EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM053-01415 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_J1 
Coordinate
chr1:134237430-134240350 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr1:134239078-134239089TTTGACCTTGA-6.14
ESRRBMA0141.3chr1:134239107-134239118AATGACCTTGA-6.32
EsrraMA0592.2chr1:134239108-134239119ATGACCTTGAA-6.62
EsrrgMA0643.1chr1:134239108-134239118ATGACCTTGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:134239029-134239050TTTCTCTTTTTCTTTCTTTTT+6.48
IRF1MA0050.2chr1:134239023-134239044TTCTTGTTTCTCTTTTTCTTT+6.76
Nr2f6MA0677.1chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.47
Nr5a2MA0505.1chr1:134239107-134239122AATGACCTTGAATTC-6.19
Nr5a2MA0505.1chr1:134239078-134239093TTTGACCTTGACCTT-6.21
RXRBMA0855.1chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.77
RXRGMA0856.1chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.41
RxraMA0512.2chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.53
SOX10MA0442.2chr1:134238863-134238874TGCTTTGTTTT-6.02
SPI1MA0080.4chr1:134238466-134238480AAAATGAGGAAGTG+6.59
Sox3MA0514.1chr1:134239203-134239213CCTTTGTTTT+6.02
ZNF263MA0528.1chr1:134240115-134240136GGGGGACGGGGGGTGGGAGGG+6.03
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07434chr1:134237910-134239064Intestine
mSE_08057chr1:134237759-134239271Kidney
mSE_08541chr1:134237720-134239719Liver
mSE_12577chr1:134236908-134240593Spleen
Enhancer Sequence
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACGCATTCA CGCACGAGAG AGAGAGAGAG 60
AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAACATGCA TGGATATTCA TGTGGGTAGG 120
TGGATGTCCA TGCCCATGTT TAAGTATGTG GAGACCTGAA GATTGGAGTT TTGACTATTG 180
CTCTCTTCCC TATTCCCTTA AGACAGGGTT CTCACTGAAC CTGAAGTTAG GCCGGCAGCC 240
AGCAAGCCCC AATGATTCTC CATCTGCCTC CCACAGTCCG GGTGTTATAG GGTCACAAAG 300
GCACACCCAG CTCTTTACGT GAGTGCTTGG CATTTGAACG CAAACCCTCA TGCTTGGAAA 360
GCAAGCAGTC TTGCTGTCTG AGCTGTTTCC CCAGGACCCT AAGTCTATGC TAAGTATGTG 420
CGCTTCCACC AAGCTACACT ACCAAGCTAC ACCTTTAAGT CCAAATGACT TTTGTTCTGA 480
TATAGAAGGG GAGATGTTTA ACTAGAATTT TTACCCAGTG TCTCCCTCAA ACTCAAAACT 540
GAGTAAGTGT CCTGTATTTT CGTTTTCCCA ATCTGGAAAT CCTAACATCA GGAAGATTGA 600
GGTTAGACAA TAGGAAGATC TTGGGCTATT GCCTTGGGCT ACTGACCCAC AGGATGAGAG 660
AATCTCCCAT TCTGGACAGC TTTAAAAAGG TGAGTGTGGC AAACTGGAAG ATGGTAGCAC 720
ACACCTTTGA TGCCAGCACT CAGGAGGCAG AGCCAGGTGG ATCTCTGTGA GTTTGAGGCC 780
AGCCTGGTCT ACAGAGCAAG TTCCAGGACA GGCAGGGCTA CACAGAGAAA CCCTGTCTTG 840
