EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM048-12388 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_D0 
Coordinate
chr4:140258550-140262470 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr4:140261309-140261326CGCACTAATTAAAACTT+6.05
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:140261095-140261113CCCTCCCTCCCTCCCTCC-6.03
EsrraMA0592.2chr4:140260229-140260240TTCAAGGTCAA+6.14
GLIS1MA0735.1chr4:140258814-140258830CGACCCCCCGCGGAGC+6.11
GLIS2MA0736.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+7.73
GLIS3MA0737.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+6.08
KLF16MA0741.1chr4:140258656-140258667GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr4:140258657-140258667GGGGCGGGGC-6.02
RREB1MA0073.1chr4:140262130-140262150TCCCACCCCACCCCCACCCC+6.75
SP1MA0079.4chr4:140258655-140258670GGGGGGCGGGGCCTG-6.65
SP2MA0516.2chr4:140258654-140258671GGGGGGGCGGGGCCTGG-6.26
SP3MA0746.2chr4:140258655-140258668GGGGGGCGGGGCC-6.11
SP4MA0685.1chr4:140258653-140258670CGGGGGGGCGGGGCCTG-6.47
ZEB1MA0103.3chr4:140261910-140261921CCCACCTGCCC+6.14
ZIC1MA0696.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+6.65
ZIC3MA0697.1chr4:140258815-140258830GACCCCCCGCGGAGC+7.03
ZIC4MA0751.1chr4:140258815-140258830GACCCCCCGCGGAGC+7.37
ZNF263MA0528.1chr4:140261087-140261108GCTTTTTCCCCTCCCTCCCTC-6.12
ZNF263MA0528.1chr4:140259033-140259054CCCTCTACCCCCTCCGCCTCT-6.26
ZNF263MA0528.1chr4:140261930-140261951GGAGAAGGAAGGGAAAGTAGG+6.33
ZNF263MA0528.1chr4:140261091-140261112TTTCCCCTCCCTCCCTCCCTC-7.02
ZNF263MA0528.1chr4:140261095-140261116CCCTCCCTCCCTCCCTCCACC-8.03
ZfxMA0146.2chr4:140258656-140258670GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_06341chr4:140258775-140260632E14.5_Liver
mSE_09854chr4:140258736-140259613MEF
mSE_10193chr4:140258722-140259716Embryonic_stem_cells
mSE_10193chr4:140259772-140261059Embryonic_stem_cells
mSE_10193chr4:140261216-140262729Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
ACCCCCGCGT CTCTTCCTCC CCCCGAGGGG GGAGGGCAGT CCGCGGGGAG CAGCCGGCTC 60
GCGCCGGGGC TTTGAGGTTC CCGCCGCTGC GGCTCGGGCG CCCCGGGGGG GCGGGGCCTG 120
GCGCGCGGCG CGCATGCTCC GTGTTAGCCC GGCGCGGTCG GCCCGGCCGG TGCGCGCGGG 180
