EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM053-30566 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_J1 
Coordinate
chr9:72486500-72492730 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr9:72492234-72492246TTCTGTTTACTC-6.27
IRF1MA0050.2chr9:72490168-72490189GAAAAAAAAAAGAAAGGAAAA-6.02
IRF1MA0050.2chr9:72490589-72490610ATTTACTTTTTTTTTTTTTTT+6
IRF2MA0051.1chr9:72492281-72492299ATATTGCTTTGGCTTTCC-6.32
LMX1BMA0703.2chr9:72489423-72489434AATTTAATTAA+6.32
MITFMA0620.2chr9:72487932-72487950ACAGATCATGTGACCTGC+6.01
MITFMA0620.2chr9:72487932-72487950ACAGATCATGTGACCTGC-6.01
NFE2L1MA0089.2chr9:72490753-72490768ACTGCTGAGTCATTG-7.44
NFIL3MA0025.1chr9:72486736-72486747AGGTTACATAA-6.14
Nfe2l2MA0150.2chr9:72490755-72490770TGCTGAGTCATTGTC-7.45
OLIG2MA0678.1chr9:72490547-72490557ACCATATGGT+6.02
OLIG2MA0678.1chr9:72490547-72490557ACCATATGGT-6.02
RELAMA0107.1chr9:72488773-72488783GGAAATTCCC-6.02
SOX10MA0442.2chr9:72490567-72490578TGCTTTGTTTT-6.02
TBPMA0108.2chr9:72487124-72487139CTGGGGCTTTTATAG-6.13
TFAP2AMA0003.3chr9:72492299-72492310TGCCTGAGGCA-6.02
ZNF263MA0528.1chr9:72487409-72487430AAAGAAAGAGGAGGGGGAGGG+6.22
ZNF263MA0528.1chr9:72487412-72487433GAAAGAGGAGGGGGAGGGGGA+7.87
ZNF263MA0528.1chr9:72487415-72487436AGAGGAGGGGGAGGGGGAGGA+9.41
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04461chr9:72486767-72489533E14.5_Brain
mSE_04882chr9:72486813-72489958E14.5_Heart
mSE_05548chr9:72486713-72489951E14.5_Limb
mSE_09447chr9:72486719-72489963MEF
mSE_09447chr9:72490868-72492855MEF
mSE_10312chr9:72486769-72489682Embryonic_stem_cells
mSE_10312chr9:72490973-72492436Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CTAGGGCTAC ATGGAGAGAG TGAGTGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AACGAGACAT 60
GGCACCATCT GCCTATACTC TGGACACTCA GAAGACTGCG TTTTGGGGAT CACAAAGCTG 120
GGCTAGGCTT GGCTATGTAG TAAGAACCTG TCTCAAAAGA CCAAAATAAT TATAATAATT 180
ATTATAATTC TAATAGAGCA ATAATGTAAA TTCACTTGCT GTAAATGAAA GGATATAGGT 240
TACATAAAAT GAGGATATTC AAATACTGTT ATAAAGTTAA CTCTAAAACA TCAGCCTGTA 300
AGTTTTATTA AGAGTCCATT ACTTAAGCAT CAAATGTATT CTGTTCCCAT ATGAAATATC 360
CAGTTAAGAC AGGGCTTAAA AACTGGTTAC TTGGAATCTG ATGTAGCTGC ACAGGACCAA 420
AATAGTCACA AGACTGTAAC AGCTGAGAAC TCTGCACAGG AGCAGACAGA CCAGCAAATG 480
GCTGCCCGTA AGGCAATATG ACGGACACAG TACCTTTGGG GCTTTGGTAG CGAGAGGTTT 540
