EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM046-00806 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
ESC_Bruce4 
Coordinate
chr12:88238310-88241800 
Target genes
Number: 8             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr12:88239677-88239689TTCTGTTTACTG-6.02
Nr5a2MA0505.1chr12:88241611-88241626GCTGTCCTTGGACTC-6.15
STAT1MA0137.3chr12:88240993-88241004TTTCCAGGAAA+6.62
Sox6MA0515.1chr12:88238385-88238395CCATTGTTTT+6.02
Stat4MA0518.1chr12:88240993-88241007TTTCCAGGAAAATG+6
ZNF263MA0528.1chr12:88240283-88240304TAAGGAGGGTGGGGGTGGGGA+6.34
Number of super-enhancer constituents: 20             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00508chr12:88216909-88247711pro-B_Cells
mSE_04041chr12:88237426-88239670Cortex
mSE_04393chr12:88230946-88239810E14.5_Brain
mSE_04826chr12:88237235-88239347E14.5_Heart
mSE_04826chr12:88240190-88241540E14.5_Heart
mSE_05546chr12:88236927-88239057E14.5_Limb
mSE_05546chr12:88240047-88241064E14.5_Limb
mSE_06629chr12:88236956-88239766Heart
mSE_06629chr12:88240141-88241358Heart
mSE_07182chr12:88237496-88239645Intestine
mSE_07966chr12:88237433-88239505Kidney
mSE_08366chr12:88236789-88239301Liver
mSE_08366chr12:88240199-88241366Liver
mSE_09005chr12:88237440-88239943Lung
mSE_09434chr12:88237475-88239673MEF
mSE_09434chr12:88240021-88241690MEF
mSE_10025chr12:88237442-88242460Embryonic_stem_cells
mSE_10713chr12:88233732-88239963Olfactory_bulb
mSE_12621chr12:88237510-88238955Testis
mSE_13002chr12:88237464-88238891Thymus
Enhancer Sequence
ATTCCTGGAT ATTGCACAAG AGGACAATGA GGCTATTTTG GGGGTTGTGA GTGTATCTGG 60
CACCGACCCC GGAAGCCATT GTTTTCAGGA GGGAGAATGT TTTAGGGTTT CCTGGTGCTT 120
TCCTTCTAGA GTCTCAAGGG CTCAGGGGAC ACTGTCAGGG GCAGAGGCAA GTGCAGCTTC 180
CATGGGTAAC CCTGTAGACT GTATTTTGAA AGGGCCAGTA TGGGAAGTGG GTGGTTAGAC 240
CAGTGGAATG GGGCAAAAGT CTCTCTCTCT CTCTCTTTGC AAAGGAGGGC ATATGTGGCT 300
ATGTGGATCA TTTGAAGTGG GAGAGACAGA GGGAAGGGAT AAGAAGAGAC ACAGCTCACT 360
ATATAGCTCT GAGGCCTGAT GTCTCCTGGG ACAGAGGCCA CCTTTTCTCC ATACTCACTT 420
TCAAACCCTG GAGCTGATGG AAGAATGGAA AAGGCCTCTC CCTCTATCTG GCAAATGGAG 480
TCCCTCATCC TTTGTCCTGA TTAGTCAGTC CCAAGCCTGC TGAGATGGAA CACATTCGGG 540
AGAGTGTGGC TGTGGATGAG GTTGGACTCT CAAATCACAA GCGATGAATT CTTGCTGTCT 600
GGGTGGCCAG CACTCTTAAT GAAAAGGCAC AGACTCTCAA AATCCAGAAT CATCGGCCAG 660
CATGGAGCCA GGCCGCCGGC CACTGCCACT GATCTAAAGC CAAGGAGTAA AGCAACTTCC 720
ATTAACCTGA GTATCCACCA CTCAGCCCCA CCCCACATGA TGATATCAGG GTCCAGCACC 780
CCCTACCCTG CCACCCCAAC CGGGGGAGCT TGGCGACAGT TGTGCAGACA GCAGCTGAGG 840
CTTCAGCTGC CTAAAATACC ATTTGTTCAG TTCTGCTCTG TCTGGCTGAC ATCTACATAT 900
TTAAAGGGCT CTGGTGTGCC TCCCAAGTCC CTTCCTCATC TGAATCCACA GGCAAGGGAC 960
ATTTGGGAGG GCAGGGGATC TACAAGGGGA CTGATACTCC CCTTTCTGCC TCTAGCAGAG 1020
GCACTGTCAC CTTCCAGGAG GAACCCAGAG CCACATTGGC AAATTGTGTG TGTGTGTGTG 1080
TGTGTGTGTG TAGCAATGGA CTTATTGGGC ATACTTAGGG GGCATAGGTA AGAGACTATT 1140
