EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM055-01719 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_NPC 
Coordinate
chr13:78346270-78350280 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr13:78347385-78347396CTTTCCCGCCC-6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr13:78347601-78347619GGAAAGAAGGAAGAAAAA+6.33
IRF1MA0050.2chr13:78346816-78346837CTTTACTTTCAATTTCTCTTG+6.9
Nr5a2MA0505.1chr13:78348046-78348061ACTGACCTTGAAGTT-6.49
PHOX2AMA0713.1chr13:78348730-78348741TAATTGGATTA-6.02
Phox2bMA0681.1chr13:78348730-78348741TAATTGGATTA-6.02
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04044chr13:78346204-78346959Cortex
mSE_04044chr13:78346991-78351730Cortex
mSE_04389chr13:78347910-78350119E14.5_Brain
mSE_11060chr13:78348481-78350286Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GAAAGGGATG AGGCGGTCAC TTGAAATCTC CTTTTATCTA CTCTTATTTT CTCTCTGGAT 60
CAGCAACTTT GAATAGACAT CATCTAATCG CTCTTAATGG AAAGAAACTA CGGGAGCAAC 120
ACAAATGCCT TTGCTCCAGA AGCGAATACA CGCCTGTGGC AGCTAGCTGA GCTTACATAG 180
GACTGCATCT CTGCATACAT GAGCTTAGGG CATGGGGGGG GGGAGCAAAT GCACACTATA 240
TGTATGTGTC TCATACGCTG AGGGATTCTG TTGCTCTTCG TGTATATGTG TGTACAACAC 300
ATGCACATTT TAATTGGAGA GCACATTGGG TGATACTTTT AACTGGTCTT CCCTTAAGCT 360
TTTCCTTGCA CTCAATTTCT GGCCACATTT CAGCATTATA AAAGCACAAG TCCATGAGAA 420
CTCAATTGTC AGCCTTTAAA AAAAAAGTCA CCTTATTTCC TTTCTGTTTT CAGGCAGAAG 480
TCATCTAGTA GAAAGGTTTC TCCTAGAGTG AGGCTGCTCT GACAGCCGGG ATGCAGTGGT 540
ACCAAGCTTT ACTTTCAATT TCTCTTGCTT CAAATTCGAT TAGACAATAA ATAAGTGGGA 600
AGCAGGAGCC CAACTCAAAG TTGCTTAAAA CTTTTTCCTC CTTTACATTT ATATCTCTAA 660
ATCCTTGAAA CTGATAATTG TTTACAAATT ATTATTTTGA AATTAGAAAT ATTTTAGTAA 720
GACTCAGACT GACTCAAATA GGACTCAGTG TGCCTTCCTT TTGGTTTGCT ACATTTACTT 780
TTAAAAAGAA ATATGAATAG CTATCCAGAA AGGGACATTT GCTTCCTAGG ACTGAAAGCA 840
ATGGCCCTTT CCCCTTCTTA GGAAGCACCC CCTTCATGTT CTTCTAAGCA GAATTCTAAG 900
CCGAGGACAC TGCTATAAAT TCCATTAGGG GAAGGCTCTG TTACCAGGGC TACAGGTTCT 960
CATGTCAACC TGCCAGCCTC TCTGCTCCCT GATATAGATA CCCTTGGCTG TAGAGGCTGG 1020
GAGCTCCAGC GGCCCTTCTG CTACCGGCCT GCTGAGATTG CAGCTCAAAA GTTGGAGGCT 1080
GGGTGGGGGC AGAATAATCT CTCTTTAACG CCTCTCTTTC CCGCCCAGGA TTTTGAACCC 1140
CAACTGACAT ATTTCCTCGG GTTTTTCTGA TGAATAGAAG CACAGGAGCA ACCCTGTCCA 1200
CTAAAGATTA AATGAAGTAG AAGAAGCTTA GCCGTGGATA CTTGGAAGTA CTGGTGGGGT 1260
GTCAAACCAA CGTTTAACAC ATTGTTTCCA CTCAATGTGC ATATATCCTG GACCGATTGG 1320
GTTTAATTTC AGGAAAGAAG GAAGAAAAAG ATCGAGCAAG GAAAAAAGGT GAAAGGGAAA 1380
ATGACAAAGA AAAGAAAGTT AAACTTATGA AGAAATCCCA TTTTCAAGGG GGAAGTAGCT 1440
TTATGCTAAG AGTGGTCGGG GTCAGTAGCC AGGCATCCTG ACCTTTCTGG CCTTTTCTTT 1500
CCTGGAGTCA CTTTGGGAAT TAGAAGCCGA TTCTCTCAGA TGAGGACTCA GGGCTCTTCT 1560
TGGGTGGGTG CTATTTGATT TACATTTACT TCTTAGGGAC AGTAGGGGAG GTCCTGGGTG 1620
GCTGTGAAAT TCAGAACCCA CTTGCTTCCT CTTCATTTTG ATTTAAAAAA AATAAATGGA 1680
