EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM029-00940 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum_neonate 
Coordinate
chr1:88382750-88386000 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr1:88384226-88384237GACACGCCCCC+6.32
KLF5MA0599.1chr1:88384333-88384343GCCCCGCCCC+6.02
NRF1MA0506.1chr1:88384209-88384220GCGCCTGCGCA+6.62
NRF1MA0506.1chr1:88384243-88384254GCGCCTGCGCA+6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:88385979-88385994TGAACTCTGGACCTC-6.48
RARAMA0729.1chr1:88385976-88385994AATTGAACTCTGGACCTC-6.29
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02944chr1:88330130-88420834TACs
mSE_03375chr1:88383595-88385423Bone_Marrow
mSE_04119chr1:88383297-88384234Cortex
mSE_04119chr1:88384297-88385210Cortex
mSE_04478chr1:88383224-88385663E14.5_Brain
mSE_05222chr1:88383235-88385134E14.5_Heart
mSE_05516chr1:88383250-88385437E14.5_Limb
mSE_06338chr1:88383090-88385848E14.5_Liver
mSE_07256chr1:88383243-88386033Intestine
mSE_08172chr1:88383329-88385901Kidney
mSE_09100chr1:88383362-88385672Lung
mSE_10015chr1:88383220-88384191Embryonic_stem_cells
mSE_10015chr1:88384308-88389863Embryonic_stem_cells
mSE_11278chr1:88383336-88384204Placenta
mSE_11278chr1:88384254-88387917Placenta
mSE_12090chr1:88383415-88385750Spleen
mSE_12613chr1:88383312-88384220Testis
mSE_12613chr1:88384294-88385552Testis
Enhancer Sequence
GATCTGCCTG CTTCTGTCTC CTGAGTGCTG GGATTATAGG AGTATCTAAT AACAATTTTT 60
ATTTCTTTTG AGCTGACCTC TACCTGAGAC CTGACTCTGC TTCCTAAACG CTTGTATTAA 120
TGGAAAAAAC AAAAAACAAA ACCATACCAG CTAATTGTAT CTTTTGGGGG GTAAGGGGGA 180
TTGAACAAGG TTTGGACCAC TCTCTGTAGA CCAAACCTTG AACTACGAGA TCTAAGAGAT 240
CCACCTGCCT GTGCCGGGTA CTGGGATTAA AGGAGCGTGT TACCACTGCC TGGCCTAATT 300
TTATTTTATT TTTTTTTGAA GATTTATTTA TTTATTATAT GTAAGTACAC TGTAGCTGTC 360
TTCAGACACT CCAGAAGAGG GCGTCAGATC TTGTTACAGA TGGTTGTGAG CCACCATGTG 420
GTTGCTGGGA TTTGAACTCC GGACCTTCGG AAGAGCAGTC GGGTGCTCTT ACCCACTGAG 480
CCATCTCACC AGCCCCTAAT TTTATTTTTA AAAGATGTTT TTTATTTTAT GTGTATGGGT 540
GTTTTCCCTG CACAGGTACC TATCTATGCA CCACTTTCTT GCCTGGTGCT CAGGGAAACA 600
ACAGAAGGCA GTCTCTGATC CCTTGGGATT AGTAACAAGA TGGTTGGTTG TGGGTGCTGG 660
GAATAGTATG CTAGCCCTCA ATAGTAAAAA GTGCACTTAA CCACTGAGCC ATCTTTCTCC 720
GGACCGCTTT TATTTCCTTT TTTGAACATG TTTCTAAACT AGGGTTCAAT GACCCTGAAC 780
TCTCTTGCCT CCACTGCTAG AAAGAATACT TACAGGTTAT GGTTAAAATA CTTTTAAAAA 840
TGGTTTGTCA CCGCCTTCGG TGAAATGTCT CTTTAACAGA AAATGTATTT CTGTTGCTCA 900
AAGGCATTCC CAAATCAAAT TTGCAAATAG CACCTTGCAA AAGGTTGGGT CAGTTCGGTA 960
ACTTCTATGC CTTTGCCTTA TCCATGGGAG TCTCACATCG CGATACAGGC ACTTTACAAA 1020
GGGTTAAGCT ACCATCTCCG TGCTCAAGGG GACCGTGAGA GGTAGAGAAC TCGGGAAGCA 1080
