EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM029-29064 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum_neonate 
Coordinate
chr5:22922510-22925830 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR3MA0732.1chr5:22923812-22923827CCCCGCCCCCGCAAC+6.3
EGR4MA0733.1chr5:22923812-22923828CCCCGCCCCCGCAACT+6.03
GFI1MA0038.2chr5:22925388-22925400TGCAGTGATTTC-6.74
MyogMA0500.1chr5:22922643-22922654GACAGCTGCAG+6.62
Tcf12MA0521.1chr5:22922643-22922654GACAGCTGCAG+6.14
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02660chr5:22892037-22926078HFSCs
mSE_03090chr5:22905878-22925828TACs
mSE_04396chr5:22923555-22925493E14.5_Brain
mSE_06642chr5:22922478-22925907Heart
mSE_07213chr5:22922685-22923755Intestine
mSE_07213chr5:22923817-22925621Intestine
mSE_07985chr5:22922995-22925869Kidney
mSE_08464chr5:22923843-22925765Liver
mSE_08964chr5:22923818-22925615Lung
mSE_09525chr5:22922885-22926328MEF
mSE_10518chr5:22923866-22925693Embryonic_stem_cells
mSE_11480chr5:22923904-22926298Placenta
Enhancer Sequence
TCTTTCCTCA ACAGAATACT CATTTTATGC AAGCAACCAG ATTTACAAAA TATATTTTAT 60
TATTCTCCAC TGTCACACAT TTTCACTGAA CATTTAAGGT CACAAATAGA CAGGCAAGGT 120
GATCCAGCAC CCTGACAGCT GCAGGGCACT AACACCTTAG TAAGTGCACA CAAATACATA 180
CTGAGGTTTT TTTTTTTTAA AGCAAAATTA GGATTATCTT GTAAATATCA CTTCAAGGCC 240
TACGATAGCC ATCTTTCCAC ATCAGCATTT TTAAATGATT GTCCGTGCAG CGTTGCCAGG 300
CGAGTAGTAC TGAGCCACAA CTCTCCTCGC CTGTTTCATT TTGGTTTGTA TTTTTACTGT 360
TAACATAGCT TACATAAATA GTACATCTTA AGTCTGTACT AGATTGACCT TTCTATTATT 420
TGCAAGTATA CTCTACTGTG TGGCTTCCTC CCCATCAACA AGGCTTTAAA CAAGAGGGCT 480
CTTCTAATCC CAATCAGACT GTATTTACAC TTTACAGTTC ATATGCAGTT TCCCATTAAA 540
TGTTCTAATG TACAAAGAAC TTCTGGTTCA ACTGGTGTGG GGATCTGACA TTTTTACCTC 600
TCTGTGTGAA TTGTGGATGC TGGCTGTGTC ATTCAGTCGT GGGTTTGGTG TCCTGCAGAG 660
ATTTGTAGAC AGCAAGTGTA AAGAAATCAA ACCCCCAGCC TGAAACAGGG ATGGTCCAAC 720
TGTTCCCTGT ATATTCCAAC CTGGTGGGTC CGCGGTAAAG CACAAGTTTG GGGTTATTTT 780
TTGTGTAATA ATCTTTTACT GTTTAAATCT TCATCGCTGC CTCCTAAGTT ATCCCAAACA 840
CATTATTACA TCGTTAGTGC ACCTAAAACA GCAAAACAAC AACAAACCCC AAGCGACTTC 900
ACTCCTGCTT TTGTCCCCTA ATCTATACCC AGTTCTAAAC CACCTAGCCA AACAGTGAAG 960
CCGCGCCCTA AAAATAAACG GGCACATGTG TGAAAACTTC TAACACCTAG AAACCTACAA 1020
TGTACTTAAA CTCAGCCTGA TTTTTCCCTG TAAACTAAAA TCATGGTAGG ACTACCCAAC 1080
TTGGCCTTGT CCATCACCCT ACAGCATATT TATTCAGTAT GGACCTGCAA AAAAGGAAGC 1140
CACACAAAAA AGAAGCATCC CTTAGAAACC AGAAGCCAGT AAAGTCTGCT TTGGAGGGAT 1200
CAGTTATACT GAAGAGCTGT CAAAATACAC ACTCATGTGC TACAGCATGC TTCTCCATAC 1260