AGGTTTTGGT AGCCCAGACT GACGCTTTTC TCTTATTACT TACTGCTCTG GAGAAGAAGC 1740
AACAATTTTT CTCTGTAGAT ATTCAGCTTG ATGGACACTG ACCTTGAAGT TTCGACTGGA 1800
TAAGGCACCC TCCCTCACAT CCTGGCCCCC AAATATCACC TGTTTACGCC CCTCCCACCT 1860
GCTCCTTTAG TTCCTGGGTG CAGTCCAGAG GGAGCAAACG GCAAGTCCGT TTGTGGCAAA 1920
GACTTGTCCA CGCAAATTCA ACATTGAATA AATTAACCTC AAACCAGCAA GTTGGGGTGT 1980
AGTAGTTTAG CAGGACTAAT TGCAGACAAT GTAGCTGAAA TGACTTTTCC AATTAGCTGC 2040
TGGTTGGAGT TTAGTCGGAG GAACTGTCAG CTCCAACGAT GGGTAATTGC TTTATTGCTC 2100
ACAAAACTAT CATCTATTTA GAACATATGT GCTAATTACT CTGGATGGGC GTCGACAAAG 2160
AGACCATAAA TCTAATAGCA CTTTAAAAAG TCTACAGTGT TTGTAAGTAA CCCTAGTCCT 2220
TTCACTCTGT GATGGGGCCT AGGTTAGTGT GGCAGATGAT TCTGGAAGGC TCAGGTTGGA 2280
CTGGAGACAC CAACGCCAAC CGGTGCTCTG GTCAAACTGC ATATGAAGAG CAAACGTCCT 2340
CTGCTTGCGT TCAGTGTGAA GGAGATAAAT CACTATCATC ACCACCAGAC TCCCCACCCC 2400
CTTAACCGTA CATCTTTTAA GTTTTTTTTT TCTCCGTAAA AGATTAGTTT AGAAATCTTT 2460
TAATTGGATT ATGTTGGGAA ATTAATCTCC TTTAGCCTTG GCTTAATTTA TTGTGGATAG 2520
TGTCACGAAA GAAACCTTGT AACTGCAGTA AGGGCCATGT CCCTTTGTTT CTTTCCTTAG 2580
CGCTCCAAGG TCTCCCAGCT GCGGGCGACA GTGGTGCCTT AAAGTGTCTG GACTGAGAAA 2640
GGATGGAAAG ACACATCTGG GTGGAAGGCC ACAGGAGTCC CAAGTCTTTT TCCTTTGTCT 2700
TAAACGCACC CTTCTGTTCC GGATTCTGTA GCTTCAAATC CCCCATCCCC ACTGCACCGC 2760
GCTTTGATCT ACAATTCAGG GGACCTGCTA CCCAGGAAGC AGGTTGGGGA GGCTGGAGGA 2820
GGAAGCGGAG TACCCAGTAG CGGACTTCCA GGCACACTGA CTCCTTTGCT TTCTCTATCG 2880
CAATCTCCTC CTCCTGCATC CCCAGCTGGG AGCCAGCTAT TAACAGATAT TCCCCACCTC 2940
TCTGAGAAAA AAGATAAAAG AAGAAAAAAG AAACCCGTTC AGCTAGCTTT TGGCGTCGTC 3000
CTCTACTCAA CTCTGTAGAC ACTTCTTGAC TTGCACAGAG CTTGAGATGG GCTAGAGTCC 3060
ATTCCTAGCA CCGGCGCGTT GTTTTGGCTG CGACCTCCGG TTCTGCCTCC TCGCTGCGCG 3120
CGGGAAGCCG CGTTCAGCTT GACTAGGGCG GTAGAGGGAA GCGGAGGTAG AGCCCGGCTG 3180
GCCGTGCCTC AGCGGGAGAT AACAACATCT GCCTGAAACG GGATACCTAC TTTTGCAGCT 3240
CAATTTAGCT CTTAATAGCA GTCCTCTGAG GTGTGCTTAA TTGATGGGGA TAAAGGCGTA 3300
ATGACTTGAC AGGGAGACGC CAATGATCCT TTAATATACT TTTAAAAGAA CAACAACCAC 3360
CCCAAACACC CGCGGGTCCT CGCTCGGTAG GGAGTGTGTG GGAGGAGGAA GAGCGGGTCA 3420
GGCTGGGAAA GTGCGCTGAG CTGGTCCTAC CTGGGGAAGC GCCTAAGTGC CCTGGCTCTC 3480
GGGAGCCAGC CGGCGCTCAG GCCAGTCCGG CCCAGTGTTT TCCAGTAGCT GCTGGGAGGG 3540
AAGGGCAGCC TAGTGAGCTA AGGTTGTCAA GTGTGGAAGG TCTGATTGGC AGTGAGGAAG 3600
CTAGAGACCC GGAGATGCTG TCCATTGCTA GGCTCTGGAT TGCCTCACGT CTGCCAGCCT 3660
CCGCAGGCCG GGACGCCCTC CGGTCTGATG CCTGAGTAAG GGTCGAATGT GGGTGCTCTG 3720
CGGGACCTCA CAGAATTCTG TCCTTCGGAT AGCCTTAGAA GGTCTCGAGG AGCACGCGCC 3780
GTGTGAGAGT GCGTGTGTGC GCAAGCCGCC CCCAAATGCA GAGTTGGGAC ACAGCAGCCC 3840
TGAGCACGTC TAGGTCCGGG GCTCCCAGAG CCCTGAGACC AGACACTCGA GAGTTTATCT 3900
GCTCTGGAGG CAGGTCCCAA AGCTGGGTCA AAGCAAACCC TGAGCAGTTT CGGCTTAGGA 3960
CCTCAGCTCA ACTACCCTCT CTTCAGTAGC TTCCCTTTTT TTGGCCCAAT 4010