EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM044-05701 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Erythroid_spleen 
Coordinate
chr3:60302490-60305100 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
GGCTTACTGA TGGCAACATT GTTTCAGGCC TTACTTTATT TTGGCTCACG TCTAAGGTTT 60
AGATTGGCTT GGATGCCTTG TCATGGCTTT CTTTTTCTCT TTATCTCTGT AAAATAACAT 120
TTTCCTTTGA TTTGCTCTTT CCTAGACTAT TGTATTGTTT CTAACATTCA GGTGCCTTTC 180
TTGTATTCCT TTTTTGTTCT ATTTGATGGA GCAGAAAATT TGAGTTTGTT TCGATTTTTC 240
TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT GATAGTTTCC CCTCTTGTAC 300
TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC AAATTTTCTA 360
GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC CAAAAAACCC AAAACCAAAA 420
AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA CTGTAAATTA ATCCTTCAAA 480
CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG GTGCAAAGGT 540
AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA CTGAAAACAA 600
GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC AAGGCCCATC 660
CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT TACCCTTCCT 720
TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA AGATCTTTCT 780
AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT CATAGTTTGC 840
TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC CTTTTAAAGA 900
AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC TTCTTGCACG 960
TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC TGTGCCTATG 1020
ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT TACCTTCCAT 1080
CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT TAACTGGCTA 1140
ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA CAGACACTTG 1200
CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG 1260
GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC 1320
TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT 1380
CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA 1440
CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT 1500
ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT 1560
GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT 1620
CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT 1680
TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA 1740
GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT 1800
CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG 1860
TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA 1920
ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT 1980
ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT 2040
CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT 2100
AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT 2160
ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG 2220
TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA 2280
TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC 2340
CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC 2400
TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT 2460
CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA 2520
GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT 2580
GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2610