EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM030-18852 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CH12 
Coordinate
chr3:60302240-60305100 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
IRF1MA0050.2chr3:60302571-60302592CATGGCTTTCTTTTTCTCTTT+6.37
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
CAGAAGATAA CGACAACTCA CAGTGTAGGA GAAACCTAAG TGCTCTCCTG GCACTGAAAA 60
GGAACCAGTA GATTCTAAAT GGGGCAGCGA TTAGCTTTTT ATTGCTATAA TGATTTTTTA 120
CTGTTTCCAC AACTTGAAAT GTGACTATTG CTAGTTGAAG GTAACATACT TTAATATTTT 180
TAACATATGA TTAGATAGTT TGTTTTTTTT TTTCTCCTAG TGGTTCAAAC TTTTCAATAA 240
TAACAGGTTA GGCTTACTGA TGGCAACATT GTTTCAGGCC TTACTTTATT TTGGCTCACG 300
TCTAAGGTTT AGATTGGCTT GGATGCCTTG TCATGGCTTT CTTTTTCTCT TTATCTCTGT 360
AAAATAACAT TTTCCTTTGA TTTGCTCTTT CCTAGACTAT TGTATTGTTT CTAACATTCA 420
GGTGCCTTTC TTGTATTCCT TTTTTGTTCT ATTTGATGGA GCAGAAAATT TGAGTTTGTT 480
TCGATTTTTC TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT GATAGTTTCC 540
CCTCTTGTAC TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC 600
AAATTTTCTA GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC CAAAAAACCC 660
AAAACCAAAA AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA CTGTAAATTA 720
ATCCTTCAAA CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG 780
GTGCAAAGGT AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA 840
CTGAAAACAA GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC 900
AAGGCCCATC CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT 960
TACCCTTCCT TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA 1020
AGATCTTTCT AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT 1080
CATAGTTTGC TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC 1140
CTTTTAAAGA AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC 1200
TTCTTGCACG TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC 1260
TGTGCCTATG ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT 1320
TACCTTCCAT CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT 1380
TAACTGGCTA ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA 1440
CAGACACTTG CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT 1500
CTTTACGCAG GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT 1560
TAGCAACTTC TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC 1620
CTCCTTTTCT CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG 1680
CTCTTTTCTA CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA 1740
CCTCCATCCT ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG 1800
AATGAATGCT GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC 1860
TGTCTCTGTT CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT 1920
TGGGAACTTT TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG 1980
GAAGGGATCA GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT 2040
ACTAGTACCT CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC 2100
TAGGAGAGTG TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC 2160
ACTCACCTCA ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC 2220
TGACGAAGTT ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC 2280
TTTATCTCTT CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG 2340
CTAATGAACT AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT 2400
GCGTGGGAGT ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC 2460
TTGCTTTCTG TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT 2520
TATTTGCCGA TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT 2580
CGCAGAACTC CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC 2640
TTTCCCGCCC TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG 2700
GCAGCTAACT CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC 2760
GGGAGCTGGA GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG 2820
GGCCGGGGCT GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2860