EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM028-19833 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr3:60302730-60305100 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr3:60304879-60304890CTTTCCCGCCC-6.32
HNF1AMA0046.2chr3:60304167-60304182TTTTAATAATTAACA+6.05
HNF1BMA0153.2chr3:60304168-60304181TTTAATAATTAAC-6.14
Lhx3MA0135.1chr3:60304197-60304210AGTTAATTAATTA-6.64
Lhx3MA0135.1chr3:60304204-60304217TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr3:60304200-60304213TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:60304201-60304214AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:60304202-60304212ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:60302868-60302888ACCAAAAACAACCCCCTCCC+6.22
RREB1MA0073.1chr3:60302887-60302907CCCCAAAAAACCCAAAACCA+6.54
TEAD1MA0090.2chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
TEAD4MA0809.1chr3:60304019-60304029CACATTCCAT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02212chr3:60275845-60315730Macrophage
mSE_06725chr3:60302694-60304136Heart
mSE_06725chr3:60304246-60308185Heart
mSE_07877chr3:60302536-60304206Intestine
mSE_07877chr3:60304291-60306932Intestine
Enhancer Sequence
TTTTGTTTCT AGCAGTTAGT CACCCTGCAG TGTTAGAGTT GATAGTTTCC CCTCTTGTAC 60
TACACGGAGG TTCAAAGTTC TGTTTTTTAC TGCGTTCAAT TGCAAAGGGC AAATTTTCTA 120
GCAAATGGGG GGAAAAAAAC CAAAAACAAC CCCCTCCCCC CAAAAAACCC AAAACCAAAA 180
AACCCAACAA GTCTCTAACT CTGAGTGGGT CTGAGTGCAA CTGTAAATTA ATCCTTCAAA 240
CAGGATTAGG TCTAGGCAGT AGGCAAGGAA GCTAGCTCAC ACAGCAGCAG GTGCAAAGGT 300
AGCCTATGCT TTCAGGAAGC CAGAGCTCTT TGATAGAAAA TGGAAAGCAA CTGAAAACAA 360
GGAAAGGCTA GAAACAATCC TGTAGGCTAA GCTAGCCTTG GGAGTTTCCC AAGGCCCATC 420
CCTTCCTCCA TCCCTGCATG AGTCAGTTTT CCAGTGGGTC TACACCCATT TACCCTTCCT 480
TTGCCAACAT CCCTGAATAC ATTCTCAGTA ACCCTCTAAG CATTTGCCAA AGATCTTTCT 540
AGAGTGCAAG TCCAGACTCC ACCCTATCGC CCTGGTCCTG CGAACTAGTT CATAGTTTGC 600
TGAATAACGT TGAAGTTCCT GGCTTCCTTC TCTGCCGACA AGTTAATCTC CTTTTAAAGA 660
AAGGAAACAG ATGACTGTAT TGATTCTACA GGGCATTGAA ACAGATAGGC TTCTTGCACG 720
TGCTCTGCAC TTTGCTCCAC CGTCCCAGGG CCCACTTGTG CCACACTCCC TGTGCCTATG 780
ATTGTGTGCA CGTGGAAGCC AGGGGTCCAC ATTAGGTGTC TTCTGAAATT TACCTTCCAT 840
CTTATTACTT ACTTTTTTGA GTGTCTCTCA TTGAGTCTGG AATTCAGAGT TAACTGGCTA 900
ATGGGCTGTG AATATCTCCC ATTCTCTACC TGATCCCAGC ACTGTGGTTA CAGACACTTG 960
CCTAGATGTT CGGAATTTGA ACTCAGGTTC TCAGACCTGA GCTCCAGCTT CTTTACGCAG 1020
GAGTCATCTC CCTAGCCAGC TAGCCTATCC AGGCAACTCT CTTTTTATCT TAGCAACTTC 1080
TGCACATCCT TCAAGGCGCT GCTTGCATAA GTTCCTCCAG GGAGCCTTCC CTCCTTTTCT 1140
CAAGGGCATT TTGGATATTT GCCTACCATC TTAGCACCAG CTGGCTGGTG CTCTTTTCTA 1200
CCATGCTGCT CCAAAAAGTA CAATCCGTGT ACTCCATCCT CCTGCACTTA CCTCCATCCT 1260
ACCTATACTT AACTACTTCT GCCATAGCTC ACATTCCATC CAGTTGCTGG AATGAATGCT 1320
GAGAAAGTCC TCAGGCGCTG GTGGTTACTA ATTGTCAGTT AGAAACTCCC TGTCTCTGTT 1380
CTCTGAGAAA ATGCTACTGT CATTCTACTT TGTTTCCATT GTTGGGGACT TGGGAACTTT 1440
TAATAATTAA CACTGAGAAG TGGTACTAGT TAATTAATTA ATTATTTCAG GAAGGGATCA 1500
GTAAGCAGCA AGTCCGTGTT TCATGGACCA GCAGAGGATC AAGATCTGTT ACTAGTACCT 1560
CTGCAAACTA GTGGAGTACT TTATTTATTT ATTTATTTAT TTACTCCGCC TAGGAGAGTG 1620
TGCCTGACCC ACTCAACAGA AACAGGGAGG GAGAAATCCA GTTTGCATTC ACTCACCTCA 1680
ACTCATGTTC AAACCATGAA ACAAACGTTT TTATAGTTAA AAATCATCCC TGACGAAGTT 1740
ATCAGAATTC CTTGAAATTC ACTGGAAATC CCGTCCGCAG ATCTTCAAAC TTTATCTCTT 1800
CTCAGAAGCC CAGAATTCTT TTCTTTCAAA GCCAAGTTAC AGGACAGCAG CTAATGAACT 1860
AGGAGCTGGT GTTTCATTTG CTCAGGCGGG CAGTTGCCCA GGGCTTGTTT GCGTGGGAGT 1920
ACCTCTGCAG CGCCTAAGAT GTTATTTTAT TTTAAAAGAG GGAGCCCTGC TTGCTTTCTG 1980
TACACCACAC TGCAGAGTTG GAAGTAAGGG AGCCTTTAAA CTGCAAGTTT TATTTGCCGA 2040
TAGGACAGGA AGGTGGCCTG GGTTTGTGTT TGGGTGACGA TCAGTTTTCT CGCAGAACTC 2100
CAAAACTGTG AGTGCTGAGA AAGATACCCA CCAACACCCG TGCAAGCTTC TTTCCCGCCC 2160
TTCGCCTTCC AGGTTCCAGG CGATGCGCTG CTTCTGCTGC TGCAGGCCGG GCAGCTAACT 2220
CTAACCTTCC GTCTAACCTT GCGGGCCTCG CGGGCTGGGC GCGGAGCCCC GGGAGCTGGA 2280
GCGGCGGTGA GCGGCGCGGG CCCGGGCGAG CGAGCGGGCG GGCGGGCGGG GGCCGGGGCT 2340
GCGCGTGGGA GCTCTGCGCG TCCGCGCGCC 2370