TGAAATATGT TGATGTGCTT TTTATTTTTG TATTTCTTGC TCATGACTTT TACTCTAGTT 600
TAAACATCAC TGCTTTCAAA AGTTCTGGGG CTTTTATAGC TGGGACGCAA AGAATTACTC 660
GTTTTCTCTT GAACATCATT TCAGAAGGTC TTCAAAGCCT GATCTCTCCA TTATATTCTA 720
ATCAAGAAAA CACTTCAAGA ACCCTCAGTG AGCCAGGCAG TGGTGGCGCA CACCTTTAAT 780
CCCAGCACTC GGGTGGCAGA GGCAGATGGA TCTCTGAATT TGAGGCCAGC CTGGTCTGTC 840
TACAGAGCAA GTTCCAGGAT AGCCAGGCCT ACACTGAGAA ATTCTGTCTT AAAAAAGAAC 900
AAAGAAAGAA AAGAAAGAGG AGGGGGAGGG GGAGGAGCTT AGCTGTTAGA GTGTTTGCCT 960
GGTATACACA AAGCCCCAGC TCCCTATAAA CCAGACATGG TGATGCACAC GTGACCTCAG 1020
CACTCAGGAG CTAAAGTAAA TCAGCAACTC AGACACCCTC TGCTCCTAAG TGAATTTGAG 1080
GCTAACCTGG GATCCAGCAG ATTGTCTCAA AATGGCAACA ACAACAACAA CAAAAACCCT 1140
TACGGGGGTG TGTGTGTGTG TGTGTGCGCG CGCGCGCGCG TGTGCAATAC TGAACAGATA 1200
ATTAGATGCA CAAGAAACAG AGGCAGTGAG AAAGCAGACT GGACGCTGAA GATCTCTCAG 1260
AAACCGATTA CAGCAAGACC AGAGAGGCTG GGAGATGATC CTAGGAGGAA GCTGGAGCCG 1320
CGGTGGAACG CGGCAGTGGC CAGCACTTTC CACAGCTAGC CCAGAAAATA CCCAGACTTC 1380
TCCAGGCCCG GCTCGCACTG CTGTCTCGAG GGGATGGACC TAGCTAGGGT TTACAGATCA 1440
TGTGACCTGC AAGCGGCTAG CTCCGGAGCT GAGAGGGGGA TGGGGTGAGG GCAAGAATAA 1500
CACGTTGCGC AAACAGGCTC AGGGCCTACT GGTTGATAAG AAGGGCCCGC TTGTTCTGTT 1560
TCAAACTTAC GAAATATCCT CAAATATTTC GATCTGAGGC ATGGTATAGT ATAGTTTTTA 1620
ATATAAACCA TACGACCATG AGGTCATTGC AATTTCCTGT CACACACAAA AAGGCAATAA 1680
AAGACCTTCC TGGTTAGGGG GGAGGAGCCT AGGGAGAAAG CCAGAAGGGT GGAATTCTCC 1740
AGCTGGGTGA AAGGGAATCT TAGAGGAGAG GCAGCTCAGG CATTCTTTCT GTCTGGGGAC 1800
TTGGAAAAAC ACCCCACACC GAAGGAGGGT TGCAAACAAA ACAGCCGGGC TGGAGGAGGG 1860
TGGGAGAGCA GAGAGAAGTG GAGTTGGGGC GTGTGAGCTT CAAGGGGCCA GAATATCCTA 1920
GATAAATGTT ACTGGATTTG AGGCCCCAGC CTGGGCCTCA AGAAAGTATG TTTCGACAAC 1980
CGTCCTGAGT AAGCCAAAAA AAGCAGCCCA GTTAATAATG AAAACAGAAA GAAGAGATTT 2040
TTATTCAATG TGGTCACATT GAGAAGGACA AAGAACTCTA GTGAGCCCGT CCTGATGGAA 2100
GGTTCAGTTT TAAGTAGGGG CCAGGCTAAG CAAGCAGTCT GGGGCAGACT GTGGTCCCAC 2160
CTACCGCTGT TCCTCCTTAC CTCTCCCACA ACGCAGTCTG ACGAATTGTG GATCTCTTTC 2220
CTGATTTTAT TTTTCCCCCT CTGACTTTCT CTTCTCCCAG CAAGAGCTTT TGGGGAAATT 2280
CCCGTTTACT GGGGCCCATT GTTTCAATAG TCTGCAGACC AGAGGGAAGG AAGGACACAG 2340
TGTTTCTTTA GAATACCAAC CATCTCTGCT TGACTGGTTA CAGTAGGTTT CGTGCCTTTG 2400
GTCGGGGTCC ACAGCTACAT TTGAAGACCT GTAGATCCCA AAGGGTTGGA CGTAAGTCTG 2460
