EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM033-03117 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cortex_embryo 
Coordinate
chr6:86001390-86004130 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr6:86002385-86002396GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr6:86002386-86002396GGGGCGGGGC-6.02
Myod1MA0499.1chr6:86003262-86003275GGTAACAGCTGCT-6.33
RFX2MA0600.2chr6:86002120-86002136AGTTACTATAGCAACA+6.33
RFX2MA0600.2chr6:86002120-86002136AGTTACTATAGCAACA-6.35
RFX3MA0798.1chr6:86002120-86002136AGTTACTATAGCAACA+6.13
RFX5MA0510.2chr6:86002120-86002136AGTTACTATAGCAACA+6.61
RFX5MA0510.2chr6:86002120-86002136AGTTACTATAGCAACA-6.7
SOX10MA0442.2chr6:86001630-86001641AAAACAAAGAA+6.62
SP1MA0079.4chr6:86002384-86002399AGGGGGCGGGGCCTG-6.75
SP2MA0516.2chr6:86002383-86002400CAGGGGGCGGGGCCTGG-6.27
SP4MA0685.1chr6:86002382-86002399CCAGGGGGCGGGGCCTG-6.48
ZfxMA0146.2chr6:86002385-86002399GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04011chr6:86001978-86004079Cortex
mSE_04462chr6:86000516-86004366E14.5_Brain
mSE_10712chr6:86001318-86003720Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
TCACCTGCTC AGACAACAGT CACCACAGAG TGTCTTCAGA TCTTGCTAAT GAGGGGATCT 60
TCAGCAGTCA GTCACCCCCA GAGGGGCTGA GGAGCAAATC CTTGTTCCCG GCAGGAAACA 120
CCCTGTCTTG TATCTAGGGT GGCCCGCCAC AAGAGCCTGT TGTGATAAGG GCAGGTGACA 180
GGAAGCTCCC TGACTTTTGG GTCCTCTCCT TTGTTTAAAA ACAAAAACAA AACAAAAACA 240
AAAACAAAGA AAAAAACACA CAAAAAACCA AACCTCAGGC CAGGCAGGAG GACTTCAGTG 300
AGTCCAGTAT ACCCCGTTTT ACTCTGAACA GCCATAGAGT CAAGGATCAT ATGGAGAAAT 360
CAGAGCTTCC AAGAGAGGCT CCTTTTTATC AGTGTTTGAC CAAGTGACAC TTTAAACTCT 420
CCCCTAGAGA CTCAGAGTAA AGGCAGGGCT TGGGCCCACT CTGATAAGAT CATTATGTCA 480
TCAAGCAAGA TCAGAAATAC TCTTTACACA TGAAACATAA TGCCATTGTC CATGGCTGCT 540
GGGATTAAAC ATAAGCTCTT CCGAGATCCA GGGACAAGGA AAGCAGTCGT TTACCTGTCA 600
GGAATATCAT GTTAGGGTTT TTAAAGAGCC ACCCAATCTC ACGTTGTTAT GCACTTCCAA 660
GGAAGCAAAG GGCCCCCAGA CTCCCCTCTA AAGGAAGCTG CTGCACAGAG CTGTCTCCGC 720
CTGTCTGGAT AGTTACTATA GCAACACTGA ACAGAGTACC ACCGAACACA AAGGAAACAC 780
CATCACTGAG CAGTAGTTCA AAAATGCCAT TCTGAATTCT GAGTCATTCC TAAGCCACTG 840
ACCCACAGAT ACTGACCGGG AGCCCAAGCT GTGTGCAGAA GATGGACAGG GGAGGGCGTG 900
