EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM030-01374 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CH12 
Coordinate
chr1:138034670-138038890 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr1:138035641-138035652AATGACCTTGA-6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:138034857-138034875GGCAGGAAGGAGGGCAGG+6.76
EsrraMA0592.2chr1:138035642-138035653ATGACCTTGAG-6.02
EsrrgMA0643.1chr1:138035642-138035652ATGACCTTGA-6.02
LEF1MA0768.1chr1:138035003-138035018TCCCCTTTGATCTTG-6.63
NR2C2MA0504.1chr1:138037953-138037968TGACCCCTGACCCCT-7.2
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:138037995-138038006CTTGAGTGGTT-6.32
Nr5a2MA0505.1chr1:138035641-138035656AATGACCTTGAGCTT-6.53
RXRBMA0855.1chr1:138037953-138037967TGACCCCTGACCCC-6.04
RXRGMA0856.1chr1:138037953-138037967TGACCCCTGACCCC-6.1
Sox6MA0515.1chr1:138037335-138037345CCATTGTTTT+6.02
Tcf7MA0769.1chr1:138035006-138035018CCTTTGATCTTG-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036000-138036021CCTTCCTTTGGTCCCTCCTCC-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036013-138036034CCTCCTCCCTCCCTCTCCCTC-6.43
ZNF263MA0528.1chr1:138036045-138036066TTCTCTTGCCCCTCCTCCACT-6.4
ZNF263MA0528.1chr1:138035988-138036009CCCTCCCTCTCTCCTTCCTTT-6.72
ZNF263MA0528.1chr1:138035984-138036005TCTCCCCTCCCTCTCTCCTTC-7.16
ZNF263MA0528.1chr1:138036042-138036063CCCTTCTCTTGCCCCTCCTCC-7.73
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02721chr1:138030318-138061695HFSCs
mSE_03461chr1:138034684-138035542Bone_Marrow
mSE_03461chr1:138036579-138037416Bone_Marrow
mSE_04183chr1:138034617-138037628Cortex
mSE_04183chr1:138037696-138040917Cortex
mSE_07308chr1:138029879-138035516Intestine
mSE_07308chr1:138036408-138037452Intestine
mSE_10895chr1:138034628-138037668Olfactory_bulb
mSE_10895chr1:138037696-138041026Olfactory_bulb
mSE_12032chr1:138027259-138035645Spleen
mSE_12032chr1:138036436-138037602Spleen
mSE_12949chr1:138027947-138035722Thymus
mSE_12949chr1:138036419-138037578Thymus
Enhancer Sequence
TCAAATTCCG TCTGCATCAT TGTAAATTGT GGGGACTCTG GGCTTGTGCA ATGTCCCCTT 60
TGGGATTTCA GTAAAATGGG GCATGCATCC CTCACCCCAT AGTGTTGTGA TAACCCAAGA 120
GTGCATGTGG CACCCAGGTT CTCAGATGCT CTGTTATGTC GTCAGATGAA GCTAGGGAGT 180
GAGAGGAGGC AGGAAGGAGG GCAGGCCTGC TACTGCTACC CCCAAGGAAT GATTTCCTCC 240
GCTCTCAGGC TTGCCCTTCC AGGATCCAAC AATCTTTACA GGCAGGAAGT TCTTTTTGCT 300
