATAAA AAATTCGTGC CTACTTCCCC CTCTAATTCC ACTTCAAAGG TGCCAGGATT 2100
TCAATGAGGA AGCTGAAAGA CGGGATTCGG ATTCCAGAAG CAGTCCCCAG GCAGGAGGGC 2160
CACAGCTCCA ACCCTTGGTG CAGGTTGTGA GCCCCATTGC CTGTCCCTGT CCTTTAGCTC 2220
TTTAGGAGGC CACCTAAGCT TGTTTCGCTG CTCCCTACGC GGCCACTGCC TGGCTGAGGA 2280
AACCCTGCAG CAGCCGAGGA GCCGGCCCTT CCAAGGGAGG GTCACGGAGA GAAGGGGCAG 2340
GAGCTGACGA ACATCCTTCA TCCTTTTTCC ACCATACGAG TACGAACTGA AAACAAGCGA 2400
ATCCTCGGCT GTGGGGGTTC TCACCGCACG CCTCGTTTCT GTGCACTCCA CCGGAGAAGC 2460
CCCCGGGAAG TTTCCAAAGC ACCCAGAGTT TGAAATGGTG CGTGGGCAAC GCGGGGACTC 2520
CCCAGCGGAG AGCGCTCCAG CACGCACGCC GCGCTCTGCT TCCCTGCGCG CTCGAGGATC 2580
GCGCGCGGCC CGAGCGTGTG GCCGAGCGCG GGTGGCTGTG CGGGACCGCG CCTCCGCTCC 2640
CCACGCGCGC CGCCGAGCCG CCTCGTCCCT CGGCTCCCAC CAACCCCAGG GTGGCTCGCC 2700
GCGCGCCCGG GCCCGCTTAC CTGCGGCCTC CACGCACCCC GCGCGCGCCT CTGCGTCCCG 2760
CGTTGTGCGC AGGTCGAAAG AAAGCGCCGC GGGCTGTGCC ACCTCCGCGC GCCCACACCT 2820
GCCGCGCGGC CCGACGCCCC GCCCCGGCCC CGCCCCGACG GGACCGGCCG CGCCTCCGCC 2880
CGGCCAGCAC CAGCTGCAGC CGGCGCAGCT CCCGAGCGCC GCGGCTAGGC AAGGTTCGCG 2940
ACAGTCACCG CTGGGGCGGC AGCCACCGCG TGGCAACCTG CGCGAGCCCC GGCATTCTTG 3000
ACCAGCAGGC CAGCGGCGAT GCTGGCAGGG GTCTTCAGAA ACCCTGGCGA CTGGTGCAGC 3060
CCAGGGATCC AATGGCGTTC AAGCCGGAGG GGAGCTCTCC CATCCCTGGC ATCCTGGTCT 3120
TGGCTGCCTT GAGGCCTTCC TGGACGTTTT TTTTCTGTAC 3160