EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM053-00246 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_J1 
Coordinate
chr1:25366320-25367570 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr1:25366614-25366634GGGTGGGGGGGGGTTGGTGT-6.51
RREB1MA0073.1chr1:25366607-25366627GGGCGGCGGGTGGGGGGGGG-6.5
RarbMA0857.1chr1:25367281-25367297TGAACTTTTGAGCCTC-6.01
Enhancer Sequence
ACACAGAGCA TTTACTTTAA AATTCACTTT TAGGAGTCTT CCTGATGTTG GAGATTGCAA 60
GCCATCCCTG GGCAATTTAG CAATTCAAAG GATGAGGAGT CTAACACATA GATTTGTCTT 120
TACTTCATCA CAGTTGACTG CCATCCAACC ACCAATGCCT CATAGACACA TGCCCAAACT 180
CAGGAAATAA TAGCACAGGT ACTACCTTTC CTTTCAGATC AGACAACTAA TTTATCCAAA 240
TTTATCTTTT CCTTGGGCCA CACAGACATG TTCCTCGATG CTCCTGGGGG CGGCGGGTGG 300
GGGGGGGTTG GTGTTAGCTG TGAACTCTGT ATTTTTCAAA AGGAAAGTAA ATCATTTTGA 360
ATAGGGAACT AACACTGGTG TTTCCAGGAA CATCAAACTA TTTCTTGGAA TGCTATGTGT 420
AACTCAGGCT TCCTGATACT CTAGGTGCTT TCTCAAGTGT TCCTAGTACA AAAACTCCCC 480
ATCCATCTAT TTTATTCAGT TCTTCTAAGC AGGATAAGCA TGATATTTCC TATAATTATG 540
TACTAGTATC TGACTCTTTT ATAACTTTAG TATGTTACAG AGCTGAGCAG GAGCAATTCT 600
TGGTGTATTG TGAATATTTA TTTGTTCATG GAATCTTGAT ACCAACACAG CCATTTTATT 660
ATCAAGACTG CTTACAGACA TAAGATTGAG CGTTAACAAG AACCAGTAAC TTGAGCACAG 720
CCTCACAGCT GGAGAAGCGA AGAGGGATTG AAAATAGCTC ATTCACATGT AGAGTAGATG 780
CTTAGCCCTT CCTGCTGGGT CTCCTTTCTG TCTCAGAAAG AAGTCTGGTG TCTTGCCTGC 840
ACTGCAATGT TAAGCCTCCA GGAAAGCTGG TCCTCTAAGA GAGTTAATAG GTTGGTAATG 900
ATGTAGCTTG ATTCAGTCCC CCTAACCCTC TTCCCTGAGC TTTAGTTTAG TTTAGTGGCT 960
TTGAACTTTT GAGCCTCCTG TCTCCACTTC CCAAGTGATA TAACTGCAGT TCTATCTGCT 1020
ACACCTAGTT TGTGCAATGC TGGAAATAGA ACCCTAGATT TGTGGAGCAT GCTAAGCAAG 1080
CACTCTGCCT ACTAAACTAC ATCCCCAGCC CCCTTTCTAG TTATTATGAT GACATTGCAA 1140
CCCAGTCTTC AAACAGTAAT TGGTGAGACC ATTTTAAAAA ATTAAACCAA TACGGCATCC 1200
AGCTTCATTA GCGAAAAAGC CCCATGTTCT TTCCCGGTGT ATTTGAAAAC 1250