EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM030-00932 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CH12 
Coordinate
chr1:89752870-89754020 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:89752919-89752930ATGACCTTGAC-6.32
EsrrgMA0643.1chr1:89752919-89752929ATGACCTTGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:89753371-89753392AAAGAAAAAATAAAAGAAAAA-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:89752926-89752941TGACCTTTTGATCTT-7.29
Nr5a2MA0505.1chr1:89752918-89752933CATGACCTTGACCTT-6.8
Nr5a2MA0505.1chr1:89752889-89752904GCTGGCCTTGAACTT-8.42
POU3F1MA0786.1chr1:89753777-89753789AAATTAGCATAT-6.11
POU3F2MA0787.1chr1:89753777-89753789AAATTAGCATAT-6.14
POU3F3MA0788.1chr1:89753777-89753790AAATTAGCATATA-6.71
RARAMA0729.1chr1:89752923-89752941CCTTGACCTTTTGATCTT-7.86
RarbMA0857.1chr1:89752926-89752942TGACCTTTTGATCTTT-7.61
SOX10MA0442.2chr1:89753544-89753555AAAACAAAGAC+6.14
SPI1MA0080.4chr1:89753961-89753975TACTTCTGCTTTTT-6.45
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00241chr1:89743208-89763671pro-B_Cells
mSE_12094chr1:89753013-89753657Spleen
Enhancer Sequence
ATGGTTTCAT GTAGTCCAGG CTGGCCTTGA ACTTGCAGTG CAGCTGAGCA TGACCTTGAC 60
CTTTTGATCT TTTGTCCTAC CTCCTGAGTA TATGCTATAT GCCCTACCTC CTGAGTATAT 120
GCTATATGCC CTACCTCCTG AGTATGTGCT ATATGCCCTA CCTCCTGAGT ATATGCTATA 180
TGCCCTACCT CCTGAGTATA TGCTATATGC CCTACCACGC CTAGTTTTTG CAATCCTGAA 240
AATTGAATTC AGGGCCTCAA TGCTAGATAA ATTGTCTACC AGCTGAGCCA CATCCCCAGC 300
CTTCAAGTTT TAAAAGACTT GAAAAGCTCA GGTTTATGAA ACACAACTAT GGCTAGGAAA 360
GTAGCTCAGT GGGTAGTGTG TTCCTCTAGC ATGTGTGAAG CCAGTGTGAT GGGGCATGCC 420
TGTAACCCCA GCCAGAGAAT CAGGAGTTTA GGGTCGCCTT TGGAAACTAG CCCAGGGTAC 480
AAGGCTCTGT CTCAAAAAGT AAAAGAAAAA ATAAAAGAAA AAAGGGACTA TAATTCACGT 540
GTCATTTGAT TTCCTCATGT AAGCAGTGGT TTGCCTGGGA ATAGTGGTAT TTCTAATCCC 600
AGGTGGTGTG GAGGATGAGG CAGGAGAGTA TGGAATAGCT TAGGCTATAT TAACAGGATC 660
TGGTTTTAGA AAACAAAACA AAGACTCTAC AGTTGGATGA CTTTTGGCAT GTTCACAGTT 720
GTGCAAGCGT CACCACAGCC AATTTTAGAA CTTTTCATCA CTGGTTCCTC TCAGCTCCCT 780
CAAACCTAGG CAACTGCTCA TGTAATTTCT GTCTCTGTGC TTGCCCATGC TGTTTAGTTT 840
TTAGAACTGG AGTCGTTTAG TATGCTGTCT TTTGTGTTTT TTTTTCATTA AGCATATTTA 900
AATTAAAAAA TTAGCATATA AAGTGATGAG TTTCATTGGA ATACTCACAT ATATACTGTA 960
TCATTATACT TACATTCGGT ATATTTTCAG GATTCCTCCA AGTTATATTG TGTGTCAATA 1020
CCACATTCCT TTTTACTAGT ATTCTGCAGT AGAAATAGGC TTCATTTTGT ACATTTATCA 1080
GTTAATGGGA TTACTTCTGC TTTTTGGCCT TTCTAATAAC TCTCCTGTGA GAATTTGTGT 1140
ACATGTTTGT 1150