EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM037-22265 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Embryoid_body_cell 
Coordinate
chr4:140258570-140261230 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:140261095-140261113CCCTCCCTCCCTCCCTCC-6.03
EsrraMA0592.2chr4:140260229-140260240TTCAAGGTCAA+6.14
GLIS1MA0735.1chr4:140258814-140258830CGACCCCCCGCGGAGC+6.11
GLIS2MA0736.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+7.73
GLIS3MA0737.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+6.08
KLF16MA0741.1chr4:140258656-140258667GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr4:140258657-140258667GGGGCGGGGC-6.02
SP1MA0079.4chr4:140258655-140258670GGGGGGCGGGGCCTG-6.65
SP2MA0516.2chr4:140258654-140258671GGGGGGGCGGGGCCTGG-6.26
SP3MA0746.2chr4:140258655-140258668GGGGGGCGGGGCC-6.11
SP4MA0685.1chr4:140258653-140258670CGGGGGGGCGGGGCCTG-6.47
ZIC1MA0696.1chr4:140258815-140258829GACCCCCCGCGGAG+6.65
ZIC3MA0697.1chr4:140258815-140258830GACCCCCCGCGGAGC+7.03
ZIC4MA0751.1chr4:140258815-140258830GACCCCCCGCGGAGC+7.37
ZNF263MA0528.1chr4:140261087-140261108GCTTTTTCCCCTCCCTCCCTC-6.12
ZNF263MA0528.1chr4:140259033-140259054CCCTCTACCCCCTCCGCCTCT-6.26
ZNF263MA0528.1chr4:140261091-140261112TTTCCCCTCCCTCCCTCCCTC-7.02
ZNF263MA0528.1chr4:140261095-140261116CCCTCCCTCCCTCCCTCCACC-8.03
ZfxMA0146.2chr4:140258656-140258670GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_06341chr4:140258775-140260632E14.5_Liver
mSE_09854chr4:140258736-140259613MEF
mSE_10193chr4:140258722-140259716Embryonic_stem_cells
mSE_10193chr4:140259772-140261059Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CCCCGAGGGG GGAGGGCAGT CCGCGGGGAG CAGCCGGCTC GCGCCGGGGC TTTGAGGTTC 60
CCGCCGCTGC GGCTCGGGCG CCCCGGGGGG GCGGGGCCTG GCGCGCGGCG CGCATGCTCC 120
GTGTTAGCCC GGCGCGGTCG GCCCGGCCGG TGCGCGCGGG GCATGGTGGG GGCCCGCGCG 180
GCGCGGCCGT GAGCGCGCAT GCTCCTCGGA GGCCCTCCCC ACCCCGGGGC TCCCCTCCCA 240
CCCGCGACCC CCCGCGGAGC GGCGCTGGGC TTTGTCTGCC TCGGGTCCTC GCGGCGTGGG 300
GGCCAGTGGG GTCGGTGCTC CCCTGAGGCT CCGGTCTGGG CCGTGGAACT TGAGCTTTCG 360
CGGGGGCGGG GGTGGTGGTG GAGAGGAAGC CCCGCAGAGC CGGGCCCAGG GTCCGCTTGA 420
GTCTCCGCCA GAACTTTGTA AAAGCAAGTT TTCGGTGATA CACCCCTCTA CCCCCTCCGC 480
CTCTGTGTCC CGGAGATCAC GTTCTCTGTT AACTCTAAGA AAGAGATGGA GCTTGACCCT 540
CGGGAGAGTG TTGCCCATGT TCCCAAGGGT GTTCTGCAAA AGGTGGCAAG GGCACACTAA 600
GAGGGGTAGA AGAGTCCTAA CCATCTTGCA GTAGAAGAAA GGTTCCCGCT AGGCATGCAG 660
