EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM028-20081 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr3:88558680-88563530 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
Cct3ENSMUSG00000001416
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
Rxfp4ENSMUSG00000049741
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SCARNA15ENSMUSG00000088604
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Gm17146ENSMUSG00000091881
Gm10253ENSMUSG00000068924
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
Gon4lENSMUSG00000054199
U1ENSMUSG00000064738
nENSMUSG00000065236
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
U6ENSMUSG00000065786
SNORA17ENSMUSG00000077804
Rusc1ENSMUSG00000041263
FdpsENSMUSG00000059743
Hcn3ENSMUSG00000028051
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Dpm3ENSMUSG00000042737
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr3:88559304-88559315TCAAGGTCAAA+6.14
EsrraMA0592.2chr3:88559303-88559314TTCAAGGTCAA+6.14
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EsrraMA0592.2chr3:88563504-88563515TTCAAGGTCAT+6.62
EsrraMA0592.2chr3:88562843-88562854ATGACCTTGAA-6.62
EsrrgMA0643.1chr3:88559629-88559639TCAAGGTCAT+6.02
EsrrgMA0643.1chr3:88563505-88563515TCAAGGTCAT+6.02
EsrrgMA0643.1chr3:88562843-88562853ATGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr3:88561473-88561485AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:88559855-88559867AAAAAAACAATC-6.44
Gfi1bMA0483.1chr3:88560771-88560782AAATCACAGCC+6.02
Nr5a2MA0505.1chr3:88559625-88559640GAGTTCAAGGTCATC+8.03
Nr5a2MA0505.1chr3:88563501-88563516GAGTTCAAGGTCATC+8.03
Nr5a2MA0505.1chr3:88562842-88562857GATGACCTTGAACTC-8.03
RREB1MA0073.1chr3:88563130-88563150CGGGAGTGGGTGGGTTGGGG-8.4
RarbMA0857.1chr3:88562541-88562557TGTCCTTTTTACCTTT-6.18
SPI1MA0080.4chr3:88560193-88560207AACTTCCGGTTTTC-6.44
ZNF263MA0528.1chr3:88558852-88558873GAAGGAGAGAGAAAGAGAGAG+6.19
ZNF263MA0528.1chr3:88563148-88563169GGAGCAGGGCGGGGGTGGGGG+6.7
ZNF263MA0528.1chr3:88560245-88560266GCCTCCTCCTCCTCCTCCTCT-8.51
Enhancer Sequence
GCAGAGGCCC TAGGCCCCAT TCTTAGCATC ACAACTGCCT GTAACTCCAG TTCCAGGGGA 60
TCCCATGCCT TCTTCTTATT TCTATGGGCT CCTGCATGCA CATAGTTCAC ATATATACAG 120
CCAAGCACAC ACACTCATAC ACATAAAATA AATGAGAGAG AGAGAGAGAG AGGAAGGAGA 180
GAGAAAGAGA GAGAGGTTAT TGCTTTTGTA GAGGAGCGGA GTTTGATTTC CTGCACCCAT 240
ATCAGATGGT TCATAACCAT ACATGCTCAC ATAACCCCAC ACAAGCACAC ACACATAATT 300
AAAAAAGAAA ACATTTCCTT CTCAAAGACA AGCATTTTGG TCTTGTCCTT GGGGCTAATG 360
GTGATCAATT TAATTGAAGA AGGGTTGTTT TTGCTGGAGT TGTCATCTTT CATAAATGTC 420
CCTGCCTTCT AGTGGAACTG ACAGATTTTT GGGGCTTGAA TTGTGGAAAA AGAATAGGGT 480
