EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM028-23071 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr4:154865680-154868140 
Target genes
Number: 41             
NameEnsembl ID
2810405K02RikENSMUSG00000029059
Plch2ENSMUSG00000029055
Rer1ENSMUSG00000029048
Morn1ENSMUSG00000029049
SkiENSMUSG00000029050
2610002J02RikENSMUSG00000073684
PrkczENSMUSG00000029053
GabrdENSMUSG00000029054
2010015L04RikENSMUSG00000042233
5830444B04RikENSMUSG00000084803
C030017K20RikENSMUSG00000078490
Tmem52ENSMUSG00000023153
Gnb1ENSMUSG00000029064
Gm13171ENSMUSG00000082429
NadkENSMUSG00000029063
Slc35e2ENSMUSG00000042202
Gm16023ENSMUSG00000086682
Cdk11bENSMUSG00000029062
Gm10563ENSMUSG00000073682
Mmp23ENSMUSG00000029061
Mib2ENSMUSG00000029060
B930041F14RikENSMUSG00000091921
Ssu72ENSMUSG00000029038
U6ENSMUSG00000064916
1500002C15RikENSMUSG00000073681
Gm5151ENSMUSG00000084845
Atad3aENSMUSG00000029036
2610204G22RikENSMUSG00000054514
Gm17585ENSMUSG00000090418
Vwa1ENSMUSG00000042116
Gm13644ENSMUSG00000085119
Tmem88bENSMUSG00000073680
Mrpl20ENSMUSG00000029066
Ccnl2ENSMUSG00000029068
Aurkaip1ENSMUSG00000065990
Mxra8ENSMUSG00000029070
Dvl1ENSMUSG00000029071
Gltpd1ENSMUSG00000029073
Cpsf3lENSMUSG00000029034
Pusl1ENSMUSG00000051557
Sdf4ENSMUSG00000029076
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr4:154866753-154866764TTTGATACATT-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:154866902-154866915TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:154866899-154866912ATTTAATTAATTA-6
Nr5a2MA0505.1chr4:154865975-154865990GGGTTCAAGGCCAGA+6.4
POU6F1MA0628.1chr4:154866904-154866914ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:154866904-154866914ATTAATTAAT-6.02
Sox3MA0514.1chr4:154866571-154866581AAAACAAAGG-6.02
ZfxMA0146.2chr4:154865895-154865909CAGGCCCGGGCCGG-6.51
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07417chr4:154859599-154867009Intestine
Enhancer Sequence
GAGGGCGAGG TGAGCGCGGC TGGGGTCTGT GAGCTGAGCC TGCCCCGCGC TGGGCCAGGC 60
CCTGCGGCTC TTCTCGCTCG TGGGTCATCG GCCGCCGTCT TCATCCTGCT CTTCAGGGTT 120
GGGTGGGCGA TCCCCGGCGT GCCGGGTGGG CGGCAGGGCT GGGGTCTCGG GGTCCGGGGG 180
GTGAGGGATG GGGCGGAGCC GCCTGGGCCG GGGCGCAGGC CCGGGCCGGG GTCTTAGGCT 240
CAAGGCCGCG TCCGGGGTGC GGGCCCGGAG ATGCGGCAAC CTGGGTGGAG GTCCTGGGTT 300
CAAGGCCAGA TCTGGGATGG GTTCTGGGTT CAAGGCTGGA TCCCGGATGC GGGACCTGAT 360
CTGTGGTCTT GGGTTCAAAG CCCGTGTCGG AATTCGGTTT CCAGACTCAT TCATGTTCCT 420
