EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

MM054-01165

Organism

Mus musculus

Tissue/cell

ESC_KH2

Coordinate

chr1:182824970-182826590

Target genes

Number: 10
Name	Ensembl ID

Parp1	ENSMUSG00000026496
Acbd3	ENSMUSG00000026499
H3f3a	ENSMUSG00000060743
BC031781	ENSMUSG00000038806
Lefty2	ENSMUSG00000066652
Pycr2	ENSMUSG00000026520
Lefty1	ENSMUSG00000038793
Tmem63a	ENSMUSG00000026519
Ephx1	ENSMUSG00000038776
Cnih4	ENSMUSG00000062169

TF binding sites/motifs

Number: 6

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

Esrra	MA0592.2	chr1:182826549-182826560	ATGACCTTGAA	-	6.62
Esrrg	MA0643.1	chr1:182826549-182826559	ATGACCTTGA	-	6.02
RREB1	MA0073.1	chr1:182826493-182826513	TGTGTGTTTGTGGTGTGGGT	-	6.16
RREB1	MA0073.1	chr1:182825348-182825368	ACCCAAACCAAACCAAACCA	+	6.7
ZNF263	MA0528.1	chr1:182825013-182825034	TCCTCCTCCCTCTCTGCCCCC	-	6.17
ZNF263	MA0528.1	chr1:182825673-182825694	TACTCCCCATCTTGCTCCTCC	-	6.34

Enhancer Sequence

GGGTAGGCTG GAGGTTGGGT GGCTAGGGAT GCAATAGACC CGGTCCTCCT CCCTCTCTGC 60
CCCCAGCCGC GCCGAGATTT TGTACCAGCT TAGGTGTGAA CTGTGTAGGC TGCCCCGGGA 120
GATGAGCCAT TCCTACCTAT AATACTTTCT AGCGGTGCGT TTAGAAATGG TATTATAATA 180
TTGAATTATA ACATTCTATT TCCACTGTCC CCTTCAAGAG TAAGTCTTTG AAGATTTTTA 240
GCTTCAAGCC AGGCATTGGT GGCACATGCT TTTAATCCCA CACTTGGAAG GGAGAGGCAG 300
GCAGATCCCC GAGTTCGAGG CCAGTCTGGT CTATAAAGGA TAGCTAAAGC TACACACAGA 360
GACATCCTAT TTCAAAAAAC CCAAACCAAA CCAAACCAAA CAACCAACCA CTAAAAACAG 420
AACAAACAAC AACAAAACCC ATCTTATTAG GCATATACTT TAAACATTTG TATTTGCTAC 480
TATTGCGCAT GTGTGTCCGT GTGTACACAC TGTGTTCTAC TCTGTCACCT TTATATGAGT 540
TCCAGGGATC CAATCCAGCC CAGGTCATCA GTTTTGCATG GCAAGCTCTT TACCTGCTAA 600
GCTACCTTGC CTCCCCTGCA TATACTCTTT GTTGTTGTTA AAAATTCTTT ATTTTGGGGG 660
AATTTTATTC ATATATACAA TGTATCTTTA TCATAGCATT CTCTACTCCC CATCTTGCTC 720
CTCCTGATAA GCATTATAGT GTGTGTGTGT ATAGGGGTGT GTGTGTGTGC ATATATGTGG 780
TATGTGTGTT GTGTGAAGTA TGTGTGCATG TGTATATGTG TGGTATGTGT GGTGCATGTG 840
GAATGTGTGG TGTATGTGTG TGTGGTGTGC ATGTGTTGTG TATGTGTTGT GTGATATGTG 900
GTGTGTATAT GTATGTGTGG TATATGTGTG TGTAGTGTGT ATGTGTGTGG GGTGTGTATG 960
TGTGGTGTGT GTATTTATGT GTGGTATATG TGGTATATGT GGTGTATGTG TGTGGGGTGT 1020
GTATGTTTGT GGGGTGTGTA TGTATGTGTT GTATGTTTGG TGTATGTGTA TGTAGTGTGT 1080
ATGTGTGGTG TGTGTATATG TGTATGTGGT TTGTGTAGTA TGTGTGCATG TGTATGTGTG 1140
GTGTGTGTAT ATGTGTAGTA TGTGTGGTGT GTATATATGT GGTGTGTGTG TGTATATGTC 1200
TGGTGTGTGT AGTATTTGTG CATGTGTGTA TGTCTGGTGT GTGTATATGT ATGTGTGGTA 1260
TGTGTGGTGT GTGTATATGT GGTATGTGTA TGTATGTGTG GTGTGTGTGA TATGTGTGGT 1320
GTATGTGTAG TGTATATGTG TGGTGTGTGT ATGTGGTGTG TATGTGTGAT GTGTGTAGTA 1380
TATGTGCATG TTGTGTATGT GGTATGTGTA TATGTGTGGT ATGTGTAGTA TGTGTGCAAG 1440
TGGTGTGTAT GTATGTGTGG TATATGTGTG TGTGTGTGCA GTGTGTATGT GTGGTGTGCA 1500
TGTGTGTATA TGTGGTGTGT GTGTGTGTGT TTGTGGTGTG GGTGTGCTTG TTCTATAGCA 1560
GGCATGTGGT GGTCAAAGGA TGACCTTGAA TGTCAGTGTC TACCTTAGGC CTTGTTTGAG 1620