EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM028-27906 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr7:52317900-52320470 
Target genes
Number: 38             
NameEnsembl ID
Shank1ENSMUSG00000038738
Kcnc3ENSMUSG00000062785
Vrk3ENSMUSG00000002205
Nup62ENSMUSG00000043858
Il4i1ENSMUSG00000074141
Atf5ENSMUSG00000038539
Akt1s1ENSMUSG00000011096
Tbc1d17ENSMUSG00000038520
PnkpENSMUSG00000002963
Ptov1ENSMUSG00000038502
Med25ENSMUSG00000002968
FuzENSMUSG00000011658
Ap2a1ENSMUSG00000060279
Cpt1cENSMUSG00000007783
Prmt1ENSMUSG00000052429
Gm15545ENSMUSG00000087138
Irf3ENSMUSG00000003184
Bcl2l12ENSMUSG00000003190
Scaf1ENSMUSG00000038406
RrasENSMUSG00000038387
Prr12ENSMUSG00000046574
NosipENSMUSG00000003421
Rps11ENSMUSG00000003429
Rpl13aENSMUSG00000074129
Flt3lENSMUSG00000089989
Pih1d1ENSMUSG00000003423
Aldh16a1ENSMUSG00000007833
Slc17a7ENSMUSG00000070570
Dkkl1ENSMUSG00000030792
Tead2ENSMUSG00000030796
Cd37ENSMUSG00000030798
Mtag2ENSMUSG00000091510
Lin7bENSMUSG00000003872
Snrnp70ENSMUSG00000063511
AC151602.1ENSMUSG00000076036
Ftl1ENSMUSG00000050708
Nucb1ENSMUSG00000030824
DbpENSMUSG00000059824
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr7:52319544-52319555TTCAAGGTCAT+6.62
EsrrgMA0643.1chr7:52319545-52319555TCAAGGTCAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr7:52319979-52319991AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr7:52319983-52319995AAACAAACAAAC-6.32
HNF1AMA0046.2chr7:52318003-52318018TGTCAATCATTAACA-6.28
HNF1AMA0046.2chr7:52318003-52318018TGTCAATCATTAACA+6.49
HNF1BMA0153.2chr7:52318004-52318017GTCAATCATTAAC+6.52
HNF1BMA0153.2chr7:52318004-52318017GTCAATCATTAAC-6.78
Nr5a2MA0505.1chr7:52319541-52319556CAGTTCAAGGTCATC+6.97
ZNF143MA0088.2chr7:52318055-52318071TTCCCAGGATGCCTTG+6
ZNF740MA0753.2chr7:52318414-52318427CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
GGTAAGCTGC AGGCGGTGAG GGGTCGCGTC GCCAAGTTTC CTTCTTGTGG GAGAAATTTG 60
CAGTTCTGAG GGAGGTAGGA TAAGGTTTCG CACTCCGAAT CCCTGTCAAT CATTAACAGC 120
GCTCTTGAAC GCCTAGGTTG GAAGACGAAC TACATTTCCC AGGATGCCTT GTACTGTCTC 180
CCTCATCCTG GCTGGTTGTA GAAAATGTAG TTCCGCAGTA GAGGAGTGAT GCGGACCAAG 240
TGAGGGGGAA CTTGGGGTTC CCTGTGTTAG TGAGAGTTGA GGTCGGATTT CTAGACAATG 300
GTGAGGAGGG GAATGAGCAG TAGTGGTTTG GACCCTTGAA GGTTCCTTGA AGCAATTAAA 360
ATATTTTATT CTGCTTGAGA CCGAGTCTCA GTATGTAGCC CTTGCTGTTA TAGAACTCGC 420
TATGTAGTTA GCCTCAAACT CACAAAGATC CGCCAACCTC TGCCGCCCAA GTGTTGAGAT 480
