EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM054-11442 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_KH2 
Coordinate
chr3:88032670-88036890 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr5a2MA0505.1chr3:88033516-88033531GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RREB1MA0073.1chr3:88036243-88036263CCCCCACCCCACCCCCCACC+6.64
RREB1MA0073.1chr3:88036244-88036264CCCCACCCCACCCCCCACCA+8.54
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03757chr3:88031759-88033594Cerebellum
mSE_04018chr3:88032095-88033391Cortex
mSE_04018chr3:88033723-88035495Cortex
mSE_04384chr3:88031326-88038230E14.5_Brain
mSE_10788chr3:88033557-88035082Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
TTCTGGAGTT CTCTTAGACA GTAAGGCTGA AGAGAAGCTT GGTACAGGAA CTTCGAAGGT 60
TTCTCAAGCT GCAGGTCATG GCTACCTGTG TTTCTTAGCA CTGGCCTTGA CTTGGCTACC 120
ACAGGCTTTT GTCTCAGTTT ATCTGCCCTG GCTGAAACCC AAATGATCCT GTCTCCAGCT 180
CCATAAGAGC AATCAGAGGT CCCCCAAAAT CTCTGTCTGC TCCCTAGAGT CATGGGCTGC 240
TTCTTGTTCT GTGCTCCACA CAGGCTTCCC TCCCTCCCAG TGCTGATTTC CTGTGGACCA 300
GATTCCAGCA CAGTGGAGGG CCAGAGCTCA GGGAACAGAC CCAGCAGCAC AGCAAGTCTC 360
CAAGGAAAGC TCTAGCAGTC TCCAGGGGCT GAAGGCAGGA CTGGGGAAGC GGCTAGCCAG 420
GCTGCAGAAG GCAAATGCTC CCAGACGGCT GTCCAGCACG CATCCGCCTT CCTAGCCAAG 480
TTTCCTGGGC TCCTGCCACA GATCTAAGCC TCATCCTGAC ATCCTGCCCT CTGTGCTCTG 540
GGATGGCCCA GGGGAGATGC TTAGCCTTGG CTCCTTGTCT GCTGGTGGAG GGGACACACA 600
CCCTTTCTGG ACCACAGGTA ACTTTTCTTC TGTCTACTCC TAACAGATCT CCAGAGTACT 660
TTTATTCATA AGTATGTGTT GAATGTCAGT GTGCATATTG TGTATATATG TTTGAGTATG 720
TTATCTTGTG AGTATAAGCG TGCATACATG TTTGAGTGTG TATCTGAGAG ATCGTGTGTG 780
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGGTGTCTTG AAATAAAGTC CTGTTGTGTG 840
GTTCAGGCTG GCCTTGAACT CAGAGCACTC CTCCTATGAT TCCCCTATGC TGGGATAACA 900
GGCCTTTTCC CCACACTTGA CAATTTCTCT TTACAGACCA AAAAGAAGAC CTGACGTCAT 960
CCTGAGCACC CCCGCCATGC AGAGTGTGTT CGCAGACTGC CAACGGGCTG GCTCCGGCCA 1020
GCAGAAGTGA ACAGAGGTGG AGGTTCAGCC TGACAGCTTC TCCCCAAAGC CATGGAGAGA 1080
AAACCTTACC ACCCCCACCG CCCAGCTACT TCCAGCAAGT TGTCCAGCCT GACCCCTCTA 1140
TTTCCCCTGT TGTCTCTTAT CTGGGTCCCT GAGACCCACC CCATCTCCAA TAAAGAACAT 1200
TGCATACTGT GCATCAGTGT TGCCTTGGGT GTGCCAGGCA GGGTCGGGGG CGTGCTGGGT 1260
TCTCCATACT AGAACACCAC TACTGAACAA CATAGTCACA CCAGGCAGGG CTCCCTAAAG 1320
CCTACCTGCA TGGCCAGCGT GGTCCGAGGA CAGTGTGCTC TCCCCACCCT GTCTGCTAGC 1380
CTCCAGCTTC ATGGGAACTC CATTAATCAT GGGATTCCGA GATCATCAGA GCAATAGGAT 1440
CACTCCGTCT CCAGGGGAGC ACAAGGCAAG AGCCAGAGCG GGACTGTTCT TCAGTCAAGG 1500
GGCAGGGGTT GCTGCCTCTC TCAGTAGAGG CTTTTTCTCA GAAATGGCTT CCTGGTCTGA 1560
CAGTCCATAG ATGAGGAACA CCGCTGTCCT GCAGGCTACA CACTACCATT CTCTCTAGCC 1620
TCTCCATGAC ACAGAAGGAA AGGAATAGGG CTAGCAAGTC AGACAACAGG CAAGACTTGT 1680
CAGCCATAAA CCTGACACAG CTCAAGGGAG CACGGAAGAG CCACAGCAAG CAATTGTGCT 1740
CTTGACCTCA TTTCCCCTGT AACACCCACA TCCAACGCTG TGCTCCTGAA CGCGTTGCTG 1800