GGAGAGCTAT ACCCCAAGCA AGGGGCCACG GCAAATACAG GAGGCATCCA GGGCAGAAGA 2520
TAGTAATCCC AAAAGCAAAT GGTACCCACA GTAGAGAAAA GTACCTTAGT GGAGGCTAGC 2580
AAGCAGAGAG GGCAGAAGGG CCTCCCTCCT CAGTGCAGAA CTAAGTGGTG TCACATACCC 2640
TCTGCCGCCT GCCACCTGCA CTCAGCCTGA GGTATAAAGG GAAAGAATGC CTGAGGAGTT 2700
CCTAAAGATA GACTCTGAAT TAATCCAAAA GGAAAGGTCT AGAGGTGGTG ACATGTTCTT 2760
AAAGGGGCAG GGTGAAAGTT TCCACAACTT GTAGAATTGT GGGGTGTTCT GTTTTTTTCA 2820
CTGACATATT AACAGAGTTA AATATCTTTG CCCTTGAGTC ATTTTAACCA TAAACTTCAA 2880
ACCTGGTGCC TGTGTACACA TTCAGACAAG TGTACCGGCC CCGAATTTAA TTAAACACAC 2940
ACAGCTGAGT CAAGGTGCAC ACACCCAGTC CCAGATACTC ATGAGGTTCT TTTAAAACCA 3000
TCCTGTTCAA CATGGTGAGA CACTATCTGA AAAACAAAAA CAAAACAAAA AAACAACCTT 3060
AGGGAACATA CACAGGCACG CATAATAAAT CTACACAGAG AACTTCACAC ACACACACAC 3120
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACGA GAGAGAGAGA GAGGGAAAGA GAGAGAGAGA 3180
GAGGGAAAGA GAGAGAGAGA GAGTTCTGAC TTTCGATCTC CTTTTTTGTA CTAGGTTAGA 3240
CCAGCTGCTC CCTTAAACAA TGCATGACAT TCTACTGGGT CAGTCAGCAA TCATTTTGGG 3300
AAAGAAAACA CATGTTGGCT TAAAAATTTC AAGCATGGGC TGGTGAGATG GCTCAGTGAG 3360
TAAGAGCACC CGACTGCTCT TCCGAAGGTC CGAAGTTCAA ATCCCAGCAA CCACATGGTG 3420
GCTCACAACC ATCTGTAACA AGATCTGACT CCCTCTTCTG GAGTGTCTGA AGACAGCTAC 3480
AGTATACTTA CATATAATAA ATAAATAAAT CTTTAAAAAA AAAAATTCAA GCATCACGGG 3540
GTGGTGGTGG TGGCGCACAC CTTTAATCCC AGCACTTAGG AAGCAGGCGG ATTTCTGAGT 3600
TCGAGGCCTT CCTGGTCTAC AGAGTGAATT CCAAGACAGC CAGGGCAACA CAGAGAAACC 3660
CTGCCCCCGA AAAAAAAAAG AAAGGAAAAA AAATTTTTCA AGCATCAATC CTACTCCTCT 3720
TTTTTTTTTT TTGGTTTTTC GAGAGGCTTA ATCCCACTCC TCTTAATACA TTGTGTGAGC 3780
CCCACAAAAA CATCTGATCT AGACCACTTC CCTGGGAGTC ATTCCACTTC TCTGTGTGGA 3840
ATGTTTGAAG TCTCTTTCAG GTTCACGGAG AGGAGCCCTT GGTTTCAACG GAAATTCTCA 3900
CAATACCTCC TTAGTGGCTC ACTCTCCTTC TCTGGGGGCT ACCAGCCCTT GGGAAGTTCA 3960
ACTACAAAAC AGAAAGACTT TCATGGGTGG GGGATGGGAG CACCATACAA CTTTTGGAGG 4020
ACCCCAGGCA GATGTGTGCT GGATGCTACC ATATGGTACT AGGGTCTTGC TTTGTTTTTG 4080
TTTTTTAAGA TTTACTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTAC TGTATATAAG GACACTGTAG 4140
CCGTCTTCAG ACACACCAGA GGAGGGCATC AGATGCCATT ACAGATGGTT GTGAGCCGCC 4200
ATCTGTGGCT GGCTGGGAAT TGGACTCTGG AAGAACAGCC TTAACTGCTC TTAACTGCTG 4260
AGTCATTGTC TTAGTCAGGG TTTTACTGCT GTGAACAGAC ACCATGACCA AGGCAAGTCT 4320
