EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM053-07144 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_J1 
Coordinate
chr12:88176340-88179170 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:88178373-88178385AAACAAACAAAC-6.32
HNF4GMA0484.1chr12:88178303-88178318TGAACTTTGGTCCTC-6.21
IRF1MA0050.2chr12:88177873-88177894TGTAACTTTCACTTTCTGGTC+6.71
IRF7MA0772.1chr12:88177877-88177891ACTTTCACTTTCTG-6.23
Nr5a2MA0505.1chr12:88176873-88176888GCTAGCCTTGAACTC-6.13
Nr5a2MA0505.1chr12:88178871-88178886GCTGACCTTGAACTT-9.03
RARAMA0729.1chr12:88178876-88178894CCTTGAACTTATGATCTT-6.83
RarbMA0857.1chr12:88178879-88178895TGAACTTATGATCTTT-6.15
TCF7L2MA0523.1chr12:88177005-88177019TGCCTTTGATGTCG-6.21
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00507chr12:88151708-88178129pro-B_Cells
mSE_01277chr12:88127683-88178050Th_Cells
mSE_03417chr12:88177188-88178069Bone_Marrow
mSE_04811chr12:88177030-88178082E14.5_Heart
mSE_06635chr12:88176730-88178315Heart
mSE_07607chr12:88177024-88178119Intestine
mSE_08022chr12:88176671-88178122Kidney
mSE_08784chr12:88176943-88178315Liver
mSE_09024chr12:88176327-88178091Lung
mSE_09530chr12:88176991-88178111MEF
mSE_10068chr12:88176965-88177810Embryonic_stem_cells
mSE_10703chr12:88177131-88177954Olfactory_bulb
mSE_12065chr12:88175070-88178127Spleen
Enhancer Sequence
ACTCAGTCTC AAAGCCCCAA GGCCTGGAGG ATTGCAAAGC GGTAGAGTGC TCTCTGAATG 60
TTCACAGGGC CCTGAGTTCC AACAACAAAG AAAACAAAAC ACAGGAAAAA CCTAAGGGTG 120
GTTGCTTAGG TCCAAAGGAG CCTGTTATTT TGAAGATTTG CATCCTTGTA TACAGTTGTA 180
TGATTAACCT CATCTAAACA TCTCACCTCT AATAGACTGA AATGTGGTGT ATGTTTAGTG 240
TTAGTCGTGT CTTTTGAGAT TGTTGTTTTG AGACAGGGTC ACTACGTAGC CTAGGCTAGC 300
CTCAAACTCA CAGATTTCTG CCTGCCTCTA CCACTCAGTT GCTGGAATTG ATTAAAAGCG 360
TGGGCAAGCA CACTTGACTC TGATTCATGG TTTGTTTCTT GGGGAGCAGA GCGGGGATTT 420
GCTTGTTTGC TTGTTTTGTT TTTTTGTTGG TTGGTTGGTT GGTTGGTTGG TTTTTTTGAG 480
GCAGGTTTTG TCTGTATAGC CTTCGATGTC CTGGAATTTA CCTTGTAGAT TAGGCTAGCC 540
TTGAACTCAG AAATCCACCT TCTCTGCCTC CTGAGTGCTG AGTCCTTTGA ATCATGGTTC 600
TTAAAAGTTA AAAAAAAAAA AAAATTAATG TTCTAGAAAA AGATTGAAGG CCAAAAGCCA 660
AAATGTGCCT TTGATGTCGG GAGCCACTTT GTCTTAACTT TGGGCTCCAG CACCCCTTAG 720
GGGTGAAGGA CGTGACCACC ATTTCCTTCC CCTTCACACA CTTCTGTCTG CTTCCCCCAT 780
TAGCAAGAAG GAAAGACGGG TTTTTGTTTT GTTTTGTTTT GTCTTGTTTT TTTAATCCAT 840