GGAATAAAAA CAAAGTCGCA TACCAAGGAG GAGCCTGCCG CTCACTTGGT GGAGAGTTTG 540
CTGAGCGTTC CCAAAGCCCT GCATTTGATC CCGAGCACCA TAGAAAACTA AACACGGCTG 600
AGAAGAAAAG ACAGGATCCA AAATTCAAGG TCAAAATCCA TTTCTCCAGG GTCTCGGGAA 660
AGCACCAGTT CTCATTGCCA CATCAAGTCA ATTTCTTTGC AACAGAAGAC TACCCCAGAA 720
AATTACAACT GATCAAATGC CTAGTTGTGG AGCCCCATCT CAACTGATGA ATGTTCAGCA 780
TAGACTGTAA GAGCCAGGGG ACCAGGAAGT CTGTTGTGAG ACTCTGTGTC CTAGAAACGT 840
CAGAGAAGCT ACACACACAT GAAGCCTCAC CAACACGACT GCCTAGACAG GAGCTGAACA 900
GAACTTTCAC CTGGAATCCC ACTGTTTAAC AGGCCTTGGG GTCAGGAGTT CAAGGTCATC 960
CAAAGTTACT CAAGAGTCTG CCGTAAAACT CCAAAAACCA GGCTGGAGAG ACAGCTCATC 1020
AGAGAAGAAT GCATGTTTTC CTGGGTTTGG AGGTGTTGGC TCACAACCTC TATAACTCTA 1080
GTTGTAGGGA ATCCAACACT CTCTCTGGCC TCCCAGGGAA CCAGGCACAT GTGTGGTATA 1140
CATAAACACA TGTAGACAAA ACACTCATAG ACATTAAAAA AACAATCTAA AGAGGATATG 1200
TCCTTATCAA AAAAAAAAAA AAAAACCCAC CAAATACCAA ACCTACTTAA CAAATATGAT 1260
TACAGCTTAG AGCTGTGCAC AGTGGTACAT GCCTGTAAAC CCAGCTGCTC CAAAGCCTAA 1320
AGATGGGGGA TGGCAACCTT GAACCTCGAT CCAGTAGCTT GGGGGAGACC CTCTCTCAAA 1380
CCAAAACCTT TAACAGCAGC CCTGAAAGCT GTTTCAGAAG CCTAAGTTTC CTAGTTATTG 1440
TTTAAGGCTG TCTCCAGATT ATCTGTTCTT GCAGAGTCCC TGTGCCCCAT CCTAGTTCTC 1500
CGGGAAAATG GACAACTTCC GGTTTTCTCT CCTACATCAT TCCTCAGACA GTAACCAGCC 1560
TCCTGGCCTC CTCCTCCTCC TCCTCTGGCT CTTTTCCTTG AGCAGCATGG CCACCCCACT 1620
CAGCTGCCTC TGTGCTATGA AGCCTGCGGC CATAACCTGC TGCCATCCAT CATTCTGCAG 1680
GGAGGGCCAG ATCTCTTTGC TCCCTGGACC CCCTCCCTTT TGCTTTCTAT TGAATTCTCT 1740
GTTCGGGCTG CACTGTCAAA GGCTCTTTTG AGCCTCTGAT GGCTGGGAGC TAGGCTGTTT 1800
TCCCAGTCCC TGGGCCCAGT CAGGCAAAGA CCTCGTTGTG AAGCAAGCAA GCAGAGAGCC 1860
ATGGAGAAGA GATTTTAGCC ATGTCTGACA GGGCCTCTGC TGTGGTACAG TGGGCTAGAA 1920
CCAGGATCCT GAAGGATCCA CTGGGATCAA TGGAAACCCG TGGAGGGCAG GTCCACTTCC 1980
TTGTAACTTG CTAAGCGCCT CCTTCAGAGT CATTTTTCTA ACTAGAACCG GCTTATGTGC 2040
CCTCAATAAA CCTTTTGTGG GACCAGAAGT CTGTAGGATC ACTATGGCTC TAAATCACAG 2100
CCATGAGACA ATGTGAGGGG AAACAGCTCT CTGTCCCTGG AATAGTAATA TGCTTTCTTT 2160
CTCCTTCAGT CCCCATACTA GACTGGATGA TCCAGACGTC ACATGCAAAT CTGAGATTTT 2220
AAGGATCCTC TCATTCCCAT GACACTGCCC CAGGTAAGCA ACTCGACCCA AGGAACACTG 2280
AGGCCATCTC ATGATTCTGT CGTCCCCTCT GCCAGTCGGC TTCTCCCAGC TCTCTGCCTG 2340
TACCTCCTGT TCCAGGCTTA GGATGAGAAT GAGAGTTCAC TTATGATTAT TAAATACAAT 2400
ATAAGGAAAC AAAGCAGTTG CTTAAAAATT TATTTTCAAG GGCTGGAGTG AGCTCAGCAG 2460
TTAGAGCACT GGCTGCTCTT CTAGACAACC TGGGCTTGAT TTCTAGCATC CGCATGGCCA 2520
CTCACAACTG TCTGTATCTT CAGTTCCAGA GGATCCAATG CCCTTCTTTG GCCCCTATAG 2580
GTATTTGGTC CACAAGCATA ATGCAGGCAA AATACCCATA CACATAAAAC AAAAATAAAT 2640
