EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM054-01676 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_KH2 
Coordinate
chr10:79512420-79516230 
Target genes
Number: 41             
NameEnsembl ID
Cdc34ENSMUSG00000020307
BsgENSMUSG00000023175
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
Prss57ENSMUSG00000020323
PalmENSMUSG00000035863
9130017N09RikENSMUSG00000035852
Ptbp1ENSMUSG00000006498
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Dazap1ENSMUSG00000069565
Rps15ENSMUSG00000063457
Apc2ENSMUSG00000020135
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Adamtsl5ENSMUSG00000043822
Mex3dENSMUSG00000048696
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
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EsrraMA0592.2chr10:79515884-79515895TTCAAGGTCAT+6.62
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EsrrgMA0643.1chr10:79515885-79515895TCAAGGTCAT+6.02
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Foxd3MA0041.1chr10:79514202-79514214AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr10:79513792-79513813TTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT+6.09
Nr5a2MA0505.1chr10:79515881-79515896GGGTTCAAGGTCATC+6.92
Nr5a2MA0505.1chr10:79514259-79514274GAGTTCAAGGTCATC+8.03
RELAMA0107.1chr10:79513182-79513192GGAAATTCCC-6.02
SOX10MA0442.2chr10:79514116-79514127AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr10:79514116-79514126AAAACAAAGG-6.02
Stat6MA0520.1chr10:79514373-79514388GCTTCTCAGGAACTG-6.51
ZNF263MA0528.1chr10:79514708-79514729TGAGGCGGGGGGGGGGGGGGG+6.69
ZNF740MA0753.2chr10:79514714-79514727GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514715-79514728GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514716-79514729GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514717-79514730GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03546chr10:79513881-79517704Bone_Marrow
mSE_10175chr10:79512205-79516153Embryonic_stem_cells
mSE_11700chr10:79512223-79516177Placenta
Enhancer Sequence
GATTTATGTC ATATTCTGAC CTCTTTAGAC ACTAGGCACA CACACAGTAT ACAGACATAT 60
ACGCAGACAA AACACTCATA CGCAAACAAA TAAATGAAAA TCAACTACAT AAATGTTTAA 120
AAAGAAAGGA GATACCCTGG GTGTGTGTTA ATGGGAATTA ACATGCCTTC CTGACCCAAG 180
CGCAGAGGAA TACAGGTCTC AAACCCCAGG GTGAGGTGTG TGGGAGGAGT GGGGATTGGA 240
GAGTAAAGGC AACAGCAGCA GCTGGGCCTA GGAAACCAAG CAAGTTTCTT AAAGAGAACA 300
GCATCCCCCA GCAGTGGTGG CATGCCCACC GCCTTTGATT CTGGAGGCAG AGGTTGGAGG 360
AGCTCTGTGA GTTTGAGGCC AGCCTGGGCT ACACAGGAAA ACCCTGTCTC AAACAAACTT 420
ACTTTCAAAA TCTGGCATCC TATTCCCAGG TAGGGAATGG TCTCCTAAGA CAGCAGAGAG 480
TGAAATCAGA CAATGTTTGC AAAGCGCACT GGGGACATCT CAGACACGGC TTGCCTTAGG 540
GCCTGTCATC ACAGCCATTC AGGGGAGAAA TCTGGCTTCG TGGGGAACAA AACCTTAACT 600
TTGAGGCTTA GGCCCCAACC CCAGGCTGGA CCTTGCCTTG TGTGCCCCTA GACAAAGGGA 660
CTAGGGTTCC CTTTGTCCTG CACTGGGGTC TGAGAGAGCC TGGGGCTGGT TTGGCTCCCA 720
ACACTCGAAC AGTGAGAAAT CTCTCAACAC AGATCGCTGA AGGGAAATTC CCAAGAGCAC 780
CTGACCGGTT CTGGCCAAGG CACAAAGGGT GCAGCCAATA ACAACAAGCC ACTTAACCCA 840
GTGGTTCTCA ACCTTCCTAA CGTTGTGACC CTAAATACAG TTCGTCATGT TGTGGTGACC 900
CCCTAGCCAT AAACCTCCCA TTGCTACTGT AATTTTGTGA CTGTTATGAA TTGTAATGTA 960
AATATCTACT GTGCAGATGA TTTGATAGGG AAGAACCTCC GAGAAAGAGT CCCCAAAGGG 1020
GCCTCCACCC GAGGTTGCCT CCGCTTGTAT GGTTTCACGG CCCCAACTTA TTTCGAGCAG 1080
