EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM054-00130 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_KH2 
Coordinate
chr1:36070030-36073070 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:36073022-36073034GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:36071761-36071773GAATGTTTTTTT+6.52
HNF4GMA0484.1chr1:36071550-36071565TGAACTTTGAACTTT-7.73
Hnf4aMA0114.3chr1:36071548-36071564TTTGAACTTTGAACTT-6.49
LMX1BMA0703.2chr1:36072083-36072094GTTTTAATTAA+6.14
Nr5a2MA0505.1chr1:36070257-36070272GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
Nr5a2MA0505.1chr1:36071337-36071352GCTGGCCTTGAACTC-8.25
PKNOX1MA0782.1chr1:36071104-36071116TGACACCTGCCA-6.02
PKNOX2MA0783.1chr1:36071104-36071116TGACACCTGCCA-6.27
POU1F1MA0784.1chr1:36070722-36070736CTCATTTGCATAAG-6.63
POU2F2MA0507.1chr1:36070722-36070735CTCATTTGCATAA+6.44
POU3F1MA0786.1chr1:36070723-36070735TCATTTGCATAA-6.52
POU3F2MA0787.1chr1:36070723-36070735TCATTTGCATAA-6.52
Pou2f3MA0627.1chr1:36070721-36070737CCTCATTTGCATAAGG-6.16
RREB1MA0073.1chr1:36072981-36073001TGTTGTTGGTTGTTTTGGTT-6.17
RXRBMA0855.1chr1:36071550-36071564TGAACTTTGAACTT-6.32
RXRGMA0856.1chr1:36071550-36071564TGAACTTTGAACTT-6.54
RxraMA0512.2chr1:36071550-36071564TGAACTTTGAACTT-6.4
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10290chr1:36070039-36073050Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TATATATATA TATATTTGTT CTATGACTAT ACAAACTACA TTAGCCATAT CATAATGCAA 60
AATGCATTTA GTCCAACTTC AAAAGTCCCT ATAGTCTATA ACAGTCTTTA ACTTGTTTAA 120
AGTCCACCTC ATGAAAAGGA ATCTAAGGAA CTTGGAACAG TAGTTCCACG CATAGCGGTG 180
CACAGCTTTA ACCCCAGCAC TCTGGAGACA GAGGCAAGCA GATTTCTGAG TTCAAGGCCA 240
GCCTGGTCTA CAGAGCACGT CCCAAGACAG CCAAATTTTG GCATAAAGGT AGGTGAAAAT 300
ATACTTGAAC AAGGGGGCCG TGTTCCAGCC CTAGCCAGCA ACAGAACTTG GCAGCTTCAG 360
CCACATAGGT TCTGGCTTTA AAGTCTCCCT CCAAGACTAA GGAAAGCCAC TGGGGCTGGT 420
GTGTGGCCAG CAGAGTGCTG TCTAGGCCCT GAATGGCAGT GTGATTGCCC CCCAATTGCA 480
ACCGTTGGTC CTGAGAGAGG AAGCAAGGTG GACCACTGGG GAGCAAAGAG ACCCTCAGGT 540
GGCAGTGAGC CTAGCGAGAA CAAACTCTTA GAAGACAACT TCAGTCAAAT AGCTCATTTA 600
ATGAGGGAAC AAAGACTACA TAAAGCATTG GGTGTGGGTA TGAGCTTTCA GGTGAGCATA 660
AATCTCTGGC CTGGCCAGAG CACTGAGCAA GCCTCATTTG CATAAGGAGG AATTCCAGGC 720
GTGGCCAGGC GTGACCTTTT AAGGGGAGAG GAAGTTTAAC CTGGCTAATG AGTATCGTGG 780
CCTCCTGGTG AGGAAAAGGT GGGTGCTCGA GGCTATTTTA TTTGTACCAG GACACTCAGG 840
CCAAGGGCCG GGGAGAGCAA TTTTACTCCT GCAGATCTCA GGACAAGATT TCCTGGGTTT 900
GGACGTGCCT CAACCCCGCT CTTGTTCCGG GCCGGCTCCC CAGGGTTCCA GGCCTCTCCA 960