GGAGCAGGAG CAGAGCCCAG ACTCCCCCTC TTCGAGCTCT CTTGCCCTCA CCCAGAGTTC 1860
TTCCTGTCTG AACACCTCCT TGAAACTTCA GTTGGAATCC CAGAATTTGT CTAAACACAG 1920
AAAATACAGG ATCACACGTG GCGTGATTGC TACGACCTAG AAAGCAAAAG GGGGTATCCA 1980
CCACCATCTA CCCTCCCTCC CAAGAGGCAG CCCTTAGCCC CAAGCCCTCC AGGAACAATC 2040
CGCACGCATC TGGGCACTCA CACCCAACAC TGCAGTGCTT CTCCGCAGCA TTCCTTCACA 2100
GACACACACC GGACATTGAC TGCTCCGGAG CAGCCGCAAC CTCAACCTGC TCGGGGGTGG 2160
AGAGTCTACC TTGCACGCTC AGGCCCTGCA TGGTTCAGCA AATCAAAAAG TGCCCTCATT 2220
TTCCAGAGGA ACTGAGGCTG TGGAGGGAAA GGACCAGCCT CAGGGTCCTC AGTTCCTCAG 2280
CATCAGGAAA GCCCCATGAG CCCTAGCGTT CCCCAAAAGG ACAGAGCCTG GGATCTGACC 2340
AGGGCTATGG ATGCTACTGG TCCAGCAAGC TTGTGAGCAC TGGGGTCCCA AGGGCAGGTC 2400
CCTGTGTGAG CAAGTGAAAG CTGCCACCCC CTCCCCCTAC TAGGCTGGAG CATCAATCTT 2460
CAGGGACATG GGGGTGGGAA GTAGTGGTCA GCCCTGAGCC AATCCCATGC TTGCACTAGC 2520
AGCTCCTTAG GAAGCCCATG GGATCTGTAG AGAATCTGGT GGGTGTGCTG GTCTCCGCCC 2580
AACCAGGAAA GGGTTTGGGG TGGCAGCAAG CAGAGGCAGG GGGTGAGCTG CCTTTTAGTA 2640
ACTGAAAGAC CTAGCCAGAC CCAGTTGGGG TCAGGAGGGC AAGAGGGCAG GGAGGAGTTC 2700
TTCCCTAAAA AGGGATTCCA CAGACTGACT GAAGTGGGAG GAACCAGGCA GGCCCTCACT 2760
TATATGCTCT CAGAGTCCCA CTGAGCATAT GCAGATGAGT CTGTCTGTAT GCAGATGAGT 2820
CTGTCTATAT GCAGATGAGG AGAGAAGGCA TTCTCTTCTC TGGGTTACCA TAGAGCCTGT 2880
CACCCCCTCC CTTTCCCTTT GGGTTCCAGC TGCAGGGTAG CTTGGGAAAA AGGCTAGCCC 2940
CTAGGGAGGG GCAACTTACA AATAAAAGGT TAGACTTCAG GAAGGACTGA CCAAAGGAAA 3000
AAACTAATCA GTCTGGGGAG GAACTAGAGA TGGAAGAGAA TATAGAGAGG TTTCTGAATA 3060
GGTGAGACCA AACCATGCCC TACGGAACCG TGAAAGAACA ACCCAGGCTC TAAGTTCACA 3120
GACGGGCAGA AAGCTCTTGG ACACACAGGC TAGCAGAGGA AAGGGCCCCA GAGAGCAGCT 3180
GTGCTGATCT AGTGCCATCC TGGTCCCTCA CAGGTCACTG GCTCCTGACC TCAGACCCTT 3240
CACAGACAGG CCTGGGGCTC CTGCAGGTCA CATAGATCCC AAATAGCAAG TCCCTGGCCA 3300
CTGATTTGCA ACAACTTAGG CTATGGTGGG CAGGTTGGAA TGACAGTTCC TGCATAGGTC 3360
TTAGGACTTC CGTCAGGGGA TAGGGGCAGA GACATCAAGA GGGGAGAGAA CACCAGGGCC 3420
TGGGGAAACT GAGACCCAGA AATGCTAAGA AAGTTGCCTC TTCTTTCAGC TGATTTAAGC 3480
CAAGTTGGGC CTGAGCCCAG GGCTTCTCCT AGGAGTGTAG AGGCCTTTGG AAAAATCTCA 3540
CTTTTCCTCG GGTGGCCCGA GTTCCCTTTT CCACCCCCAC CCCACCCCCC ACCATTCAAT 3600
GGTGTAGCCA AGGCCTTTGT GGAGAGGCCC TGGGGAAGAG AGGGCCCTTG TCATCCATTC 3660
ATCTTGCAGG AGGCTTGGCC CATGCCAGAC TCGCTGGACT CTCCTTCCTG GGAGGTGCCA 3720
GGCAACCCCC ACCTCCCCTC GTGGCTGCTC CCCCACTTCT ATCATTTCCT GGGGCCTCAG 3780
GGGTTTGGCT GTGATCCCAG CCAAAAGATG GTGGGGAGTC CCACCTCCCA CACTTCCTCA 3840
TTCACACACT GGCACCAGAC CTGTGGGAAC GCCGGACAGC AGCTGGGCAT TGGTGCCCGG 3900
CTCTCCCCTC AGCCCACAGA CCTTAGAGAA GGCACGAGGA ACAGGGCCTT CCCCCCCTGC 3960
GCTGTCCTCA GCACTGATTG TGAATCTGGG TACAAACAAG GCCTGTAACC TGGATAGTAA 4020
CAGACCTTTC CCAGGAAACC TTCTGACAGG CATATATTCT GGGTCACCTT AACCCTCCCC 4080
ATAATTCTGC TCTGCTCGAA GCTCCAAGGA CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAACCC 4140
TTGAGGTTCT CCTGACCTCT CTGTGGCTAA AGGCCCTAGG GCCCGAGAAC AGGGAATCAA 4200
CATGGGGCTA CTAGTAGAAG 4220