GCATGGTGGG GGCCCGCGCG GCGCGGCCGT GAGCGCGCAT GCTCCTCGGA GGCCCTCCCC 240
ACCCCGGGGC TCCCCTCCCA CCCGCGACCC CCCGCGGAGC GGCGCTGGGC TTTGTCTGCC 300
TCGGGTCCTC GCGGCGTGGG GGCCAGTGGG GTCGGTGCTC CCCTGAGGCT CCGGTCTGGG 360
CCGTGGAACT TGAGCTTTCG CGGGGGCGGG GGTGGTGGTG GAGAGGAAGC CCCGCAGAGC 420
CGGGCCCAGG GTCCGCTTGA GTCTCCGCCA GAACTTTGTA AAAGCAAGTT TTCGGTGATA 480
CACCCCTCTA CCCCCTCCGC CTCTGTGTCC CGGAGATCAC GTTCTCTGTT AACTCTAAGA 540
AAGAGATGGA GCTTGACCCT CGGGAGAGTG TTGCCCATGT TCCCAAGGGT GTTCTGCAAA 600
AGGTGGCAAG GGCACACTAA GAGGGGTAGA AGAGTCCTAA CCATCTTGCA GTAGAAGAAA 660
GGTTCCCGCT AGGCATGCAG AGGGGCCCTG CATGAGGTAG GCTCGCCAGG TAGACCGGTC 720
TTAGCCAGAG TATTGGAAGG GTAACTCACA AGCTGCTCTA TTTATTGCCT AGTGGGTTTG 780
GACAAGGCTA AGAAGTTGGG CATGATAGGG TCTTTTCTCT GCTGCATCGG GTTGTCCTGA 840
AGTTTAGGAA AGCCATGTGG AGTTGGATTA TTTTGTGAGT AGGAAAAAAA AAATCAGTAA 900
GACAATGACT GCTCGTAGGG GTGGCAGAGG GAAGGCATTT ATTGTGGATT AAACAGAGAC 960
ACAGGCAGGG ACATCAGAGA AGTCTGACCC TTGGGGGGAG TGAGGATAGG AACCAGGTGC 1020
AGGAGCCGCC CGAGTAAAAG AGGGGACCAA AATGGTCGGG TTATATAGAG AAGAGTAGGT 1080
AGGGGGAGAG GGTAGCTTAG CCTGTGGGCT GGATTAAGTT TAGGGTAAGG GGCGGGGGTA 1140
TATCTGCCTG GAGTGTCCGG TAACAGGTAC TGTGAGGGAT GCCGGGAGAT CCTAGTTACC 1200
AGTTCTGCTT TGATATGTTA AATAGTCCCC TCCGCTCTTT GTCCTGGTTT TGAGACTTCT 1260
GCCAGGGCCT GGTGAGTTCC AGGGTCTGCA GGCTGTTAAC CCTCTCAGGG ATGCACGTGA 1320
GTGGAGTGGA GGAGGGGCTC AGAGGCCTCT ATCTCCAAGG GTCTTGTATC AGAATTGGCA 1380
CCTTGTGTGC TATGAGGAGA TGCCATGTCT GAGAGGAGGC AGTCCCCTGT AGTTTGTGCT 1440
TGTTCTGTGT GTACAGCTAA CTTCCCATAT CTGTGTAGAA CCGGAGCTTA AAAAGGGCTT 1500
TGTGTCCATC CCCTTAAAGC TAGGGGGACT ATCACTGTAG AACCGACCCC TCAGTGGTCA 1560
GTTAGGGGGT GGTTGGATAA GTGAACCCAG GGGCCTCTGG GGACTTAACT TTCTCGCTGT 1620
TACACCTGGG AAGTGTGTGC TTCCAGCTTC TGCCCCTGTT AGGGTCAGGT TGAGTTTGGT 1680
TCAAGGTCAA GAACACAGCC TTGCAGCCTA GGCTGGCAGA CTGCCCAGTG TCTCTGGCCT 1740
AAGGGCTGTG GTCTCCCTCT GCTAGGCAGA CACAGGACTG TCTCTGCAGT CGGCCACTAT 1800
CCTGGATATT TCAGAAAGCT ACTTAACTCG GCAGAGACCA GCCTCTCCCC TGAGGGAGGC 1860
TCCTCTGCCA GTGTCTGGGC CTCCTGCCTT CACTTTTCCC TTACCTTGAA CTTGAAGTTG 1920
TCTTGGGCTT GGGAAGATGA GCCATGTGTT CTGTTGAGTT GTCCTGCTAG AGTTAGGTGG 1980
GTTAGGAAAA TCAAACAGTA GTCCTTAAGA GTCGATGTGT GGAAAACGAG CCTTCAGTCT 2040