CTAAGGGGAA AACAGTTTTT TTTAAATCAT CTTATTTATT TAAAGATACT CTCTTGTAGC 900
CCAGGTAGGC CTCAAATGCT TTATTTACGT AGCTGATTCG GGTCTTGAAC CTCTGAACAT 960
GACTCCACCC TGGGCATGTC TAACTCCGTG GCTCAAGCTT TTTACCCCGG GTCTTATCTC 1020
GGAGATTTTC ATGTTTCCTA AGGACTTCCT AGACTAAATT AGAGCCCTTG AGCCGATCCT 1080
TCCAGGAAGC AGGCGTGTGC ACCACCCTGT CCTCAGTCAT GGTCTCAGGA GACCACGTGG 1140
AGGGCAGTCG GAGGCTTCAG GAAAGCTTCC TCCTCCCACG GCTAGGGCCA ACCTTGAATT 1200
GGGGGGTGGG GGTATAGAAA GCTCTACTAC AGCCTCGGCA TGAAGACCCA ACATGGCCTC 1260
GGTTAGCCTG TTTGCCGTTC TACAAAGCTG TTCAACCCAC CTCCGCAGAA AATTCTCACC 1320
CTCGGGGTGG GGGTGGGGAG GATGAGTAAT TACATAAGTC CCTCTCTTTT CTGCCAGCTT 1380
CTCATCCCCG CCCATTCGCT CCCCCCTCCT CTCAACTCCC TCCCGTCCAA GGGCAGCTCT 1440
AGACTGGGCT GGGCGAACAG ACTGGGCTGG GTGAACTTAC GCCCGCCCGA CTGGGCCCTC 1500
CTCCCTAGAC CTCGCCTAGT TCTCTCACCT CCATGTAACT TTCACTTTCT GGTCACTCTT 1560
GATTCTCTAT AGCAGAGCTC AGCAGCGTGC CAGGGCGGGC GCTGAACAAA GCGGTGCGGG 1620
TTGAGGAAGG CCTGGGCTGC CTGCCCCTGA TTAGCTCAAG TCTTTGCAAG AGGCACAAAA 1680
ATGTGCATCA AACATTTTCT TATTTTCGTT CATCTAATAA CATAATCTTA TTTTCATTAA 1740
TAAAAAAAAT CGTTCGCTTT TTATATAAAC AATGTTTTTA GATTTTTTGT TTGTTTTCAC 1800
CATATATAAG TTTATATATG TTTTTAATAT ATATTGTTTT GCCTGCATGT ATGTATGGGC 1860
ACCACATGTG TGCCTGGTGC CCACAGAGGC CAGAAAAAAA AAGAGTCGGA TCCTCTGGCT 1920
GGAATTACTG ATGGTTGTAA GCCACGTTGT GGGTGCAGAA AACTGAACTT TGGTCCTCTG 1980
CAAGAGCAAC AAATGCCCTT AACCACTGAG CCATCTTTGT AGCCTCTTTT AACAAACAAA 2040
CAAACAACCC TTTTTGCAAT TTTTACATTT ACTATATGTG TATATCACTG TATTGAAGCT 2100
AGACATATTC AAACATATTT TATTATTATT AATTTTTTGT TTGTTTCAAG ACAAGTACTC 2160
ACTATATAGT TATAGCTGTC CTGAAACCCC CCCTCTATTG ACCAGTCTGG CCTCAAACTG 2220
CCTGCCTTTG CCTTCAGAGT GCTGGAATCA AAGGTGTGTA CCACTACACT TGGCTTATTA 2280
ATAATTTTTT TTGAATCAGG GTCTCTTGTA GCCCAGGCTG GCCTCAAACT GCTGATGTAG 2340
CCAAGATGAC CTTCAGCTCC TGATCCTCCT GCCTCCACCT CCCCAATGCT AGGATTTACA 2400
GGTGTGACCG ACCACATCAG ATTTATATGG CGCCCAGGGC TTCCTGCGCA CACATGCTAG 2460
GCAGGCAATT CTACCACCTG AGCTGTGTAT CCAGCCCTTT GTTTCTAAAG ACAGTGTCTC 2520
AGGTAGCCTA GGCTGACCTT GAACTTATGA TCTTTCTAAG TGCTCGGATT TGTCAGGTTT 2580
CCTCACTTTT CTGTTTCCTG TGTAGGTAAG CAATGCTAGC CACACGGACC AGGTTCCTGC 2640
ACATTCGGAA TTTTTGTGGA TCCTGGAATA GAGACACATT CTGATGACTA AGACCAGAGG 2700
ACAAAGGCTT TCCAGTGCAA TGCATAGCAG CACAGAAGCA TACAAGGAGG CTTCGTAGAG 2760
GGAGGGACCC CCTGCACAGG ACCCAGGCTT GGAACCAGTC ATTGGCCAGA CACAGAAAGG 2820
GATAGTTGTT 2830