GTTCAGCAGG AGACAAAGGC AGGATGAGAG CGAGTTGCCC AAGTAAGTCC TCCTAAAGAC 960
TCTGCTCACA GCTATGGGCA GTGGTTGGGA GCCCAGGGGG CGGGGCCTGG CCTGGCCTGC 1020
TAGTGAAGGT GCCTTAGAGC AGGGCTCCAG TGAGGAATGA GGATGCTAAA GGCTATTGGC 1080
AAGTGTCCTA GGGGAATCAC CCACCAATAG AGACCTGACT GCGGGGTCTT GGCCTCCTGG 1140
CTGCTGGTCA CCGTCCTTCT TCTCTGAAGG TGACAGCCAA GCCACCTGAG TCAGAATCTG 1200
TATTGTCTCT GGTTACTGGT GGTGTGACTG GACACTGTTC TCAGCTCTCA AGCTCTGTCT 1260
TCCCGGTGGC CTACTTCCTC ACAGGGAGGA TGAAGATTAA TGGTGCCGAC CTCATTCCCA 1320
GGCTTGTGAG TGTCGGCGGC AGCTGAGCCC TGCCAATGCA TATTCTCCAT AAACTCCAGA 1380
GGGAAGGAGG CTGAGCTGAG TGAGGGGCTG CTGCTGCAAC CAGGGTGCCC ACCAAAGTCA 1440
CCTCTGCAAC ATGTTCCTCT CACCAAGGGC TGCAGAACAT GCTGGAGAGG CTTATTAATT 1500
CTGCCCCAAA GATCAGAGAG AATGCTTCAA GAGGGAGGGC ACTGAAAGAG GCCCATAGAA 1560
ACCTGGATGA ATGTCTCTCC CTTCCCAAAG ACGCCTTTCA AGTGCAAAAG CCTTTATTCT 1620
AATTGGTGAG ATGTGACAGG TGACTGTCAT ACCTGCCTGC TCACTAGCTT GTTATAATTT 1680
GACAAGAGAG TGTGTCTTAT TTACAGCTTT CCTCCCAACG ATTATATTTT GTATAGCCTG 1740
TAGTTTGCAC CACAATGAAT TGAGATTAAA TAGACCTTTC TTAACAACAA TCAACAAGAG 1800
AGACTTGCAC GATATATACA GTCTCTGTAT GGAAAGTGTC TGTTGTGCTT TCTCATAGAA 1860
GGAGTGGCAA ACGGTAACAG CTGCTCTCCC TGGGGGACTG GAAGGCTGTC TGACTGCCCT 1920
TCCCTCACCC CCGTATGAGG CTTTGTGCTA GGACTCAGAA ATAAAGCCCT TCCCTCACAT 1980
AAGACACAGG TCTTTAGTTC TGTTCTTTGT GGAGCAAAGA GAATACAAGA ACAAACCCCA 2040
CAGCCTTACA TACAACAGGG GTAGGAGTGT GGTGTGAAGT CTCATGCAGT TCACCTTGAA 2100
ATTTGGGATT TTTTAAATTT AATCAATTAA TTTTGAGACA AGGTCTCACT GCATAACCCT 2160
GACTGGCATG GGACTTGCTA TGTAAACCAG CCTGGCCTTA GACTCACAGA CACCCATCTG 2220
TCTCTGCCTC CTGAGTGAAT TAAAGACATA CACCACCATG CCCGGCTCCC TCCTAGCTCT 2280
TAAGCAAGAG ATGTTTATCC CAATTTGGAT GTAAGATGTG AGGAACAGGC TCCAAGGCTT 2340
ATTTAGGTTC CTGCTGATAA TGCTTCATGC TAGCCGCTGA GCAGTGCTGG ACACACAAGA 2400
TATGGGTGAG GGCAGGGCCG AGGCTGACCC CACTCACTTG GCTCTGCTTG TCACCGCTGC 2460
CAGCCTCTCC AGGCTCCTTG CTCTGCGGGT ATTCCCCTAG CTTTCTGTTC TAGTTTCCTT 2520
TCTTTTGCTG TGATAAAACA CTGACCAAAA GCATCTTAGG GGAGGAAAAG ATTTACTTGC 2580
CTTACCCCAT CCCTGAAGAA AGTCGAGGCG GAACTTGAAT TCTGCTTGCT GCCTCAGTCT 2640
TGGACTCTTA GCTTGCTTTC TTTATGCAGT CCGGAACCAT CCACCCCAGG AATAGTGCCA 2700
CTCATAGCGG GCTGGGCCCT CCTGCATCCA TGAATGATCA 2740