TATAAAAAAC AACATTTAAT TGGGGCTGGC TTACAGGTTC AGAGGTTCAG TCTATTATCA 4380
TCAATGGATG ACAGCATCCA GGCTGTCATG GTGCAAGCAG AGCTGAGAGT TCTACATCTT 4440
CATCCAAAGG CGGCTAGTGG AAGACTGACT TCCAGGCAAC TGGGGTGAGA GTCTTAAGCC 4500
CACACCCACA GTGACACACC TACTCCGACC AAGTCACACC TATTCCAACA AGGCCACACC 4560
TCCAAATGGT GCCACTCCCT GGTCCAAGAA TATACAAACC ATCACAGCCA TCTCCCCAGC 4620
CCTTGCTTTG TTTCTTTATT TATGAAGCAT TCCTTCAGAG CCTAGCCCTG GTAAACACAG 4680
TCCTCACTTT ATATCAACAG GGATAAGCAG CTATCTTTCC CCTCATAGAG CTGTGTGCAT 4740
ATGTGTATAG GCACACACAC CTGTGCATGC ATGTGAAAGC CAGAGGTGAA TATTGGTGTC 4800
CTCCTCAATT GCCATCCACC TTATTATTCT GAAGCAGCGT CTCTCACTGG AACGAGAACT 4860
CAGCCATCGG ACTAGGCTAG CTGGCTGGCA AACTCCACAA GTCTCCCTCC TAACTGCCCC 4920
CTCCTCCCCA TCGATACCTT TCTGTGATAG AGTTACAGGC TCACACTACC CCTGCTTGAA 4980
CTTTTATGTG GATGCTGGGG ATCCAAACTC AGTCCTCATG CTTTCAGGGA AAGCGTTTTA 5040
CTCACAAAGT CGGCTCCCTA GCCCCGTCTT TGCTTAACAG CAAAGCACAG CTAATTCTTC 5100
AACTTGAATC TCCTCCCTTC TAAAGGCAGA ATTCTTGGCT GGCTAGAAAA AGGATATGAG 5160
TAACCAAGCC CATTTCTCCC AGACTTGTGT GGCTGGCCTT CTTTCCTCAA AGGCCAAATC 5220
TCCCAAGCTG CCCTCCACTT CAACATCACC AATAAAGACA CTCCTTCAAA CCTCACTGTA 5280
TCATTCTCTC TCCAAACTCA GTCTTCCAGG CTCCCCTGAG CATCTGCATT TGTGGCCCAT 5340
ATTACTTTAT AACTTCTCCA TGACTTTCTC TGGAAAGATC CAACTCTTTC AACTCTTTGG 5400
AATCCAAGTT CTTCTTCTGC AAGATTTCTG GTGTCTGTGC CCTCTTAGCA CATCCGGTGT 5460
GTACATCCTC ACAGCTAGTG TGTATATCCT CACATCCGGT GTGGACATCC TCTGCTCTGT 5520
CCCACCCCAG GCTGCTCCCG GAGCTCACAG GTCTCATCCA TCTGGTCCCC ATCTGGGTCA 5580
CACAGACCAA GGACATTCCC TCAGGTTCTC TGACCCACCA GATGCCCTTC CTAACCCCTT 5640
GAGGCTGACC CCAGTGGCAT GATGTTCAAC CCATCCTGTC ACTGAAGGTT TGACTAGCAA 5700
GGCCTTAGGA GTGGGCCCCT CTTAGGCGCT TCAGTTCTGT TTACTCTCGC CTGTTCTCCT 5760
TTCTCCCTCT CAGCCCAGGA AATATTGCTT TGGCTTTCCT GCCTGAGGCA GGCAGGGGAG 5820
CTGTCTGTGA GTCACTTCAT TGTCCTTACT CTGTGGCAAA ATTTCCTCAA GCCTAAAACT 5880
CCAATCCTCC AATGTGATTT AAGCTTTGTA ACCACGCCTT CTTTGAACGA TAAACAAAAC 5940
CATTTCTTCT CTCAAAGGCT TGGCCGAAAT CCGTGGTTTC AGGCTTTTTT GGCAGGTGTG 6000
ACTATAAAAT CCACTCAGAC CTTCTTTGCA TTAATTGTTT CTTTGTAGAC AGTGTCTGCT 6060
CACACCACAC AATGAATGTC ATTATTGGAA AGAGGGGAAA CTGCACAATG ACTTTAGGAG 6120
ACTGGAAAAA CAAAAAAACA AAAAAGCACA CTTTAAGGGG CCAATGAGAT GACTTAGTTG 6180
ATGGAGCTAC TTGCCAAGCA AGCCTGACAG CTTGAATGCA ATCCTGACAG 6230