AGCTTATCTA AATCCCTGTG GCTGTGGCTA AGTTCCCCTT TGATCTTGCC CAGTCTCTGC 360
TGAGGAAGAG CGGTGTCCTT GGCAGGTCAC ATAGCTTAGC GAAGTGACTG TATGAAAGGC 420
AGTCTGGAGA CCACGAGGGT CCTCTGGGTC CCTTCTGTGT CTCTTGCATC CGTGAGCCAA 480
ACACGCACCA CGAAGAAGAC AGCAGCTGGC CTTTCCCTCT GCCCCACCAC CTGTGGTTGG 540
AGCTAGGCAT GGGGATTCAG GCTGGGCACG AGGAGGAGCC AGCGGGTCTA AGCTGCCTTT 600
GGTTTCTATC AAGCTTGGAT ACAGTACAGC CAGATGCTGG GTGATAGGAG TCCTTTATGG 660
TCCCTCTGGA GCTCTCCCAC CAGCCCCCAA GGGCTCATTC TCAACATCCC AAGGGACTCC 720
TTACAACAAG ACAGACATGC TTTTAGCCCC ATGAAACTCC TTCCGAAGTG TCTATGTTGA 780
TTATTGTGGC CATCTGAGGG GTAACTCTAG ATCAGGCCTC TGGTTCCTGA AAGCCTGGGG 840
GTAGAACTGG GGAGAGAGTG TCTCTCGGTC TAGAATCCCT CTAGTGCAAA TCTTACACCA 900
GCTAGTGTTT GTGTGCATGC TAATTTTGTG CAAATCTCAG GAAAAGGCAG CCTCTGGTTC 960
CTTATCAGTC AAATGACCTT GAGCTTGGGA CAGGATAGAG ACAAATTGCT CCTCACTGGC 1020
TATGTGATAT ACTATACTGT GGTGGCCCAC CGTGGGCAAA GTGATGGATG GTATCTATCA 1080
AGAAGTTGTC TCACCCCTAA GTACTGATGT CTACTGTACT GGGTGAAATG AGTTCCAGGT 1140
AAAGCCTCAG GTGCATATTT TACATATCAA AGCAGACCTG GCCTCCAAGT TCTCCCAGCA 1200
TCCCTCAGTC CCTACCTGGC ACACCCTTCC CCCAACCCTG GTCTTTCCAG ACCCTTCCCT 1260
CAGGAGGCTC TTTCTTATAT AATCCAGACA TTTTGCGCAC ATGCTCTCTC CCTATCTCCC 1320
CTCCCTCTCT CCTTCCTTTG GTCCCTCCTC CCTCCCTCTC CCTCTCTCCT TTCCCTTCTC 1380
TTGCCCCTCC TCCACTTCCC ATGGTGACTT CCCTCCCTGG CCTTGGTCCT TGGGGCCAGT 1440
GAACTCATCT GAGAGTAGCT TCCAAATAAA CCTGCCTTTA TTATATTCTA ATCCGGCTTG 1500
AACGGTCTCA TTTCACTGGC AGAGAAATAA CCTATCACTA AGGACCAGAG AGATGGCTCA 1560
GCCTGTAAAA GTACTTGATG CTAAATCTGA TAACATAAAT TAAATTCCCA GGACCCAAAT 1620
AGTGGAAGAA GTAGATTCCA GTGGTTGTCC TCTGGCCTCC ACATGTGCAT CCTGCCATAC 1680
ACACACCTTC ACAGGTTTAT TACATGCATG CATCCATACA CACATACAAA CATAAAATGC 1740
TTTGAAAAAA AAGTTTCTGG CTCTGGAACA GCTCTTGGTT ATTTTAATGT CACCGCCTGT 1800
TACTTTTCAT TAGCAGAAAG TCTTTAAGTG TAAAAAGCTG CAGCCTTGGA GGTCTTGAGT 1860
GAGGAATAGG GGAGAGTCCG TTAGGAACTC TGGGAGATAC CTAGCCGCTA GCTAAGTAGG 1920
TAAGACTAGT TTTACCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAACCAC AGCCAACCCC CTAGGAGCCC 1980
AAAGTCACTG GGCGGAGCTT CTGGGAGGGG TGATTGGCTG CCTTTGTGTG ATGTCACTTG 2040
AGGCCCTAAG GTGAAGCTCC GCCTAAACTT TGGTGGCGAC TGTTGGGTCT CTGGCACGTA 2100
CCATGGCTCA CCTAGCCATT ATGCTCTGCA GAAAGCGAGT TTTGCCCTTG GCAGTCTCTC 2160
AGCAGCCCCT GGCCTGCCTC CTCGCTGTGT CCTCTGCCCT TCACTTTGCT ACGGCTCAGT 2220
