EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM030-00614 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CH12 
Coordinate
chr1:72271980-72274290 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:72272724-72272742GGAAGGCAGGAAGTGAGG+6.53
KLF5MA0599.1chr1:72272573-72272583GGGGCGGGGC-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:72272902-72272915ATTAAGTGGATTT-6.2
PKNOX1MA0782.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
PKNOX2MA0783.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-7.22
SP3MA0746.2chr1:72272558-72272571CGCCACGCCCCTC+6.18
TGIF1MA0796.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
TGIF2MA0797.1chr1:72273839-72273851TGACACCTGTCA-6.92
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10125chr1:72271505-72272551Embryonic_stem_cells
mSE_10125chr1:72273712-72274091Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CCTGGTCCTC AGAAACTTAC ATCTTCCCCA CCTGACTCTC CCACCTGTTT GATGTCCTAC 60
TACTTCAGAT CATCTTAACC TTGAATCAGG CCAGGGCCCC TCCCCAATTG ATTCCGGGGG 120
TGTTCGCATC ACGATGTACC TAAGGCTTAG TCACCCAAAA ATTTGCTGAA AACTTACTTT 180
TTTTTTTTTT TTTTTTGCGC ACCTGATAAG GGCTGGCGCA CTGAGAAAAG TCCAGATGAT 240
ACTACAGCCA ATAAAGAGAG CAGACTGGAG TAAAAGAGTC AAAAAGCTGA ATTAGCTGTG 300
AATGCCTGGG CGACAGAACA TCCCAGGATC GCGCTTGTGA TGGGCTCAGG AGAAGCTTTT 360
GGTAGTTAAA TAGCCAAGTG AGAAAGGGGA GGATACGGTG TCAAGTCACA TACAGCCTCA 420
GGACTGGAGG AAACAGCACG GACGAAGAGC AGACTGCCTG AATCGAAACC AACCCTCAGC 480
TCCTCAGGCT ACCTGTTCCC ACCTCGCTTT CCTCTGTGGA GGAAGAAGCG TAGGTGGGCC 540
GCTTTGAGAC TGCCAGGAGG AGGCGGCTCA GTGCGAACCG CCACGCCCCT CGTGGGGCGG 600
GGCATGCAAA TAATACTCGG CGTGCGCGCT CGAGAACGCC GGGAGAGCCG GGGTCGTGGA 660
CGTTGTAGCT GAAGCTGTGG GTGCTGGAGT GGGAGTGAGG CGTGGAGGAT GCAAGACGCG 720
CACGGGAGGA GGAAGGAGCC GCGGGGAAGG CAGGAAGTGA GGGTTGCGAG CGGTCACCAC 780
GAAGTTAATG TGTCTCGCGG ACGCAGAGCA CGGCTGCATG GTGTGTGCTG GGTATCGCTT 840
CTCGGCCTTT TGGCTAAGAT CAAGTGTAGT ATCTGTTCTT ATCAGTTTAA TATCTGATAC 900
GTCCTCTATC TGAGGACAAT ATATTAAGTG GATTTTTGGA ACTAGGAGTT GGAATAGGAG 960
CTTGCTCCGT CCACTCCACG CATCGATCTG GTATTGCAGT ACCTCCAGGA ACGGTGCACC 1020
CCCTCAGGGG AATAATATTT GTTTAAAATT AGAGCTAATT ACTCGTTTTC CCTTTGTCTT 1080
CCAAAGGTTT GTTTGATTTG GGGCTAACTT TAGAAGCATC TTTTCAGAGC CCTAATACTT 1140
GAGAGGCAGG TGAATTTCTG AGTTCTGAGG CCAACCTGCT CTACAGTGAG TTCCAGGATA 1200
GCCAGGGTTA CGCTGAGGAA CCCTGTTTTG GAAAACCAAA TAAAATACGT TTCTAGTCTT 1260
TATCTTTTGT AGTATTTGAG TACCTAATAA AACTCTGAGC TTCTAGTGTT ATTATCTGTA 1320
TCCTTTGTAG TCAAGATTAT TATTATGATG TGCAAGTTCC AGCTTGGCGT AACACAAAGC 1380
ACCTAATGAC TGTTGTATCT AACACCCTTG ACTAAGGAAC CAGCTGGTGG TGTCAAAAAC 1440
TCTAGTATTT ACTAAAACTT TTGAAAGTCA ATTTTTTAAA AATAGCTTTC TGTGTATGCA 1500
TATGCGTAGT GTGTTTGTGG GCACACAGCC ATAGGAGTGG GTTCTTTACT GACTTCAGGT 1560
GAGTTCTATA CTGGCAGTAT ATGTCAGGGA AAGCTGTGCG TATTTATACC TGCCTTAGCC 1620
TCCTAATTTC TAGGGGTTTC CCCCTCATGG TCTTTTTTTT TTTTTTAAGA TTTATGTATT 1680
TATTATGTAT ATAGCATTCT TCCTGCATGT ATACCTGTAG GCCAGAAGAG AGCACCAGAT 1740
TTCTTTATAA GTGGTTCTGA GACACTATGT GGTTGCTGGA AATTGAACTC AGGACCTCTG 1800
GAAGAGCAGC TCTGAACCTG ACCCATCTCT CCAGTCCCTG TTACAGTCTT AAAACTTTTT 1860
GACACCTGTC AAAGAATGTT AGGATTCAGA GAACTGGCTG TTCTCCCAGA GATCCCTGTA 1920
ATTTCAGGTC CCCCATGCTT CAGGTCCCAA TACTCAGTTG GGAGCTCACA GTGTTTTGTA 1980
AGTAAATAAA CATGCCCAAA CCACCCGTGA ACACACACAC ACACCACAAT AAATCCAAGT 2040
TTAAAGAGAA AAACTCGGGG GGGAGGGTAT GGGGGACTTT TGGGATAGCA TTGGAAATGT 2100
AATTGAGGAA AATACGTAAT AAATAAATAA ATAAATGAAT AAATAAAAAA AAAAAAAAAA 2160
AAAGAGAAAA ACTCAATAAA AGTGGGATAG TGGTATGTGC AGAGGACAAG TTAAGAGCTA 2220
ATACCAAAGC ACCATTTCCA GGTACATACT GACTGTGAGC TAGCTACAAA ACAGGATGGA 2280
CAAAAATGCA GTCCCACTGA CGGCAGGCCA 2310