EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

MM028-22361

Organism

Mus musculus

Tissue/cell

Cerebellum

Coordinate

chr4:134132620-134134200

Target genes

Number: 14
Name	Ensembl ID

Pdik1l	ENSMUSG00000050890
Extl1	ENSMUSG00000028838
Pafah2	ENSMUSG00000037366
Stmn1	ENSMUSG00000028832
Paqr7	ENSMUSG00000037348
2610002D18Rik	ENSMUSG00000078521
Fam54b	ENSMUSG00000046671
Sepn1	ENSMUSG00000050989
Man1c1	ENSMUSG00000037306
Ldlrap1	ENSMUSG00000037295
Tmem57	ENSMUSG00000028826
Tmem50a	ENSMUSG00000028822
D4Wsu53e	ENSMUSG00000037266
Syf2	ENSMUSG00000028821

TF binding sites/motifs

Number: 3

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

Nr5a2	MA0505.1	chr4:134133719-134133734	GAGTTCAAGGCCAGC	+	8.25
TBX20	MA0689.1	chr4:134133536-134133547	AAGGTGTGAAG	+	6.32
TBX21	MA0690.1	chr4:134133536-134133546	AAGGTGTGAA	+	6.02

Enhancer Sequence

CAAGGCAGTG GGAGCTGAAA GGGAGGGTTG AGGTCCTCTC TGTCTGGGGA TGGTGGGCCC 60
CTGCTGCAGC TATGTGGTGT TTGTGTGACA TGTATATTGT TGGCATGTAT GTGTATTTTT 120
GTGTGTGCTT TTATACAGTG TATGTGTTGT TTTGCGCCTG TGTTTTTGTG TATGCATGTG 180
TCTGTGTGGT GTGCGTTTGT ATGTGGTGCG TAGGTGCAGT ATGTCTGTAT ATATGTGTGT 240
GGGTCTGTGT GGCTTATGTC TGTGTACTTG TGCATGTGTG CATGCATGGG TCTGTGTGAT 300
GTATGTCCAT GTGTATGCTG TGGCATGTGT TTGTGTAGGA CTGTGTGGTT TATATCTTTG 360
TGTCTGGTGT GTGTGTATAT GTGTGGTGTG TTTGTGCATA TGTGTGGGTC TATATGGCAT 420
ATGGCTGTGT GTATGTATAT AAGTGTGCTG TGTGTTGTGT ATATGTATGG ATCTTTGTTG 480
TGTATATCTG TGTGTGTGTT TGGAGCCCAG TGGATTACCC TGGGTAGATC TAAGCTGTAG 540
GAGGAGTTGG GTCTCCTGAG AGGCTGAAGC CAGGTGTGGA GAGTCTGGGA AGCAGGCAGG 600
AGCAGAGGCT GGGTGGCCTG AGCTGTGGCC CTAACTCTTT CCCCTTCATC TGTCATTTCT 660
GAGGTTGCAA ATGATATAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 720
ACACACACAC ACACAGAGCC TGAAAGTGCA GTTCCTGCTG ACTGACCACA TGGCTGAGCC 780
TTTGACACTC TCCCAGAGCC TGGCTCTTCC ACAGTAAGCT CAGCAGGCTC TGCGGGCCTG 840
GTCAACTCTC CGTCCAGTCC CACTCTATCT GTGGCTAGGA CTTGGGGGAA GCCCCACAGG 900
TGTTTGACAA AGTTGCAAGG TGTGAAGCCA CACACCCATC ATCTCAGCAC TTGGGGTGTG 960
GAGGCAGGAG GACTCAAAGC CAGCCTGGGC TACCTGAAGA CCTTATCTCA AAAAGTCTTT 1020
AAACAGTAGG GCTGTGGTGG TGCATGCCTT TGATCCCAGC ATTCAAGAGG CAGAGGCAGA 1080
GGCAGGAAGG CAGATCTTTG AGTTCAAGGC CAGCCTAATC TAAAGATGGA GTTCCAGAAT 1140
AGCCTGGGCT AATTCTTTAA ATTGAAAACG CCCAGGACTG ATTCAAGGAA GTTAAAATAT 1200
AGTGGTAAGT GATTTTTAGA TCACTGCCTA GTTTGTCCCC ACCTAAAATT TTATCTCAAT 1260
CAAAGCTGGA GGTGGGAACC AGATCAAAGG GGTGGGGGGA GCTCCCCGGG CCCTTTCCTG 1320
CAGTCACTTC TGAATGATGG CCTTAAGTGG GACATTCCTG CAAGTCTGGA TAATGGAGGA 1380
GGGTGCAGGG CTGCTGAGAG AGATGGATGC TAAGGCGGCT GGGAAGAGTT GGGCACACAT 1440
GTAGGTAGGT AGGTGCTGGC ATGTCCAGGC TGGTGAATCC AGAGCTGGTG CCCGACCCCG 1500
GCTCTCAGCC GGAGCCTGCT AGGATTCAGG AAGCCCGAAT GGGAACCCAC GGGAGGAGAA 1560
GCCACAGGGC CAGTACTTAC 1580