CCGGCTCCTG ATGAGCCAAA GAACCGCTGA GCTCAGCTCT TCCCGTGGCC CTAGGCTCCG 2280
GCTGGCTGCC TTTGTGCCCG CCTCGCCCGC CTTTAAGTCT CTCGGCTGTG GCTCATCGCT 2340
GCGGGGGTGG AGGCGGCCGC CCACATCACG CCAGCCACTG TTCGCTTGTG AGCGGAGGAA 2400
GCGTGGTGAC CTCAGCCACG GTGCCAGATC CTGCCTCTGA AAAGCCTTGG CTGCGCCACC 2460
CTGCCTGCCG TTTGCCAAAT GGCGAATAGT CCGGCTCTGT TCAGCGAGAT TCCGGGGGTG 2520
GGGGGTAGGG GCTTTCGGAG AGAGGCCCTA GGTCCTCCCA ACAGGGTGGA GAGAAAGGAT 2580
AGAGGGTCTT CAGTGAGAGT CACAGTTAGG CTACCAGCCT TCATTGATAA TAGGCAACAG 2640
GCTTGCCGGC CATAGTGTGC CAATTCCATT GTTTTAAATG TTGCATCTTT CCGCTTGCAG 2700
ATTTTCTATT TTAGGGTATA TTCTAATCAT TCAGTGATGG GTTTCAATAT GCCTGTCTCA 2760
TGTACTTTGA TCTTACACCC ACCACCCTTT TATGTTCCTG TTTCCTCCTG ACTTCTGGTC 2820
TCCCCTTCCC TCAAGTCTTA TTTTTAAGTT TAAATTCTAC ATATGAGAGA AAACGTGATT 2880
AGGGTTTCCT GGGTCCAACT TAGCAACCTC TTGGATCATT AGTCCATTTC CTGCAAATAA 2940
CACAATTCAC TCTTGGCAAT GGCAAAATAG TATTCTATTG TGTTATACAT ACTTTTTTTT 3000
AAGCTATTGA TCTACTGATG ATCACATGGG CTAATATCCA TAACCTTGCT AATTTGAAAA 3060
AAAAAAATCT GTAGAGAACA TGGGTGTGCA GGTGTCTCCG TGGTCTGCTA CATTTGATTC 3120
CCTCTGGGAT ATACCTAGGA GTGGCATATC CAGTTCCTGA GATAGTCTTT CTTGCCTTCT 3180
CAGGTTCTGT GCTTAAGGTG CACGCCCCTA CTTGCCTCTT CCTAGTCCTG GTATAGTTGG 3240
TAGCTCTCAG GGGCCCATGG TACAAATGGA AGAACCTGGC AACTGACCCC TGACCCCTCC 3300
TTCCATGCCA TTGGGAAGGA CACTGCTTGA GTGGTTGCCA TCTGTGCCCG TCCCGCTATA 3360
AAGAGAAACT TCTCCCTTCT GTAGGTCACT GCCATTTTGA GGACAACCCA CAGAAGTGAC 3420
CTCATCCAGA GTGGGACCAG TGGAAGAGGC TGCTGGAGGG GAGGGCGGTA CAATTCTTAA 3480
AAAGCTAAGA CCACGTAGAT CTATATAACC CAAGTGCAGG CTGAGGCTTG GGCCGTGAGA 3540
GACAGGACAG AATCTCCAAA TCTCCACCAG GCACCAGAGA TGAGCTCAGC TGTCACATGA 3600
CACTGTGTCC TCCAGGGCAG GGCAGCCCAG TTCCCTGCTT GGTGCTGCCT GAATGGACAT 3660
GGGGCGTGCA AGCCCGCTCT GACAGGGGAG GAAGTCAGTA GCACTGTGGG CGTGGGGTCT 3720
TTAGAGGAAG CATCGAGGGA GTTGGGAGAG AGCTTCTAGT CTCAGCCTGA GGAGAGATTG 3780
GACCCCAGCC TTGTTTCTCA CTACCTGAGT GACTTAGGCT TGGTTCCTGC TGGGAAGTGG 3840
GGATTAACAT CCTAGCTCAT ACACCACCAA GGCAAAGTGA TGGTGGATGC TGGCTGGCCT 3900
ACTACCCACA CACATGGGAA TGTCTGTGAG ATCTTCCTTC TTTGCTCGCT CCCGCAGCCC 3960
CTCATCCACA AGGCTAACAC ACACTGTGCC TTGTCCAGAT CAGCTATTCT GAGAATTAGT 4020
CACATACCCA CTTCTCCTTA CAAATTGCAT CCCGCTGTTT TGAATAGACT AGCAAGAAGC 4080
TAGATGGCTC TCTGATGTAT CAGGATGTGT AGAACCGAAA ATATAATCCC AGGGAGACCC 4140
CACAGCCCTT GCTACCTAAA GCCCTGACTG ACCCTAGGTG TACCCTTCCA GACTGCTCTC 4200
CCTGACTCTC TTCTTTGCTG 4220