EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM053-01505 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_J1 
Coordinate
chr1:137112750-137115500 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:137113698-137113710AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:137113702-137113714AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:137113706-137113718AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:137113710-137113722AAACAAACAAAC-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:137114874-137114889TGACCCTTTGACCCT-6.46
RARAMA0729.1chr1:137114871-137114889CTTTGACCCTTTGACCCT-6.19
RREB1MA0073.1chr1:137115203-137115223CCTCACCCCACCCCCACCCC+6.75
RarbMA0857.1chr1:137114874-137114890TGACCCTTTGACCCTG-7.09
ZEB1MA0103.3chr1:137114119-137114130CCCACCTGCCC+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:137113969-137113990TTCTCTTTCCACTCCTGCCCC-6.14
ZNF263MA0528.1chr1:137114119-137114140CCCACCTGCCCTCACTCCTCC-6.34
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07141chr1:137113618-137115067Intestine
mSE_10515chr1:137112977-137115215Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CAAATGACAC ACCTATGAAA AATAGGGGTG TTTAAAAGGG GGAAATAAGG CAGGCTTGGT 60
GGTGCACACC TTTAATGTCA GCAGTTGGGA GACAGAGGCA GACAGATTCT GTGATTTCAA 120
ACCCAGACTG GTCTATAAAT TGAGTTCCAG GATAGCCAAA GCTACACAGA GAAACTACAT 180
AGTAAGACCC CCGTCTCAAA ATGTTTTTGT TGTTTTTGAA AAAAGGGTGG GGATCAAAGT 240
AAAGGAGACA TCACTGAACT AAGTCAAGAA AATATCCCCA GACTGATCGG AAATAGCCTT 300
CAAATTCCAG GGTGACAGGA CATAGCAAGA ACCAAAGCGG TGTTTGGAAA CCAAAGTGTC 360
ACAGGTACAA GTGACACAAC TGAAGCAAGA ATAAATCAAA TAGTCCTGTA CCTTATAGAA 420
AGAGAGAGAA CAAATCCCAT GATCAAAACT GTGGCCAGGG ATAGTGGCGT ACACCATTAA 480
GCCCAGCATT TAGGAGGCCC AGGCAAGTGG ATCTCTATAA ATCCAAAAGA CAGCCTGGTT 540
CGTCTGACCA GCCAGGGCTA TATAGTGAGA CCCTATGTCA AAAATAAAAG AATAGTGTTG 600
TGTGTGGTAG CACATGCACT CCAGCACTTG GGAGGCAGAG ACAGGTGGAT CTCTGTGAGT 660
TCGAGACCAG CTTGGTCTAC AGAGCAAGTT CCAGGAACCA GACTCTGGCT GTGGACAAAG 720
CAGGGAGTCC TCTTACCCAC TGAGCCATCT CTCTAGCCCC ATATTTCCCC CTTTTAAACA 780
CCCCTATTCT TCATAAACTT GTCATTTGTC TCTCCAAAAT GAATACTCAG ATTCTCTTAT 840
CCTGTTTTTC TTTTCATTGT CTCCTACACA GAGAAACTTG TCTCAAGCAA ACAAAGAAAG 900
AGAATCGATG TCTGTTTTAG CTTTGGCTTC AGTATGAAGA AGTACTCTAA ACAAACAAAC 960
AAACAAACAA ACAGTTAAGA GCATGAACAT ATGTGTGCTT GGGGCTACTG TACAGCACTG 1020
GCCTTGCATA CATACATGGA GCCCAGGGTT CCATTTTCAA CACTAAAACA TGGAAAAAAC 1080
CTAAGGCCCT CCAGAGGTGT TTGTTGAGAG AATACAGATG TTGATTTTCT ATTTGTGTCT 1140
GGAGGCCTCA GGGTACCCAC TTCCAGCCTG AAGAACCTCT GGCCTAAAGA GGACAACCAG 1200
AACTTTTGCT TTCTCTTCTT TCTCTTTCCA CTCCTGCCCC TGGAATTGGC TTGGGGTTCA 1260
ACCCGAATTT TTGTTCTCTC CTTGTTGAAC TGATCCCTGC AGTATAGATT TTCTTCTCTG 1320
CAAAAAGGAC CGTGGGGAAA GATACCAGAA AAGGCAGTTT CACCTGGTCC CCACCTGCCC 1380
TCACTCCTCC TACTGGGATG TTTCCAGAAG GCTCTCAGGG CCCTGTGCTC CCCCAACTAA 1440
TCGTTTTCAT CGGTCCCTTG GGGAGCCTGT CTCCTGGGAT AATCGAAAGC AGACCGGAGC 1500
AGGAACACTG GTCAGCAGCC CCACCCTGTG CAGTCACAGT TGCTGCAGCC TCAATGACAA 1560
CCCAGCTGAA CCCTTTGTTG GGTTCGTGAC TTCAATCTAT TTGCAGAGCG CTGGCACCCT 1620
GCGCAGCTGA CAGAGCCCCA TTCACTGGCC CGGGACTCAC AGGACCACAC CCGCCCACAC 1680
ACAAATGAGA GCAGTTCAGG TTACATCAAC CTTGGAACCC ATGGCTACAA AGGAGGTTGG 1740
GAACTGGGTA GCAGGGCCGC ACCCCACCCC CCAGGTTGCT TGGGTGGCTG AAAAACACAG 1800
TTTGGCCTAT TCTAAATCTC TGGAGTAGCA AAAGCATACG GCGGCCCTGG TTGTCTAAGA 1860
TATCAGCAGG CAGGGGACAG TCCCACTCAC TTTCCCCCAG GGTCCATGGT ACAGTGTCAC 1920
ACCAAGCCTG GGACTTGTCT ACACTTGTCC TGTGCACCTA AGTCTAGCTT TAGTGCTAGG 1980
CTTAGCTCTT CTCTACTATG ATGCTCTGGC CTACGGATGC TGTTGCAGAC AGCCTTAGCA 2040
ACTGCAAGGA GTTTTTGGAA TCTTTGAGCA AGGTTACCAA GGTGATCCTC ACCTGGGCCC 2100
AACTTGGCAT CACCTTCCTC CCTTTGACCC TTTGACCCTG TGGCAGGTAC CTTGGTGTCC 2160
TCTGCCTCAC TGTTTATTTT TCAGCAGAGC CCTTTGGCTT CACTGCCCAG ATATAATCCT 2220
ATTATATACC ATTTTTCACT ATCATGACTA TACTATCCAA GTCCAATGTA AAGATGGCTT 2280
ACCAAGGCTT GGGACATAAC TCATTTGGTA CATGCTAACA CAGTAAGTGT GGAGCTCAGG 2340
GTTTGATCTA TTGTACCACA TAAATAGGGT GTGATCCATG CCTGTAATCA CAACACACAG 2400
AAGGTGAAGA CAGAAGGGCC AGAAATTCAA AGTCACCCGC AGTTCCAGGC CACCCTCACC 2460
CCACCCCCAC CCCCCCAAAC TCAAAAACTT CCCTGAAAAC TTCCCCAAAA TGACTTAGAA 2520
GCCAGACATG GCACTATAGC AGGACATCCC TATATAGTCT TAGCACTTGA AAAGCTGACA 2580
AAAGATGATC AGGTTCAGCC TGGGCTATAT GTAGTGACAA CCTATCTCAA TGGAAAACAG 2640
ACCAAACCAA ACAGCAGCAG CAGCAGCAGC AACAACAACA ACAACAGCAA CAACAACAAC 2700
AACTACAAAA CGAAACAACA AAAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAG 2750