TAAAAAACAA TCAATTCCGG GCAGTGGTGG CACACACCTT TAATCCCAGT ACTTGGGAGG 2700
CAGAGGCAGG CAGATTTCTG AGTTTGAGGC CAGCCTGGTC TACAAAGTGA GTTCCAGGAC 2760
AGCCAGGGCT ACACAGAGAA ACCCTGTCTC AAAAAACAAA CAAACAAAAA CCCAAAAACC 2820
AAAACAACAA CAACAACAAC AACAAAAAAT CAATTCCATA GTCCAGGCAT TGAGGCACAT 2880
ACCTTTAATC CCAGCACTTT GCAGATAGAG GCCTGGTCTA CATAGCTGGA GATATCTAGA 2940
TCTACACAGT GAGATCCTGT CTCAATAAAA TTTTCCCCTA GGGGCTGGTG TGCCTCACAC 3000
CTTTGTACAT GTTGGACAAG CACTGTACCT ACTAAGCCAT ATTCTCAGCC TTCCTACACA 3060
GGAACCTTAG AAGGAGGGTT TGGTTGCAGT TACAAGCTAT AAGAGGATGT CCTGGGCTGG 3120
GGATGTAGCT CAGTGTGTGT TAGACCCAGA GTTAGATCCC CAGCTCATCC CCCAGGCCCC 3180
TCTTTAGAAA AAACGATGCC TTTTAAAGAT GAGCTGGAGA GTGAAATGTC TGGAGTAGTT 3240
CTGGCTGAAG CCCACACTTT GTCCTGAGGA GGATTTGGAG GCGGCATTTG GGCTCTTTGG 3300
CTGGGGATCC TGGGGATGAA TAAAGGACAG ACTCCCGGGT GCTGCTCAGA GATAAGGGCT 3360
CAGGAAGTGT GGGAGTCTGG CAAGCTCTGC TGTCCTGTTG GGGCCTCTCC TACTTCGATG 3420
TATTGCTCAG GATCCTAGCC CTGGCTTCAT CCTCATGAAA GGAGTTAATA AAGTGGGAAG 3480
AAACTTGGCT CTCCCCAAGA ACTCCTGGCA GTTTAGCAAA TGCCATTGTC TGTGCTCTCT 3540
GCCCAGTGCC CTGGATTTGA GGCTGCTTTG TCTCCAGCCT GAATCAGTTC CTTTTTGGCC 3600
AGTCTTTTCC CAGCTGCAGC TCTCGGCACA GAGCCACCCC TCCCCCACAG TACTGGACTG 3660
TGAGCACACG AGTGGCCTGG AAGAGTGGTG GGTGCTGTTG GAAACAGCCC TCCTTCCAGG 3720
ACAGACAAGG CTGAGCACTC GAGCCCTGTA AATGGAAGCC AGGAAACTGG AAAGCGAGGA 3780
GCAGAGACTG AGGAAAAGTA GGCAGGAGAA GGCAGAGGAG GGGACTTTCC CTTCTGTCGT 3840
CTCCACTGTC CCTTCCTGTT ATGTCCTTTT TACCTTTTGA GCTAGGATGT CAAGTATTTT 3900
AGGCTGTTCT TGAACTTGTA GGGAAGGCTG ACTTTGAATC TCTGAATCTC TTGCTTCTAC 3960
CTCCTAAGTA CTGGGGTTGT AGGTACCACC CTCCACTTTC ATTTCATGTG GGACCAGGGA 4020
TCTGTCCTAA GGTTCTGTAC CTCATAGGCA AGCACTCTAC CAACTCAGCC ACATCCACAG 4080
CCCTTGTGTG AGTGTGTGTG CGTGTGTGTT TCTGAGACAG TTTCCTGCAG CCTCGGTTGA 4140
CATTCAGCTT CCGAGAGCTG AGGATGACCT TGAACTCCTA AGCCTCCTCA TCTCACCGAC 4200
CAAGAGCTGG GATTTCAAGC CTCTGCCATG ATGCCCAGTT CTCAAAGTCA GAATTGGCTA 4260
GTACAGGATT CCAGTACTCA GTCAGCAAAA GCAGGAGGAT TATTGTAAAC TCAAAGGCAG 4320
CCTAGGCAGA GTTGAGTCTC TAGCTGCATA TGTAGCAGAA GATGGCCTAG TCGGCAATCA 4380
ATGGGAGGAG AGGCCCTTGG TCTTGCGAAG ATCATATGCC CCAGTACAGG GGAATGCCAG 4440
GGCCAGGAAG CGGGAGTGGG TGGGTTGGGG AGCAGGGCGG GGGTGGGGGG AGGGTATAAG 4500
GGGCTTTGGG GATAGCATTT GAAATATAAA TGAAGAAAAT ATCTTAAAAA AAAAAAAAGG 4560
CAGCCTAGGC TATATAGTAA GTTCTAGGCC AGCCCAGTCT ATGTATTAAG CTCCAGGCCA 4620
TTGAGAATTA CATAGTAAGA CCCCATGTGT CACGAAATAA AACAATAAAA GTAAGTGCTG 4680
GAAATGTAGC TCAATTGATA GCGTGCATGC TTGCACGTAC ATGTGAGTCC TGGGTCTAAC 4740
TCTCGCACTG CAGGCACTGT GTGCTAGTGC ACACCTAAAC CCCATGGGAT TTAGCGCATG 4800
GGATGCAGGG AGGACAACAA GGAGTTCAAG GTCATCTTCA GTTCCACCAG 4850