EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM054-11544 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_KH2 
Coordinate
chr3:89602920-89605210 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr3:89603559-89603570GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr3:89603559-89603569GCCCCGCCCC+6.02
Nr5a2MA0505.1chr3:89605040-89605055GCTGTCCTTGAACTT-7.08
Nr5a2MA0505.1chr3:89605011-89605026GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RREB1MA0073.1chr3:89604869-89604889GGGGGTGGGGTGGGGTGTGT-6.51
RREB1MA0073.1chr3:89604882-89604902GGTGTGTGTGTGTGTGGGGG-6.95
RREB1MA0073.1chr3:89604864-89604884GTTGTGGGGGTGGGGTGGGG-7.13
SOX10MA0442.2chr3:89604632-89604643TCCTTTGTTTT-6.32
SP2MA0516.2chr3:89603555-89603572TTTCGCCCCGCCCCCCC+6.19
SP3MA0746.2chr3:89603558-89603571CGCCCCGCCCCCC+6.11
SP4MA0685.1chr3:89603556-89603573TTCGCCCCGCCCCCCCT+6
Sox3MA0514.1chr3:89604633-89604643CCTTTGTTTT+6.02
Sox3MA0514.1chr3:89604688-89604698CCTTTGTTTT+6.02
ZNF263MA0528.1chr3:89603557-89603578TCGCCCCGCCCCCCCTCCTCC-6.71
Enhancer Sequence
TGCCTCTGCT TTCCAAGTGC TGGGATTAAA GGTGTGAGCC ACCATGCACA ACTTCCACTA 60
TGGAGCCGTG GAAGGCAGCC TATTTTGGTT GAATGAGGCT TGCTCCGGCG ACCCAGTAGA 120
AAACTCTACA AGGAACGGAA CAGTGAGCCA TGTTCCCAGA GACAGGTGCC TGACACCACA 180
GAGCCCCCAA CTCCATAATC CTGTGACTAT AAGTCACAAT GTCCCAACCT CCTGGAATTC 240
TGGCTAGACC CCACCCTCAC AGTTACCTGA CAATAGCCAG GTATGCTCCT CCCCATAGTT 300
ACCTGGCAAC AGCAAGATAG TTCAGCCCAC TATAAGAGGG GCTGCTTGAC CCCCCTCCTT 360
GATCTCTTTA AGCTCTCACC TTTCTTACTC TCATCTCTAG CACTCCTCTC TCTCCTCTCC 420
CCCATCTCTC CATGTGGCCA TGGCCGGCCT CTCCCTCTCT CTTTCTACCT TCTCTCTTTC 480
CCCCTGCCTA CAATAAAGCT CTAAAACCAT AGACTGTCTC TGCTCATCAA GGCCCACGCT 540
ACTTGAACGA TGGGATAGGC TTTCCCCTGA CAGATGTGGT CTAATCTCCT GCCTGAAGGC 600
CTTCCTGCGC TCCAGTCACA GACCGGACCA AGAACTTTCG CCCCGCCCCC CCTCCTCCCT 660
TCGGCCCTGG GGATGACCGA GCCACTCCCG GGGGGCCCCC ATTTGTTCTC AGCTCTTCTG 720
TGGTGTCCAG CGGGGTCTGG GATGCCCGAG ACTGAGAACC TGTTATCTAG GACTGCTCCT 780
TGTCCACCAC CCCTGCTGAG CTAGAGTCCT GTGGCTTCCC ACAGCCAGAC CCCCCCACCC 840
GGGACCTCAT GGAAAGCATG CAGCAGTTCT TCCGTATCTG CGTGCCCAGA GCACCGGAAC 900
TCTGGAAGCA CTCACAAGGC AAAGAGTTTC AAGGAAACTC AACCTCCTGG AACCTTGGCA 960
TTCTCATAAC CTGTATATTC ATTCATACCC TATCCCCGCG TTTGTCTGGT GTATGGATGC 1020
ACGTGCTCTC TTTTAGTATT ATTTTATTAT AAGTGCCTTT AAAGATTGAA TTCTGACATA 1080
GCTAAGCCTT CGCCAGTGTT CCAACGTCCC AGAAAATCCT TGAAGCGGAC AAACTTGGAA 1140
TTCAGTAAGA AGGTTACCTA TTCTGTAACA TTCAAATTTA CTCCTAGTAG AGATGGTGAA 1200
ACTAATTAGG CATTACAAAG AACAGAGCTA GAATAGCTCC AGGGCTGGTC TGCAGGGTGA 1260
TTACTTAGGA CAGTAGCCAG TCTCATCCAG ACAAGGGAAT ACACAATGGT CTAGCTAATA 1320
GGTGGGTTTA ACATGTAAGA GTTAGGGACT CCCACTGAGA CAGGAATCTT CACTACAGCC 1380
AGGTATAGCA GGCTACACTG CATGTTAGAA GCAAGTTGGT GAATTCTTCT GACAAATGGA 1440
GATTCTCCAC AGATACTTAA AACAACAGCC AAGTTAAACT GATACAAGAA TTTACCAAGG 1500
CCTAGGAAAT AGGGGGTTTG TAGTGTTACA TTATTCATGA GAAGGTCTGC TAGAGCAGAA 1560
TCCCCTGGTG CAAGCTTTCA CAAGGCTCAA AGGAGTAGCA CAAATTGTGA CTAGGGTGTG 1620
AAATCCTTAC CTGTCATTAG CTGACCCTAG ACAGGGCTGT TTTATCTTTA CTGTAAACAT 1680
TACCTGGTTC CTGGAAGTCC TTTTGAAGTC ATTCCTTTGT TTTGTGTCAG GTAACTTCAA 1740
TGTGCTTTGC CTGCTGTGAC ATCCTACCCC TTTGTTTTCT GTATTATATA AGACTGGTGT 1800
TCACTTTGTG ACAATACATT CAGATTCTAC ACAACCTCTT GTGTTGATTT TTGTCTGTCA 1860
TTTGTTGACT CCTTGTCCAC ATGTAACCAG AGACCGGTTC TACGCAGACA GGGACCAAAA 1920
AGGGTCTGCG GCACTTGTGT GAGTGTTGTG GGGGTGGGGT GGGGTGTGTG TGTGTGTGGG 1980
GGGTGTAAAA CCCAGGGACT TCCCAGAACA TTCCAAAGCA AAACTCAATC CCTGAGAGGC 2040
ACCCTCAGCC TTTCCCCTTT TTTTGTGATA AGGTCTTACT AAGTGGTCCA GGCTGGCCTT 2100
GAACTCCTTC TGCAGCTAAA GCTGTCCTTG AACTTGTGCT TCTCTTGCCA TAGCCTCTTA 2160
CGTAGCTAGC ATTATAGTCC TGTACCCAAG CACAGCTTAT AACATAATTT TTTAATTTTT 2220
TCAAACAAAA CCATTTTCAA TAGCATCATT ACTTCTCTCT TTGAATTTAT ATCTTATTTG 2280
TTAATCTACT 2290