GGGGTCGAGG CTGTTGCGGG GGGCGGGGGG GTCTAGGGCC TGATGCGGGA TCCCGGAGGT 480
GGTCTTGAGT TTTAAGAAAG GGAACGGGAT GCAGGGCTGG GGCTCGGGTC GTAGGTTCGA 540
GCCTGGATGG CTTGCTAAGG TGGGGATGCC AGGAGAGCCG CAGGCGCTTC TTCTCGCGGC 600
CGAGTCCCCG CGGGAACAAA AGCCGAGCTC TGCCCTCCGG ACCGCGCCTT CCTGCGGGGC 660
GTGGGACTCG GCCGGGCGCG CGGGGAGCGG ACACGGGGCG AGTCTACTGG ATTCGGCCAT 720
CAACCCCTGC CGGGTGCGGG CCTACGGCTA CCAAGCTTCC CAGCTTCCTT CGCTGCCGGC 780
CTTCCTGGCC CCAGGCACCC GTAAATGAAT GGGCGCCGCG TCCGGTCGCC GCGACAAGAT 840
GGCGATACCC GCCTTTGTCA GCCAGGACCG CGCCGTCCGC TGCCGGGGCT GAAAACAAAG 900
GCCGGCTCTG GTGGCCGGTG CAGAGGAAAA GGCGCCGGGC TCCTGGGTTC GCCTGATGCA 960
TCAGTGCTGG GAGGGGACGT CCTGCCCAGA GCACTCAGAG GGTGGCCTAG TCTTTCCGCG 1020
TCTCCTCCAC AGCCTCGGGT TCCCCTGGGG AACTGCAGCT TGGCTTTTGA CCTTTTGATA 1080
CATTTAAACA TTTTTTTTTT CCGGGTTTTT TTAAACCACA GGATTAGCAT CCCGAAATAG 1140
CATCCCTATA CGTGTTCAGC TCATCTTTAA AGAGGTTATG TCAAAATTTT TATTTTGAGA 1200
GGAGAATTAG TGGGGCTTCA TTTAATTAAT TAATTGTTTA GTGCATTGCT GTTTTGCCTG 1260
GATGTGTCTG TGTCTGTGTG TGTATGTGAG GGTGTCAGAT TCCCTGGAAC TGGAGTTAGA 1320
GTCATTAGCT GACTTGTGGG TGCTGGGAAC AGAACTCAAG ACCCTTTGGA AGATCAGCCG 1380
ATGCTCTTAA CCCCTGAACC ATCTCTCCAG CCCCGAATTA GTAGAATTTA TAAGTATATA 1440
AATGACACTT GTGCATGAAT TTTGAAATTT CAGGTAATTT GTAGTGTTGG TTTGGTAGTA 1500
ATAGTACTTT GTATTGTTAT GTTTCGATCT GATAGCAGCA ATCAAGCCTT TCTCTGTGTG 1560
TGGTTAAGTA GCCTGTGAGA TTTACTGTTA ACTAAGAAAA TATGTAGTCA TTCTATCATG 1620
ATAAATGGAA GTGTTAATAT TGTGAAAAGT TCCATTTCAC TGTGGAGACT AAATGTGGTC 1680
CTCAGAGAAA CCATTAGTCA GTTTCTATGT AGTTTTTGTT TGTTTGGGTT TTTGTTTTGT 1740
TTTGTTACAT CTGAAGCTGT AGTGGTTTTT GGTGGTGGGA GATATTTGAA GATAAGGCTT 1800
TTAGTTTTCA TGCTAAGATG TCTTCTGGAT TCTTCTGGAA GGTATATTGC AAAAGGAAAA 1860
TTTCTTCCGC CGGGTGTTTG GCCAGGGATG GAAATGTGAA GAGGCTTTGA GCCTCTAGAC 1920
AGCAGAGCTA GGTTCTGGAT AGATAGGACC TAGGGAGAGT GACCTTTTTC ACAGACCTGT 1980
GCAGGAATGC AGTGCAGCTG GGAAGGCCCT GGTCTGCATG GGAGAGGCTA GACTGTAGGT 2040
GTAGGGTTCT GACTGCACGT ATTTCACTTC TACAGTGTGC TGTCTTTCTT AGAAGGTGAG 2100
AGCCTTGAAA GTCAAAAGTA GGTTTTCTGA GGCTGTGTGC TCATACCTGC TGCCTGGCTC 2160
CTGGGTTTAG TGTCAGATGC TCAGTGTCAG GATTGTATTT TATTTATCTG GTGGTTTCTT 2220
GCAAGGATCT TTTTATGCAG GAGATTGAGC ATGCAACTTT GAACAGTGTC TTCCATGGAT 2280
GAACTCATCC ACTGGATACA AACAGTTCTT AAATAGTATC TGAGCTGATA TCAAATCTGT 2340
ATTCGTTTAA TTCGAGTAGT ACAGAGTGCC CCTTGAACAC ACTTTTTAAA AAGGCTTTTC 2400
TGTGTTTGAT AGCCTTGGTT ATATCTGATT TGGGTGAAGG GGAGACCAGG TAAACTTCCT 2460