AAGCACAAAA CAAAACAACA AACCAAACCA AACGAAGACA AAACTGAGTG TTCCCAGGAC 900
CTAGTGGGAA GCCTTTAGAC ATTTAGGGCT ATCTTTACAG CCAAGAGACT CATCTTCTGT 960
AGCTGAGCTC AGGAGGATTC ACATAAAACA CAGGAAGTGG TGGAAAGTGA ACGAGATTAT 1020
CAGTGGAGTT CCTGCCAAAA TGAGGAAGTG ACACTGGGTG GAGGCAGGGG ACGCCTGAAG 1080
TCCCCAGAGA GGATGTCAGA GCAGGAGGTG CTGAGATCAT CTGGCTACCC CACCCCCCTC 1140
ACTTTGGGCC AAGGGGGGTG GCTGAGGGTG TGGAGCTGTG GGGTGAATCT GGAGGGTTGG 1200
GTGAGCCTCA GCAAGTAAGT ATAGCCGGGG CAGCAGGAGT TCAGGCCTTG GGAGAAAAAT 1260
CTTAAGATAT GTATTTGGGG GTAGAAATGA CCCCCCAAAG GGAAAGAAAG GTGGCCTCAG 1320
GATACTCAGC AGAGCAGGGG CTGATGTGAG TCTCTAGGGT CACCATAGGG AGCTCTGGGG 1380
CTCTCAGTCT GGTAAGAGAG ACAGGTGTGC CCTAGAAATC AGGTCGTCAA GCATGCTTTG 1440
TTTTCTTCCT CCTTTAGTGC ATACTGGGTG TGGTGCTGAA CCCCGGGAGT CCTGAACTAA 1500
ACAGAATATA CACTGCCCTT CAAAGCCTGG AGGTCCAGGG GAGGAGAGGT AAGTAAGTCC 1560
TTGTGAAATT GTAACTTTTA TAAGGTGAAG GACTTCTTGT TTCTCTTTTT CTTTCTTTTT 1620
GGTAGATAGG CTTATAGCTT GTGCTGGCTT TGACCTTGAC CTTATTCTGT AACTGAGAAT 1680
GACCTTGAAT TCTCGATCCT CCCCAGCTCC CCCTCACAGG CGGGCATTCC CCCATCATGC 1740
CAGGTTTCTA TAGAGCTAAG GACCAAATCT AGACCTTTGT TTTGGGTCAC TGACTCCCTT 1800
CCTTGGTGAG AGTTCAGATG TCATTCCTGT AGTGCCCCTC CACGAAACTC CATCTTTAGA 1860
CCCTACTGGG TGCTGTCTGC TACCCTACTG GGTGCAGATC TTTGGATAGG TAAACACTCT 1920
AACAACTGGA TAACAGCCAC AGCCTGGGCT GGACTTGAAT TTGCCACCAT CCCCACACCT 1980
CTGCCACCAG AGTGCTGTAC CAACAGCCTA GGCCAGCCTG CACAGGAGTC AAAGGTCACC 2040
ACCTGACCCC AATGTACCTC TCCAGCTGCT GCCTCTGTCC CCCACACTGC TTGCTTGCTC 2100
TGTGGAGTAA AGTAAAATTA ACTGGCTAAA CTGGGTGTGG TGGAGCTCAC CTTCAATCCC 2160
AGTCCTTGGG AGGCAGAGGC AAGCAGATCT CTATGAATCC AAGACCAACC TGGTCTACAG 2220
ATTGAGTTCC AGGACAACCA AGGCTATACA GAGAAACTGT GTCTCAAAAA TAAATAAATA 2280
AATAAATAAA TAAATAAATA AATAAATAAA TAAATAAATA AAACAAATTA GCTGGCTTGG 2340
AGAATGACTT AAAATAAGAA TAACTTAATA GCTTTCTTAT TGTTGGGTTG TTTTTGTAGC 2400
CTTGTCTGTG CTGGGACTCA CTCTGTAGAT CAGTCTGGCC TCAAACTCAC AGAGATCCAC 2460
CTGTCTCTAC CTCCCAAGTG TTGGCATTAA AGACATGTGC TACCATGCCC AGCCTAGCTT 2520
CTCTATTTTA GCTCCTCCCA TACCTACCAC AAGCTGGGAG AAGCTGTTGG GTGCTGGCCA 2580
GTCTGGCCTG GAACTCTGGA CCCTCCTGAA CAGGGTTTAC AGGTGTTCTG TACCACACCA 2640
GGCCTCTTGG GCGATTCCTA GGAGCCAACA CTGGGAATGG TGATTGGGGG ACGGGGGGTG 2700
GGAGGGCAGG TGTATTAGGA GTTAAATGAA TTCCCTGATA GACAGACAGA CAGACAGACA 2760
GACAGACAGA CAGACAGAAA GGCAGGCCCA AAATAAAGAA AAAGATGGCA AACTTTGGCT 2820
TCTTCCTCCT GATCAGAGAC AAAGGTCTAA AGGCCTGGTG AGCAGAGACC TGGATGTGTT 2880
GTTTCCATAA TCCTGGGCCT GTGAGCTTCC CTGACTGTTC 2920