GCCCCCCAGC AGGGCGTCCC AGTGTGAAAG TCAAGAGAGG CCATTGTGTG AACTGTGAAG 1020
GTGAAACCTG GCTTGCCTCG GAGACCTCAA ACTGTGGGAG ATGGCAGAGC CATGTGACAC 1080
CTGCCAAGGA GAGCTGCTAA TGGGGGTGGA ACCAGCCCAA GAGAGAGAAG TGTGTTGCAG 1140
TCAACAAAGC TGAAAGGAGT TGGAGATCAG AAAGGCATTT TGACTTCAGC CATGGAGATG 1200
CTGAGTTTGG AGTTTTTTGG TGTTGCTTTT TTTTTTTTTT CCTTTTTTTT CGAGACAGGG 1260
TTTCTTTATA TAGCCCTGGC TGTCCTGGAA CTCACTTTGT ACACCAGGCT GGCCTTGAAC 1320
TCAGAAATCC GCTTGCCTCT GCCTCCCGAA TGACCACACC CGGCTAAACC CGGTGTTGCT 1380
TTAGTGCAGT AGTTCCTCAC TATGTTCCCT TTTGAGATGG TAATGTAGGT CCCTTGCCAG 1440
CGTATGTGGG AAGTATATGA TCCGATTTTT TTTTACAGGG GATTAGAGTT AAGAGAGTGC 1500
ATGAGTCTCA AAAGAGACTT TGAACTTTGA ACTTTAAACA AGTCTAAGAC TGTTATAGAC 1560
TATGGAGACT TTTGAAGTTG AACTAAATGC ATTATGATAT GGCTACAATG CTCTGGGGGT 1620
CACAGAGTGG AATATGATGA TTTGAAGAAG AAAAAAAAAT GGTCCCCATA GGCCTATGGG 1680
AGTGGCCTTT TAAATCTAAT TGTGGCCCTA ATTAAATGTT TTTCATTATA AGAATGTTTT 1740
TTTCATGGTC ATGGTGTCTC CTCACAGCAA TAAAACCCTA AGACACCTAC CTTTCTTTTA 1800
AAAGGTTGTA TGACTACCTG GTGTCATTGC GACCTTAGGA CCACCTTGTA GTCATGTCTT 1860
TCAGGAGGTC CTTGTGACTA ACTTGTTATG TTTATGTTCG GTCCCCATAA GCCCACCTAT 1920
TTTCCCCCAT TTGGAAACTC CTTATCCTCA AGCTATAAAA ACCTTGTTTT CCCCATGCCT 1980
TCCTCTCAAA CCCTGACTAG GGGAAGGCAG CCCATGTACA TGAACTTGAA AAGTTTGCTT 2040
TAATCAATTG CTTGTTTTAA TTAATTTGCT CATGGCGATT TGGGTCAGTG GTCTTTTACC 2100
TCAAATCTTT GGGATTAACA ATCCCAAGCT TTGAGGTCTG TTGTTGACGT ATCTGTAATC 2160
CCAGCATTGG GGGGGAAAGA GTCAGGTGGA TCCCTGGATT TGAGCGTCAG CAGACCAGGC 2220
CAAACCAGTG GGTTACAGGT TCAAGGAGAG GCCAGCCCTG TCTGAAAAAA ACGAAAATGT 2280
AATTGAGAAA GACAGCCAGT GCGGGACCAT AATAGCCCAG GGTTACAGAA AGAGAGTTAA 2340
AGGAGCTCCA ACCCCAGACA CCCCAATCAT GAGGACAGCA GAGTTGGCTA CCTCCCAGCT 2400
CCCAACCTGG CACTGTGAAG TCAGCTCCCA CACCATCAAC CCTAGTTGAC AGTTATCAGG 2460
CGTCACTCCT TGTTCAACCT TCTAGCCTTT TGCCCTAGAC CTACAGCTTC TGAGTCTGTA 2520
GATGAAGCAT CTTTCAACAC CCCTGCCCTG GCCAGTGGCG CACAAGCTCA CAAGTCTTGC 2580
CCCAGAGACC CTGGCCACCT CCCCAGGGCA TAAATATCCC CCCCCCCCTA AACTAAACCA 2640
GTTCTGCCAA GCTGTTCCCA GATATGTTTA TTCCCTGTGC ACTTATCGCC GTCCAAGATC 2700
CTGCCTGCAC CCACCCCCAG CTAAGCTTCC GCTACCCCGA GAGGGAAGGA AACACCCGGC 2760
AGCAACCCAA CATCAATCTC TGGCCTCCAT GTGGACTTGC ACACACATGA AGACACACTC 2820
ATGTTCCTCC CCCTTAGAAA TTTCATGAAA CTGTTACCAT CTTAGAGCAT GCAATTTGGG 2880
GCAATCTAAA TCTGTGCTCC CTGGCCACTG AAACTCGAAT TTGGCTCCAC AATAAACTGT 2940
TTTTTTGTTG TTGTTGTTGG TTGTTTTGGT TTTTTGGGGT TTTTTTTTTT TTGTTTGTTT 3000
GTTTTGGTTT TTTTTTTTTT TCTTTTTTTC TTTTTTTTTT 3040