TAAAAGTGTG CACCACCACA CCTAGCACTT ATTACCCCCC CCCCCCCGCC CCATTGTTCG 540
TTTTTGTTTT TTGGCTTTTC GAGACAGGGT TTCTCTGTGT AGCTCTGGCT GTCCTGGAAC 600
TAGCTCTGTA GACCAGGCTG GCCTCCAACT CAGAAATCCG CCTGCCTCTG ACTCCCAAGT 660
GCTGGGATTA AAGGCGTGCG CCACCACCCC AACGATTATT GTATTTTTTT GAGGCAAGGT 720
GACATGTAGT CCAGGCTGCA TCGAATTTCA CTAAATATCT CTAAGGAGAT TAAGATTTAT 780
TAGCTGGGCA GTGGCAAAAA AAAAAAGATT TATTTAAAGT AACGAGGGGG GGGATGGGTG 840
GGATTAGGGT GCATGATGTA AAATTCACAA AGAACGTAGG ACATTTGAAA GCCCCCAGAA 900
GGAGATTTAT TTAAAGGGGT ATGGTAGACA CATCTTTGAT CCCAGAACTG GGCGCAGAGG 960
TAGATGGATT TTCCTGAGTT TGAGACCAGC CAGGGCTACA TAGTGAGACA CTATCCTGAA 1020
AAGAAAAGGA AAGGAAAAGA AAAGAAATGC TTTCCTTTTA TTTTATGTAA ACGAGGGTTT 1080
TGCCTGTTTT TATGATTGTG CACTCCATGT GAATGCACTG TCTACAGAGC CCAGAAGGCC 1140
ATTAGGTCCC CTAGAACTGG AGTTGTGAAC TGCCATGTGT GTGTTAGGTA TCAAACCCAG 1200
GTCCTTTGGA AGAACAGCCA GTGCTTTTAG CCACTGCCTC ATCTCTCCAG CTTCTTAATT 1260
TGTTTTTTGT TTTTTTTGTT TGTTTTTTGT TTTGTTTTGT TTTGTTTTGT TTCTTGAGAT 1320
GCACAACCTG GTACTGAAAT TAAAGGCATG CAGTCCCCAC TCCTGGCTCA TGTTCTTATT 1380
TTCAATGAGG TTTATTGGGA TATAATTTCA CATACTGTAT ACTTTACCCA CTTAGAGCAA 1440
ACAATTCAGT GGTTTGTAGT ATACGCCCAG AATTGTACTG ACATCACCAC TAACAATTTT 1500
AGAGCATGTT CTCTGGGTGT GGTACCACAC CTGCACTCCC CTCAGTCCTG AGGAATTGAA 1560
TGCCTTCTGG CCTCCAAGGG CAGCAGGCAG TAAGCTGCTT CAGAGATGTA ATTACTCAGT 1620
AGGTAGAGGC TGAACAATCA ACAGTTCAAG GTCATCCTCA GATGCATAGA GAATCCGAGG 1680
CCTGGACTAC ATGAACTACC CTCTCAAACT GGACATGGTT AACACCCCCT AAGAAAGATC 1740
TTGTCCCACA TTCTTTGCCA CTTAGTCTTT CTCACCCCCA GTTCTTGGCA GTCTCTAAAC 1800
TCGTATGCAT TTGCCTAATC GGCTGGGCTT TTGTGACTGG CTTCTCTCCC GCACTGTGTT 1860
GTTTCTAGGT CTGTCCCTGT TATGGCCTGT TTGCAGATGA ACAGTCTGTT GTATGAGATA 1920
TGCTGTGCCT TATTTCTCCA TCAGTTGGTG GACCTTTAGG ATTGTCTCTA TTGGCTATAC 1980
GAGGTGCTGC TGTGAGCATT TGTACACAAG GCTTATATGG ACGTTCCAGG ACAGCCAGGG 2040
CTATACAGAG AAACCCTGTC TCGAAAAACA AACAAAACAA AACAAACAAA CAAACTATAT 2100
ATATATATTT TTATGTATGA GTGCTCTGTT TACACGTACA CCTGCATGCC AGAAGAGGCA 2160
TCAGATGTAG ATGGTCGTGA GCCATCATGT GTTTGCTAGG ATTTGAACTC AGGACCTCTG 2220
GAAGAACAGT GTTCTTAACC ATTGAGCCAT CTCCCCAGCC AGTTGTTGTT TTTGAGCAGG 2280
GTTTCTCTGT GCAGACCTGG CTGAGCTAGA TCTGGCTCTG TAGACCAAGC TAGCCTCGAA 2340
CTCAGAGATC CGTCAGCTTC TTCCTCCCAG GGGCTGGGGT GAAAGCTATG TATCATGCCT 2400
GGCTGTACTG GGTTTAGACC TGGGGGCAGC AAGCACCTTC CTAACTGATC TGGGCCGCAG 2460
GCTTACACAT GTGCTCTCAG CCAGGGCCTG CTTTGTTTGT TTATATATTA ATAGTAAGTT 2520
ACTACTAATG CTGCTTTGGT TTTTAGAGAC AGGGTTTCTC TATGTAGTCC 2570