EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM028-20087 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr3:88752600-88753780 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
Cct3ENSMUSG00000001416
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
U1ENSMUSG00000064738
nENSMUSG00000065236
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
U6ENSMUSG00000065786
SNORA17ENSMUSG00000077804
Rusc1ENSMUSG00000041263
FdpsENSMUSG00000059743
Hcn3ENSMUSG00000028051
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
Gm16069ENSMUSG00000086718
Fam189bENSMUSG00000032657
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Muc1ENSMUSG00000042784
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Dpm3ENSMUSG00000042737
Slc50a1ENSMUSG00000027953
Efna1ENSMUSG00000027954
Efna3ENSMUSG00000028039
Pygo2ENSMUSG00000047824
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr3:88752801-88752812ACAGATAAGAA-6.14
Gata1MA0035.3chr3:88752801-88752812ACAGATAAGAA-6.62
Enhancer Sequence
GGCTAAGACA GGATGACTGT CAGAGTTTCA GGCAAGCTTG GGCTAAAGAG TGAGACTGTC 60
AAAACAAACA AATAAACAAC CACTCAAAAG ACAATTTAAC CCCTATTCCA AAAAAAGACT 120
GAATATTAAT TGAATGGGTT CTGGAGATGA ATGGAACGCA GTAATGTTTA AATTTCCCCT 180
GAATCACAAA GGTAAGAATT CACAGATAAG AAAGGAAACT TAAGGTGCCA TTCCTCTAAA 240
ATTTTGCTTT GCTTTTTGTG GGAGACTAAA AATGAGTAGA TCAAACGTTG GGGTTTTAAC 300
ATCACATGCC CTGAATTCAC TCATCCAATG TCAACACGGA AACAAATACT AGCAGCCAAT 360
GAATGCCATA GGTCTGGTTT AACTAGCAAT TTAGATGAAT AGAACACAAA CTACCAATTA 420
CACCTACAAA TCTTATCAAC ATCAACAGCA CTGTAAATGA TAACAATAAT ACTCCGCATT 480
TTCCCCGTAC CCAGGAGCTA ATTCTGCTTT ACATATATGA TCTCATTATT TCATACTCCA 540
ACCCTGAAGG TATATTTTGG GGTTAGCTAA TTTTTACTAC CAGCATCTCA TAAATAACTT 600
GGAAAAATTT GAAGGCCTAA AAGATCAAAT CCAGAAATAA AATCTCAGTG CATAGTTTCA 660
TCCCCTCACA CACTCAACCT GCGGGTGGCG ACCCGAGGAG AGGTCTAACA ACCCTTCACA 720
GGGATCCCAT ATCAGATATC CTGTATATCA GATGTTTACA TTAAGATTCA TAACAGCAAA 780
ATTACAGTTA CGAAGTAGCA ACAAAACTAA TTTTATGGTA GGGAGTCACC ATGTGGAACT 840
GTACTAAAGG GTCGTAGCAT TAGGAAGGCT GCGCGGACCA CTGCTCTAAC ATCAGGCTGC 900
CAGTTGCAAA CCGAGTTCGC ACAATCTTTG AGAAGTGCAC AAGGATCACA CAAGCATCAC 960
AGAGGATAGG TACCCTCTGG GACTTTAACA AGGTTAAACT ACATTAACAT ATTAACAGCC 1020
GTTCTGTCCG TTCATCCTCC GGTCCCAGGT CCGCAGCCCC GGGTCTGAAG GATGCCCTCT 1080
TGGAGGATCA CCGACACTGC TGCCCTCATT CCCTATCTCG GGGCAGTTCA AATACACGCT 1140
CCTTTCCCTC CTTCATCATT GCATCCCCTG TGTGGCTCAG 1180