AGGGGCCCTG CATGAGGTAG GCTCGCCAGG TAGACCGGTC TTAGCCAGAG TATTGGAAGG 720
GTAACTCACA AGCTGCTCTA TTTATTGCCT AGTGGGTTTG GACAAGGCTA AGAAGTTGGG 780
CATGATAGGG TCTTTTCTCT GCTGCATCGG GTTGTCCTGA AGTTTAGGAA AGCCATGTGG 840
AGTTGGATTA TTTTGTGAGT AGGAAAAAAA AAATCAGTAA GACAATGACT GCTCGTAGGG 900
GTGGCAGAGG GAAGGCATTT ATTGTGGATT AAACAGAGAC ACAGGCAGGG ACATCAGAGA 960
AGTCTGACCC TTGGGGGGAG TGAGGATAGG AACCAGGTGC AGGAGCCGCC CGAGTAAAAG 1020
AGGGGACCAA AATGGTCGGG TTATATAGAG AAGAGTAGGT AGGGGGAGAG GGTAGCTTAG 1080
CCTGTGGGCT GGATTAAGTT TAGGGTAAGG GGCGGGGGTA TATCTGCCTG GAGTGTCCGG 1140
TAACAGGTAC TGTGAGGGAT GCCGGGAGAT CCTAGTTACC AGTTCTGCTT TGATATGTTA 1200
AATAGTCCCC TCCGCTCTTT GTCCTGGTTT TGAGACTTCT GCCAGGGCCT GGTGAGTTCC 1260
AGGGTCTGCA GGCTGTTAAC CCTCTCAGGG ATGCACGTGA GTGGAGTGGA GGAGGGGCTC 1320
AGAGGCCTCT ATCTCCAAGG GTCTTGTATC AGAATTGGCA CCTTGTGTGC TATGAGGAGA 1380
TGCCATGTCT GAGAGGAGGC AGTCCCCTGT AGTTTGTGCT TGTTCTGTGT GTACAGCTAA 1440
CTTCCCATAT CTGTGTAGAA CCGGAGCTTA AAAAGGGCTT TGTGTCCATC CCCTTAAAGC 1500
TAGGGGGACT ATCACTGTAG AACCGACCCC TCAGTGGTCA GTTAGGGGGT GGTTGGATAA 1560
GTGAACCCAG GGGCCTCTGG GGACTTAACT TTCTCGCTGT TACACCTGGG AAGTGTGTGC 1620
TTCCAGCTTC TGCCCCTGTT AGGGTCAGGT TGAGTTTGGT TCAAGGTCAA GAACACAGCC 1680
TTGCAGCCTA GGCTGGCAGA CTGCCCAGTG TCTCTGGCCT AAGGGCTGTG GTCTCCCTCT 1740
GCTAGGCAGA CACAGGACTG TCTCTGCAGT CGGCCACTAT CCTGGATATT TCAGAAAGCT 1800
ACTTAACTCG GCAGAGACCA GCCTCTCCCC TGAGGGAGGC TCCTCTGCCA GTGTCTGGGC 1860
CTCCTGCCTT CACTTTTCCC TTACCTTGAA CTTGAAGTTG TCTTGGGCTT GGGAAGATGA 1920
GCCATGTGTT CTGTTGAGTT GTCCTGCTAG AGTTAGGTGG GTTAGGAAAA TCAAACAGTA 1980
GTCCTTAAGA GTCGATGTGT GGAAAACGAG CCTTCAGTCT TGTCCTATGA TATTCAAGGA 2040
CCTGAGGCTC AGGCGCAGGC ATCCAGCTCT GTGTGTTAAA TCGGGGTTGC TAGGGTTTCA 2100
CGGACCCTGC AACATAGTGT TGGTTCTTAG TGCAGTGGGA GGAGGGTTGG TAGGGATGGT 2160
TGTTGCCAGC CTCTTGCTCC CTGGTTCTCC TAGTCCCTGA GCATCAGTCT CCTAAATGGA 2220
TGTGTTTAAA GGTGGACTCT CGGCCTCACT CAGGGAGTGT ATGTACTTGG GTGGTAAGTC 2280
AGAAACTGCG GTGGCCAGGA AGCCCCCGTT TGCTGATTGG AGACACTTGG TGCATTTTCT 2340
GCCTTGGCCA CTCATCTGCA TTCAGGTCAC ATTCAGGTGA CCTGTCCTGG AGAGGTAGCT 2400
AGGTGAGGTT GAGTTCACCC GACCTGGACT GTTGGTTGGG GTACAAGTGT AGGCTGTCAG 2460
ACAGATGCAG TCATGTCCAG GCTGAGTTAG CCCCGGAGAG CAGGAAGACC TCTGCTTGCT 2520
TTTTCCCCTC CCTCCCTCCC TCCACCTGTC CATTCCTCCG TCCTTTTGAT GCTGGGGACT 2580
GAACCCAGGG CTAAGCACAA GCTCTTGCAC TGAGCCCCCA TTTGTTCACT GGGATGGCCT 2640
CTCCCCCCAT TAAGGCCAGC 2660