EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM030-01279 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CH12 
Coordinate
chr1:134237290-134239670 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr1:134239078-134239089TTTGACCTTGA-6.14
ESRRBMA0141.3chr1:134239107-134239118AATGACCTTGA-6.32
EsrraMA0592.2chr1:134239108-134239119ATGACCTTGAA-6.62
EsrrgMA0643.1chr1:134239108-134239118ATGACCTTGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:134239029-134239050TTTCTCTTTTTCTTTCTTTTT+6.48
IRF1MA0050.2chr1:134239023-134239044TTCTTGTTTCTCTTTTTCTTT+6.76
Nr2f6MA0677.1chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.47
Nr5a2MA0505.1chr1:134239107-134239122AATGACCTTGAATTC-6.19
Nr5a2MA0505.1chr1:134239078-134239093TTTGACCTTGACCTT-6.21
RXRBMA0855.1chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.77
RXRGMA0856.1chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.41
RxraMA0512.2chr1:134239454-134239468GGAGTCAAAGGTCA+6.53
SOX10MA0442.2chr1:134238863-134238874TGCTTTGTTTT-6.02
SPI1MA0080.4chr1:134238466-134238480AAAATGAGGAAGTG+6.59
Sox3MA0514.1chr1:134239203-134239213CCTTTGTTTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07434chr1:134237910-134239064Intestine
mSE_08057chr1:134237759-134239271Kidney
mSE_08541chr1:134237720-134239719Liver
mSE_12577chr1:134236908-134240593Spleen
Enhancer Sequence
TGACACCCTT TCCTGGCCTC CAAGGGCACC AGGCACTCAC ATGGTGCATA CACTCTCTCT 60
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCACACACA CACACACACA TACACACACA 120
CACACACACA CACACACTCA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACGCATTCA 180
CGCACGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAACATGCA 240
TGGATATTCA TGTGGGTAGG TGGATGTCCA TGCCCATGTT TAAGTATGTG GAGACCTGAA 300
GATTGGAGTT TTGACTATTG CTCTCTTCCC TATTCCCTTA AGACAGGGTT CTCACTGAAC 360
CTGAAGTTAG GCCGGCAGCC AGCAAGCCCC AATGATTCTC CATCTGCCTC CCACAGTCCG 420
GGTGTTATAG GGTCACAAAG GCACACCCAG CTCTTTACGT GAGTGCTTGG CATTTGAACG 480
CAAACCCTCA TGCTTGGAAA GCAAGCAGTC TTGCTGTCTG AGCTGTTTCC CCAGGACCCT 540
AAGTCTATGC TAAGTATGTG CGCTTCCACC AAGCTACACT ACCAAGCTAC ACCTTTAAGT 600
CCAAATGACT TTTGTTCTGA TATAGAAGGG GAGATGTTTA ACTAGAATTT TTACCCAGTG 660
TCTCCCTCAA ACTCAAAACT GAGTAAGTGT CCTGTATTTT CGTTTTCCCA ATCTGGAAAT 720
CCTAACATCA GGAAGATTGA GGTTAGACAA TAGGAAGATC TTGGGCTATT GCCTTGGGCT 780
ACTGACCCAC AGGATGAGAG AATCTCCCAT TCTGGACAGC TTTAAAAAGG TGAGTGTGGC 840
AAACTGGAAG ATGGTAGCAC ACACCTTTGA TGCCAGCACT CAGGAGGCAG AGCCAGGTGG 900
ATCTCTGTGA GTTTGAGGCC AGCCTGGTCT ACAGAGCAAG TTCCAGGACA GGCAGGGCTA 960
CACAGAGAAA CCCTGTCTTG AAGCACAAAA CAAAACAACA AACCAAACCA AACGAAGACA 1020
AAACTGAGTG TTCCCAGGAC CTAGTGGGAA GCCTTTAGAC ATTTAGGGCT ATCTTTACAG 1080
CCAAGAGACT CATCTTCTGT AGCTGAGCTC AGGAGGATTC ACATAAAACA CAGGAAGTGG 1140
TGGAAAGTGA ACGAGATTAT CAGTGGAGTT CCTGCCAAAA TGAGGAAGTG ACACTGGGTG 1200
GAGGCAGGGG ACGCCTGAAG TCCCCAGAGA GGATGTCAGA GCAGGAGGTG CTGAGATCAT 1260
CTGGCTACCC CACCCCCCTC ACTTTGGGCC AAGGGGGGTG GCTGAGGGTG TGGAGCTGTG 1320
GGGTGAATCT GGAGGGTTGG GTGAGCCTCA GCAAGTAAGT ATAGCCGGGG CAGCAGGAGT 1380
TCAGGCCTTG GGAGAAAAAT CTTAAGATAT GTATTTGGGG GTAGAAATGA CCCCCCAAAG 1440
GGAAAGAAAG GTGGCCTCAG GATACTCAGC AGAGCAGGGG CTGATGTGAG TCTCTAGGGT 1500
CACCATAGGG AGCTCTGGGG CTCTCAGTCT GGTAAGAGAG ACAGGTGTGC CCTAGAAATC 1560
AGGTCGTCAA GCATGCTTTG TTTTCTTCCT CCTTTAGTGC ATACTGGGTG TGGTGCTGAA 1620
CCCCGGGAGT CCTGAACTAA ACAGAATATA CACTGCCCTT CAAAGCCTGG AGGTCCAGGG 1680
GAGGAGAGGT AAGTAAGTCC TTGTGAAATT GTAACTTTTA TAAGGTGAAG GACTTCTTGT 1740
TTCTCTTTTT CTTTCTTTTT GGTAGATAGG CTTATAGCTT GTGCTGGCTT TGACCTTGAC 1800
CTTATTCTGT AACTGAGAAT GACCTTGAAT TCTCGATCCT CCCCAGCTCC CCCTCACAGG 1860
CGGGCATTCC CCCATCATGC CAGGTTTCTA TAGAGCTAAG GACCAAATCT AGACCTTTGT 1920
TTTGGGTCAC TGACTCCCTT CCTTGGTGAG AGTTCAGATG TCATTCCTGT AGTGCCCCTC 1980
CACGAAACTC CATCTTTAGA CCCTACTGGG TGCTGTCTGC TACCCTACTG GGTGCAGATC 2040
TTTGGATAGG TAAACACTCT AACAACTGGA TAACAGCCAC AGCCTGGGCT GGACTTGAAT 2100
TTGCCACCAT CCCCACACCT CTGCCACCAG AGTGCTGTAC CAACAGCCTA GGCCAGCCTG 2160
CACAGGAGTC AAAGGTCACC ACCTGACCCC AATGTACCTC TCCAGCTGCT GCCTCTGTCC 2220
CCCACACTGC TTGCTTGCTC TGTGGAGTAA AGTAAAATTA ACTGGCTAAA CTGGGTGTGG 2280
TGGAGCTCAC CTTCAATCCC AGTCCTTGGG AGGCAGAGGC AAGCAGATCT CTATGAATCC 2340
AAGACCAACC TGGTCTACAG ATTGAGTTCC AGGACAACCA 2380