TGTCCTATGA TATTCAAGGA CCTGAGGCTC AGGCGCAGGC ATCCAGCTCT GTGTGTTAAA 2100
TCGGGGTTGC TAGGGTTTCA CGGACCCTGC AACATAGTGT TGGTTCTTAG TGCAGTGGGA 2160
GGAGGGTTGG TAGGGATGGT TGTTGCCAGC CTCTTGCTCC CTGGTTCTCC TAGTCCCTGA 2220
GCATCAGTCT CCTAAATGGA TGTGTTTAAA GGTGGACTCT CGGCCTCACT CAGGGAGTGT 2280
ATGTACTTGG GTGGTAAGTC AGAAACTGCG GTGGCCAGGA AGCCCCCGTT TGCTGATTGG 2340
AGACACTTGG TGCATTTTCT GCCTTGGCCA CTCATCTGCA TTCAGGTCAC ATTCAGGTGA 2400
CCTGTCCTGG AGAGGTAGCT AGGTGAGGTT GAGTTCACCC GACCTGGACT GTTGGTTGGG 2460
GTACAAGTGT AGGCTGTCAG ACAGATGCAG TCATGTCCAG GCTGAGTTAG CCCCGGAGAG 2520
CAGGAAGACC TCTGCTTGCT TTTTCCCCTC CCTCCCTCCC TCCACCTGTC CATTCCTCCG 2580
TCCTTTTGAT GCTGGGGACT GAACCCAGGG CTAAGCACAA GCTCTTGCAC TGAGCCCCCA 2640
TTTGTTCACT GGGATGGCCT CTCCCCCCAT TAAGGCCAGC AGGCTTATGG GATATGTTGT 2700
TGATAGTCTG TGGATGAGGG GTTTGTTTGG ACAGGGGCTT GACTGAAAGT GAGTTGAATC 2760
GCACTAATTA AAACTTTGTA TTCCATAAGG AGGGGAGAGT AAGTAAGCTG TAGAGGGGTG 2820
AACAGTTGAG TTAATAGCAA ACGGGGTGTA GGTGCTCGCA GTGGATACGG TGAGCTGTGA 2880
GAATGGGGTT TGTGATGGAG AAGCTGGGGC CAGGGTAGCA GTTAGTGTTC TTGGGAAGCC 2940
AGGCAAGGTT GTCCACAGGT CTCTTTTTCC GAAGGGTGGG ACTTTCGAGT CCCTGTCTAT 3000
CAGCCATCGC GAGTTTGAGG AGCCACAGGG ATGGCAGTGG ATATTGGCTA CCAGCATTCT 3060
GCACCCTGCA TCCTGCCCAA GCCCGTGGCC TGGTGGCGCT CTGGGATCGG AGTGACCACA 3120
TCTCGGTGTT GGTGAAGGTC GAGCTTGGGA ACCTCCCAGC TTCTCTCCCC TCAGAACCTG 3180
CTAGCGCAGC GCTGTTGGGC CTGGGCTTGT GCTGGTTTTG AGGCCTCTCC CCTATGTTTC 3240
TGGGGCCCCT TCAAAGTGCA GACCTGAAGA GTAGAGTGAA TGTATGTGTC CGTGCACAAG 3300
TAAGTGTTGG CCCTACTGCG GGCCCAGTGC CATGGGCTGA GCCTGGTAGG ATATTCCAGC 3360
CCCACCTGCC CTTCAACAAA GGAGAAGGAA GGGAAAGTAG GCTTCCATCC CGTTCAGGTA 3420
ACTTGAGTCT GGCCCCACAC CCCACAGGAG GTCTGAATAA TTGAACTGGG TGGCTACTCC 3480
ATCCTTGTGA GGCCTGGGTT GGCCAGGCAG GTCCTGAAGC TTGATCCTGG CCTCTGCCTT 3540
TTGGACCTGA CTGGAAGTAG GGGACACCGG GGAGATCAGG TCCCACCCCA CCCCCACCCC 3600
CCCAAAAAAG TGTGCCTGCT GGGGACTTGT AGGATGCATT GGGTGTGTTG GGACAGCCAG 3660
CCAGGGGCCA TTGTGGGGTG GAAACTATTG GAGCTGCGGC CACTGTTCAG GGGCAGGCGC 3720
ACAGATTGAG CCTAGCAGCC CGTTTATTTA TCTGCTTTTA TTTATCATGT GTTTGCTTAC 3780
TGTTCTGGGG ATGGAACCTA AGCTTACTCT GCCCAGGCTA GACCTAATTA GCCCACAGTG 3840
TGCTTTTCAT TTAGCATACT TGTGCACATG TGTGTGCCTG CTCACACCAC GTGAGTGCAG 3900
ACGCCCTCAG AGGCCCAAGG 3920