TTAAACATGT TCGACAGAGG CAGAAACTCC AAGGCTGTTT GGACGAAGGG GGGAGATTTA 1140
CAGTTTAAAT ATAATTTCAG TCTTTTGGTC ACAGACTAGG GGCCTGTTGC CTGGCAGAAT 1200
CCCGCCCTTC CTGCGAGTGG CCTTGAGGAA AGAGGGGATG GACTAGCCAC AGGACTCATG 1260
GGCCACCTTT GAACCCCAGG GCTTTGATAT GGGGGGACCC GGTTACAGGC CAGCTGTGAG 1320
CCCGGAGTCA GTCTCCTTTT GTTATGGGGA TGAAGCTTAA CTGGCTAATC TTTTTTTCTT 1380
TTTCTTTTTT TTTTTTTTAA TCCCCCCCCC CTTAACTGGC TAATCTTAAT AACAAACCTG 1440
AAGGCTATTC TCTGTCCTCC GTTTAGCGGC CCGGCCTACT GTCCCTAGGT GGCTGCTCTA 1500
CCCGGAGCAC TCCCTTAGTT AAATTCCACT TTGCATAACT TAATCTTTCT TAAGTCCTTC 1560
TAGCAGGTTG TCCACGACCG CGGCTTCTCA TTCCCAGGGT CCCCTGTTGG TGGCAATGGC 1620
TCTGTCTTTC CAGTGCTTGG GGAGCAAGAG GCGAGAAGCT CCGAGGAGCC TGGGGAAATT 1680
GGAGACCTGG TCTCAGAAAA CAAAGGAAAT TAGAAACAAA GGCTGGGGCT TAAGGCCTCA 1740
CTTGGTATGT GTAAAACCTG GGGTCCACAC CCAGCACCCG ATAAACAAAC AAACTTGTCA 1800
TCCCGGCAGG CACTCAGGAG GGTGAAGTAG GGGGATCAGG AGTTCAAGGT CATCCTTGGC 1860
TACAAAGTGA GTTTCAGGCC AGCCTGGGCT ACGTGAGACC CTGTCTCCAA AATAACAATG 1920
AGGTAAAAGT CAGGCTCTGT CCAGAAGCTG GTAGCTTCTC AGGAACTGCC AAGTAGCTTT 1980
TCGCAGAAGC CCAGATCTTC ATTTCCCAAC TGGCTGAATT AGGGTGAAGT TGGGGTCACT 2040
TGGGAGAGGA AGGCACTCCA TATGCAGATC CCTCCCAGAG CCTGGGGCTG GGTTCCTGAG 2100
TGGCCGCCTT CAGCCCCAGC CCTTCAGCCC CAGCCCCTCG TCCAGAAGTA CGGGCCTTTG 2160
AGACGCCCTG TGAGGGTGTG TTGTGTATTT ACAACTTAAG CTAAAGCTCA AGTGCAAGTC 2220
CCTTAGAGGT CTTCAGTGAC TCTCAGTGTC ACCCCAGCTT GGGGGCTGGG AGGAAACAGC 2280
TGACTTCCTG AGGCGGGGGG GGGGGGGGGG CCCTCAGGGC AACTGAGAAC TTACAGGACA 2340
GGATTGGGCA AGAATGTATC TGACACCCCA GATCATCTTA ACCTTGGGGG GGGGGGTGTC 2400
TGCCCGTGGG GCGTGAGCTC CCTTGGACCC AGATCCCCGG GAGGGCTCCT GTCTCGCGGA 2460
TGGCTTACTC CAGGGTTCAG AAAAAGAGGA TTGAAGGGAT TAGAGTCCAG GCGAGGGCGT 2520
GGACAGGCAG CTGAGCTGAG GAATGTCCTG AGTCACTCCT GTGACACGGG GAGGGCAAAG 2580
GGCCCAGTGC TGGGCTGAGA GCTGTGGGGG CTGGACAAGG CCATAGGTGA AGTTGCAGGA 2640
GGAACTGTTG GGCCTTCAGC TTCTCACTTA GGCCCCTAAG ACCTGTGGCT TCTTTGATGT 2700
AGGCAGGGAC CTCTGAGGAC AATAGTAACT ATTTATATGT CTCTTGCCAC CTTGCTTTCC 2760
TGACACAGGG TTCACTGTAG CCTTGGCTGA CCTGGAACTT GCTTACCAGA CCAGGCTGCC 2820
CTCTAGGCTC CAAGGGCTGG GGCTAAGAGT GTGACCACTA GGCCCATCTC CATCTTGGTT 2880
TTGAGGCAGG TTCTCTCTCT GACCACGAGT ACTTGGGTGA CCTGACTTAG CTGCAGGGAT 2940
GCTCCAGCCT CGGAATCGCA GGTTCTGGAA TTACAAGAGC ATCCTTGTGC ACCAGATTGC 3000
GTGGGTGCTT CGATTGGGAC ATAGTCCTGT GTTTTCATGG CAATGGCTTT CTCACCAAGC 3060
CCTCTTATCA CCCCCTCAAA TCAACTTCAC AGGAATCAAT ATCTACAGGT GACAAGATAG 3120
GGCCTGGTGT CATTGACCTA TCTATCACCC TAGTACCTAG GAGTCTAAGG CAGGATTGCT 3180
GAGTTCTAAG ACCGGCTGAA CTGTAAAATT GGGGGTCGAG GGGGGGGGGA GAAGCTACAT 3240
CTGGGGTTCG GGACTCAATG GGTTGAGAGC CCTCACTTGC ATGCTGCAGG TTCTGGGTTC 3300
CATCCCTACA CCTCATGGCA GCACACTTTT GCCATTCCAT AGTTTAGGTT AGCCTGAGCT 3360
ACAGGAGGCA ACCTCTGATA AAGAAAATAG AAATGGAAGG GATGTGGGGA TTGGCCGACA 3420
CCGAGATCCC AGCACTCAGT AGGCTGAGGC TGGCGGTCCA GGGGTTCAAG GTCATCCTCT 3480
GCTATATAAA CAGTCCAAGG CTAGCCTGGG TTACATGAGA TTCTGTTTCC AGTAGAAAAA 3540
GGAGACTCCT GTACTTTCAA AGGGGCTCTT TAAGGGGATG ACTTTGACAC GCTTTCTATT 3600
CCCAGAGGTT CCCCAAAGCG CCCTGGCACC CTGCTCCGCT GCAGGCAACC TCGCGGATAA 3660
CTGTCCACAG CCCTCCAACG CGTCGTCCGC GAGAACGCGG CTCCCGTTTC TCCCGCGTCC 3720
CTATCACTGG GCATGCGCAG TTGCTGATAA CAACAAACTC GTAAGCCCAG CCCCGCCCAA 3780
GCCGTCCCTT CATTCAGGCT TCCCATTGGC 3810