CTTCATGTTT TAGGTGGTGA TACCCAGCAA AGTTAATCAT CCCCCCGCCC CCGCAACTCC 1320
CCCACCCACC ATTCCCTTCT TTCTCTGTTA GTTACTACTG CATATCTGGT ATACATTATC 1380
TCATTTAATC CATCAATCTA ATTTAAGTGA GAAAAGGCTG GACTAAAGAG ATTATATTTC 1440
AACAAGGACA CTGCTCTACT TCCCCAAACT GAGCATCATG AAACTAACCA GGCATGATGT 1500
AATTCTGTAA CCCAAGTCCT CAAAAAGATC GGGCCAAATG CAAGACCGCT TCAAAAACAA 1560
AAGCAAAAAA ATTGTTATTT CCACTGGGCG CAGACTAACC ACCATCAGCA TTTCCGGAAG 1620
ATGGCGGCTG CACTGGGCTC AAAATGTGAG CTGGAAGCTC AGACGACCGA GTTAAGCAGG 1680
AAGCTGCACT ACGGTGCTTT ACAGCGAGGA TTAAAGAAGG GATAAGCTCG GCCGCTGTAT 1740
GTAGCCTCGT CGCTCTGCTC CGTGAAGGTC CCAGGAAAAC GCCGCCCGGC TCGAGCGCCG 1800
CGCACCCGGC CAGCCTGCAG GCGCAGCTCC CGCAGCTGCT CTCCCGAGCG GAAGGGCAGC 1860
CGCCGTGACG CAGACAGCGC CGGGGAAACG CCCTGCTCTG TGGTACAAGC ACTCGCTCTG 1920
TCACTGTGGG ACTCAAGGCT TGAGGTCTAG AGCACAAGCC CACGCTATGC TTCGCCAAGA 1980
GGTGTTTTTC CTCTGGTGTA AAATTTGGCA GCCACAACGG GGTAGCTTGG TTTTATCCAT 2040
GGTTAGGACA CGCCGGCTAT AGGTATTATA CGGTAAAAGC CCGATTACTA CAAAAGGTCA 2100
AAACTAAGCT ACTGAACCAC TCGTCAATCA AACCGGGCTT AAGAGAATGG ATCCTCAGTA 2160
CTTCTCACTA AAGAAAAATC CTTTCCTACA GCTTTTCACT CAGGCCACTT TTACTGGACT 2220
AATTTCTAAT GTCAGTTAGG GAAAGGATCA CTCCAGTTGA AAGCTACAAG AACATTAAAC 2280
GCTAGAATAG CTAGCTGCGC GTTACAGGCA TGGTGATGTA TGCCTGTAAC CTGAGCTAGA 2340
AACAGGAAAA AAAAAAAGGC GTTGATCTTT TGACTACCAA GTGATTTCGA GGCCAGCCTG 2400
AATTACACGA ACCACGCCTC GCCTTTAAAA AATAAAATTA TTTAGTCCCA TTAGGGCACC 2460
ATTATGTCTA AGCTTCATTA TTTGTCAGCC TTCTCTTAGA ATCTGAACAC CTTGCACAGG 2520
ATTTCTAAGC AGGAGTGTCC ATGGAGAATT TAACAGGATC TGTGCACTAT GCTACTCTAC 2580
GCACATTAAC AGCATTCCGA GAAGGGATCC GCCTTTCAGA AGCATTAATT AGGATGGATT 2640
TCTGGTTCCG AATTCCTGCA GTGTATTGTG CCAAGCCTGT AACTCTAGAG GCAGTGTTGA 2700
GTTGGTGGTC AGTCAGTCTG AGTCACCTGA GACCTCGTTT AAACTCTTGC CCACCCTCGT 2760
CCTCGAAAAG CAACCCACAT TAAGGTCATG TGGACCATGG AGTCAATCTT ATAAAAAACC 2820
TTCTCAACCT ATGTAAAAGC TAAGTCTCCA ACTCCTCATA CTTCCTGAGA GCCGGGGCTG 2880
CAGTGATTTC CCACTATGCC TAGATTTTCT ATTAGGACTA TTTTTCAATT GTGGCTGGGT 2940
TCACAGACTT CTACCCTAAC TTTTGCTGGG GATTGAGCCC AGTGCTTTCC CAGAGCTACG 3000
CCTCACTCAG CCCCTAACCC CTCCCCTTCC CTCAGTACTA AGAATCAAAC GTGCTGGAAC 3060
TGACGAAGAC TACATTTCAA CTCAAGGCAG GTGATCTCCT ATGTTTGAGG CCAGTCTAGT 3120
CTATAAAGCA AGTTCCAGGC CAGCCACTGA GAACTTGTCC TCTAAACAAG ACAAACCCAT 3180
GACCTGAAGC ATACTAAACA AGTGCTCTAC CATCAAGCTA TGACCAAAGC CCTATATAAT 3240
CTAAAAGCCC CAGTAACTGA CCACTTATGG AGCACATCTG CTAATATTGA GCTGACTAGA 3300
TAGGCACTTT CTCTAAATCT 3320