AGAGGCGCCA TGGGCTGCCC AGCAGGCGTG CGGGTCCCCA CAGGCTCAGA AACGCTGCCA 1140
GCCGCGCCAT TTAGGTCGCA GGAGAGAAGA TGGAGGATGC TCATCCTCCC GGCGCGACCC 1200
GCGCCTGCGC CCTGTGTACC CGATGCGTCC CGTAAGGCCG TTAGAACAGG CAAAGGAGGT 1260
GAAAGGGAAA GGAAGGGAAG GGAGCGTAGG GAGGGACCAA GCCCGCGGTT CCGGCGAGCC 1320
CGGCTCCTGC GCCGAAAATC CGTTCCAGGT CGTCAAGACC TGAAGCCGCT CCACGAACCC 1380
CGGCCGCGCT CCGCGTTTTC CCTAAAGCCC TTTGTGTCCC CGCGCGCCTC TGGGAACGCG 1440
GGAACGCGCG CTGAGCTGGG CGCCTGCGCA AAGAAAGACA CGCCCCCAAC CGGGCGCCTG 1500
CGCAAAAGGG GGCGCGTGCA GGTCGCACGC CTGCGCAGAA ACAGGCGCGC CCCTCCCGTA 1560
CTTGAGGATG GGCGCCCTGC TCTGCCCCGC CCCTGCCCGC CATTTCGCGT TCCGTCGCCT 1620
CTCCTGAGCC GACGTTCGCG GCGTTTGTGT GATGGACGCC TCGAAGCTGG TACAACAAAA 1680
GCCGTCGTTG CTCGAGCTGC GCGGGCTGCG TGTCTTGCCT CTGGCCACGG CACCCAAGGA 1740
CGGGGGAAGT GGGCGACTGT GCACACTCTG ACATGGGTTT GCTAGTCAGC CCGTGCGTGC 1800
AGAACCTTGG CGCAGCCGCC TTCTCGTTGT GTCCATCCTC GAAGCCTGCA CCCTCCTAAC 1860
CTACATGCAC AGCCAGAGTC GTGTTTGCCC TCTTCTTCTA AGTGTAGAGA CTGACGGGCT 1920
TCCACGTATC GTGTGAATTC GTTGGGAGGA TGTATTCGAC CTAAGTGTGT CTTCAGTTGG 1980
GTTGCACCTC CTGGCTGATT ATAATAAGGT CTGCACTCAA CTTGTTTTTG AGTCTCGGGG 2040
AGCTGACTAG ATTCACCGGT ACCTTATTCT GTGTCTTGAG AGAAACTCTC GTTCGAGACA 2100
TAGAATCCAT CGTTCTTGAC GAGTTAATAT AAAAAAAAAC CTAACCACCC GGTTCCCATT 2160
CCTTGTGGGA TTCTATTTTA ACTTTTGAGA CAGGGTCTCC CCTGATTGCC CAGGTTGGCC 2220
TCTAACTATA GCAACAGCCT GCCTCTGTAT CCAAAGTGCT ACGAGAAAAG ACGTGCGCCA 2280
CTACTTCCGA TGTACCTCTC CTTATGTTTA AGCTTCTCTT TGGGTACAGC TTTTGCACAA 2340
AAGGCATGCA GTGACGAGGA GAGTGGCCCC TGGGTGAATA TTCAACTAAG GATGTCTTAA 2400
TGACCCTGGG AAGGAGGTGG GTTCTTTTAA AAGGTCAAAA AAATGTGTTC TGGAGGAAGC 2460
TCTTTTGTGG ACTGTTGTCG CCAAGCGTAT ATTTGGATTG AAAGAATCTA ATGGGAGGCC 2520
CAGCAGTGGG GACAGTCATA GAATAGAGGG TGTGTGGAGA AAGACACGGG TTTGTGGCAT 2580
CTCCAGAGGA GAGAAGCCTC AAGAGGTGAA GTGAGATTGA GTGCATCCCA GACCAGCATC 2640
CTTAGGAATA ACTACTACAG TGTGTTCTCT CTCAACATTA ACCCCACTGG TAGCCCTAGC 2700
CTTAATATAA CCTTGAATGC ATCCCGCTGA TCCTTCCTGG GTGCTGAATT ACACCACACC 2760
CAGCAAATAG TGCACATATA CCTAACAATA GCTACCCTAA GAAGAGACCG GAAACAGATG 2820
GGTGTGGGGT CACATGCTTT GAATCAAAGT ACTGGGAGGC TGAGGCAGGC CTAGCTCTGA 2880
GTTCCAGCCT GAATGGTCTA CAAAGGTGTA ACTTTTCACG TAGCTTCTAA CTGATGGCCT 2940
TCTTTCCACA CATATCTCCA ATGTATCCTG GAGCGCCTGT GTGAGCAGGT CTCAAGTCCA 3000
CAGATAGCCC TAATGTATCC TGGAGCACCT GTGTGAGCAG GTCTCAGGGA CAGGACTCCA 3060
TTGTAGGCTG TATCAGTCAC TTACAACTAC AGTGAAGTTT TTGTTTTGTT TTTTAAGATT 3120
TTTTTTATAT CATGTATGTG AGTACATGGT CACTGTCTTC AGACACACCA GAAGAGGACA 3180
TCAGATCCCA TCACAGATGG TTGTGAGCCA CCATGTGGTT GCTGGGAATT GAACTCTGGA 3240
CCTCCAGAAG 3250