TACAGGAGCG TGGGTGGGTG ACCCCCAAAC AGCTGTATCA CTGCAGTGCC CCACCCCATC 1200
TCAGGAGCTG CATCTCAGAG TCTCAGTTTC AATTAATCTT CCCCTTCCCA CGTACTTCTT 1260
ATTGTTTCTG AGGCAGGGTC TCCCTCAGGA GCCCAGGTTC CTAACTCCGC CTTTCAGTCC 1320
CTGAATTCTA ATTTTGGGCC AGAGAGGCAC AAATCCCCAA ATTAAGTTTC TGTTTACTGG 1380
GGTGTTGCAT AGACTTGGTT TTTGTGTTTG TGTTCTGTTA TGTTGATGAT TGAACCCAGG 1440
GCTTCAGGCT TGCTGGGAGA GTACCCTGGA GCTACATTCC CAGCCCCAAG GACTTATTTC 1500
ATGCAAGATG TCATGCTTTG AATTAAAAAG CCCAGAGCTT AGGTTGGAGT TCAGAGGACC 1560
TGAGTTAAAT TCCAGCACCC GTACCAAATG GCTCATAAAG GTCTAATGAT AGATGTCAAC 1620
CTCATTTGGC CTCTGCTGGC ATGTGTACTC AGACACACAT ACCTATCCCC TACACACACA 1680
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACCCTTAAT ACATCTTTAA GTCAGGCGTG 1740
GTGGCACACA CTTTTAATCC CAGTACTCGG GAGGCAGAGG CAGGTGGATT TCTGAGTTCG 1800
AAGCCAGCCT GGTCTACAAA ATGAGTTCCA GGACAGCCAG GGCTACACAG AGAAACCCTG 1860
TCTCGAACCC CCCCCCCCAA AAAAAAGTCC CAGAGCTCAT GAATAAGCAG AAATATTTCT 1920
GAATCTTCCC AAAGAAATAT TTGAATTTGA CTTTTTGCAT TGCCCCTTGC ATATAAGGAG 1980
GGTGGGGGTG GGGAGAATAA ACCTGGCCAA GGCCTTTAAT CTCTGTAAGA CCTCCTAGAA 2040
TCCTACCGGT TTTCCCTAGG ACAACAGCCC ACTCCTGTGG ACTTATAGAC ATGTAGAGGA 2100
GAACCAGAGT CAGCTCCTGG GCTTCCTGGG TTTCTGGACT TCCGGCAGGG TCTCCACTGT 2160
CAGGAGGGGC GTTCCTCCCT TACCTTACAG CCTTAGCCTT AGGATTTCTG GCAGTTTCCT 2220
AAGAACTCCA CAGCTGGAAT CCAGCTGCTT GGGGTGGAGT AAGTTGAACT CTTGGTAGGT 2280
CAGCAGGGTG AGCAAGGGCA GGGTCTGTTG GAAGGTTGGG AAAGTCCTTG CCTGAGCCAG 2340
AACTCAGGAA TGTGCTGGGA CCTCTGCTGA GAAAACCTTC CAGATGGGGG AGGGAAGGGG 2400
AAAGTGTCTG CCTTCTGGGT AAATTTTTTT TTTTAAATCA CCCCAGGGAG GTGGACTGTT 2460
TTGAAACTGT CTTTTAATGT GAATGTTTAA ATTGACCTGG AAATTTCCTC CCTTTTCTGT 2520
CCCTACAGTT CGAATCTGTT CCGCTGCGCA GTAACCAACA GGGACATTTG CCTTAGGGTC 2580
GCTCTTCCTT CGCCTCTTTG AATGTTTTAA AAAAAAATTA CTGTTGTTGT TATCTTTAGT 2640
TCGGGGAAAC TTTTGGATGC TTTCCAGGCT GCGGCTATAG AAGTTTCCAG GAAAATGGAA 2700
AAGCAGCATT AGTGTTTTGG ACCTGTCTGG GTCGTGGGCT AGACGTGTTG TTTTTATTTT 2760
TTATTTTAAT TTTTTTTAGA ATGCATGCAA TAAGGGCAGC CAGGTCCTGT GAGAGAAGCC 2820
AGCAAGGCAG AAGGGCCTAA GAGCATCCTA AAGCCCAGAG ACAAACGTGG AGTTTAGCTG 2880
ACCTTCCTCT TCTTGAGCCG CAGTCACAAT TGTGGGTTGA CACTTCAGGT GTTGGGTGTG 2940
GAGGGAAGTG AGAACTTCAA GCCCAAGCCA TCGGAGAGGC AGGTGGGCCA GGGAAACAGT 3000
CTTGGGTGTT CACATTTTAG AAACTTGTAG CCCACATCAG AAGGCTACAA ATCAGTGAGC 3060
CAGGTCCCAA GGTGGCAGGG CCCATTATAG ACAGAAGGAC AGGGTATGTC TTGGTTCTAA 3120
GAAGCATGCA CCATGCACCG TGCTTCAAGA GCAAAGAGAC AGACAAAGTC AGAGAGTCCC 3180
ATGTAAAGTC AGAGCTGCAT CAGGAGGGGA AGAATCAGGT TTTTGCAAAG CAGCTCCTCC 3240
TTGCCTGCTC AGGGTTTCTC TGTGTAGCCC TGGCTGTCCT GGAACTCATT CTGTAGACCA 3300
GGCTGTCCTT GGACTCACAG AGTTCCGCCT AACTCTGCCT CCCACCACCA CCTGAGCATA 3360
TGTTCAGTTT TTACCTCTAT CTTATAAGTG AGAAAGCTGA GACTTAATGA TTAAGGAACT 3420
GAACTCAGAA CACACACAAC TGGTAGGTGG TAAGCCATGT TTGAACTCAG GGTTAATTTT 3480
GCAGACAGAC 3490