EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM028-13036 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Cerebellum 
Coordinate
chr17:24626000-24628660 
Target genes
Number: 38             
NameEnsembl ID
Pdpk1ENSMUSG00000024122
Atp6v0cENSMUSG00000024121
Abca3ENSMUSG00000024130
U6ENSMUSG00000064998
D330041H03RikENSMUSG00000073437
Rnps1ENSMUSG00000034681
Eci1ENSMUSG00000024132
Dnase1l2ENSMUSG00000024136
E4f1ENSMUSG00000024137
PgpENSMUSG00000043445
9930021D14RikENSMUSG00000045744
Mlst8ENSMUSG00000024142
Caskin1ENSMUSG00000033597
Traf7ENSMUSG00000052752
2610019E17RikENSMUSG00000093565
Rab26ENSMUSG00000079657
Pkd1ENSMUSG00000032855
Tsc2ENSMUSG00000002496
Nthl1ENSMUSG00000041429
Slc9a3r2ENSMUSG00000002504
Zfp598ENSMUSG00000041130
Syngr3ENSMUSG00000007021
GferENSMUSG00000040888
Noxo1ENSMUSG00000019320
Tbl3ENSMUSG00000040688
Rnf151ENSMUSG00000008482
Rps2ENSMUSG00000044533
Snora78ENSMUSG00000089255
Snhg9ENSMUSG00000090101
Snora64ENSMUSG00000077709
Ndufb10ENSMUSG00000040048
Sepx1ENSMUSG00000075705
Hs3st6ENSMUSG00000039628
HaghENSMUSG00000024158
Mrps34ENSMUSG00000038880
Nme3ENSMUSG00000073435
Mapk8ip3ENSMUSG00000024163
Tmem204ENSMUSG00000024168
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF5MA0599.1chr17:24626095-24626105GGGGCGGGGC-6.02
Nr5a2MA0505.1chr17:24627773-24627788GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
RFX1MA0509.2chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG+7.54
RFX1MA0509.2chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG-7.54
RFX2MA0600.2chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG+7.1
RFX2MA0600.2chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG-7.3
RFX3MA0798.1chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG+6.84
RFX3MA0798.1chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG-6.85
RFX4MA0799.1chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG+7.02
RFX4MA0799.1chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG-7.17
RFX5MA0510.2chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG+6.67
RFX5MA0510.2chr17:24627567-24627583AGTTGTCATGGCAACG-7
RREB1MA0073.1chr17:24628419-24628439AGGTCGGGGGTGGGGGGGGG-6.11
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr17:24627037-24627050TGCCTCCAGGGCA-6.07
Enhancer Sequence
GAAGGCCAGT GAGTGCGGGG GGCGCGCGGG GCGCGGGCGG GGCCCACCCC GCCGGGGTGC 60
AGGGCGAGGA AGGGATGCTG TGGGTCTCCC GGGGTGGGGC GGGGCCAGGA GCGCTCAGAC 120
CCTTGGTCCG CGCCCCCCTT CTCGCCCTAG CTCTGGAGGA GGGGCGGCAA CGAGCGCAGA 180
ACTGTCCGCC CAGCCCCCTG CGGGCACCTG CGGCACCCAC CGTCCCTGAG GCCGCTGGCG 240
ATCACATCCT CCCTCGGATC TCCTCCCTTT CCAGGCTGCA GGCTGATGAT TTCTACTTGT 300
GCTTTTAAGG GCGAGGCGGA TTCCCCCCAC CCCCCAAGAG ACATTGTAGA GAGAGGGAGG 360
GGCCCTTGCA GTGAGGGGCG ACCAGAGGCT AGCAATCTCT GTCAGACCCC TTCCCCACCC 420
TATGTTTAAT AACACGCTTT GCAGGGAAAG GGGTGGGGTG GGGGACCACG CTGGGGGTGT 480
GGCTGCCCAG GCATGGCCAG TGGGGGCCAT TTACTGATGA GGGAGTGAAA CACAGGCGCC 540
CAAGGTCGCC CAGCCCTGGG GCAGGCTGGG CTTCAGACAG GGACAGCCTG GGGGATAAGG 600
ACTGTAGGCT CTTGCAGGCT TCTGCAGACC TTGGTCGTCC CTGGCTTTTT CTGCTGGAAA 660
AGGGGGCCAA GGATCTGTAA TGGATCTCCC ACACCATTCC TAGCTTGTGC CCTGGGGGTC 720
CAGGGAAGGC CTCGGAGCTT GGAGCTTTGA TTCTGGCTCT CAACCCTGCT CATCCTAGAG 780
CCTCCCTAGG GGCCTCTGGA GATGGATTGA TGGGCGTGTG GACTAGCCAA GTGCGCAGCT 840
GTGTATGTAT GACCGTGTCA GTGTGTCAGG GCACCTGTGC AGGCACTGCA GGTCAACACA 900
TGGGACCTGG GTGCTTTCAC TTCCAACCCA CCATCGTAAG CTGCGGGGAG GGGGCCCCAT 960
TTCTCCAGGG GGCTGCTGAG ACACGGGACC GTCTGGAGTG GCTCCTGTCC ACTTTGCTTT 1020
TGGAGGAAGG ACACTGGTGC CTCCAGGGCA CACAGGCAGC CTGGGAAGCT CCACTTACTA 1080
GAGCTGGCTT TAGGGCCTCA AGGCTGAGAG TGGAAGAGCT TCATAGGGAG AGGCAGGTTG 1140
AAGAGAGGAA GGCACAGCTT TCCACCTAGT GGCCTGTGTC CTTGGTCATC CTGACTCTCT 1200
AGGCCTTAAT GGCCTTATCT GTAGGATGGA ACATCTGTGG TCCCTGCCAC CCCACAGCAT 1260
CCTGAGAGCA CTAAGAAGGG ACTGATGAAG AGGAGACACT TACTTCCAGT TCAGGAAATG 1320
CTAATGGAGC TGGCTTTTTT CTGCTGGCAG CCAGTGGGAA CCACAAATAT GGGGATCCTC 1380
TTCCCTTCCA TTTGGCCATC ATGGATAGGA GAGAGGGTTG TCATCTCTGC CTGGGTCCCT 1440
ACCTCTGCCT TGGAGTGATG TGGACTCAGC AGAGGCACCT GTCGGTCTTG CCCCTTCTGT 1500
CTGTAGTCTC TGAGTCAGAG GGGCGGTGTA ATAAATCAGA CAGAGAAATC CCTCCATGAA 1560
TTAGCTCAGT TGTCATGGCA ACGCTGGCCT GCTTTGGAGT AAGAAGTATT TTGATTTAGC 1620
AAAGTACAGC TGGAGTTTGG GCCATGGGGT GAGGGGTGTC CATAAGTATC CTGAGAGTGT 1680
GGTTTCCCCC TCACATACAC ACACCAGCCA GGCGTAATGA TACACTTAGG CTTAATCCTA 1740
GCAGTTGTGA GGCAGAGACA GGCAGATCTC TGTGAGTTCA AGGCCAGCTA GGTCTAATGC 1800
ATAGTGAGCT ATAGAGACCC TGTCTCAAAA ACAAAACAGA AAAGAGGATG TGGTCTCCAG 1860
TCCAGCCTAG AGATTTTCCC ACAGTTGTTC TTGAGCCCTT TTGGGTGCCC AGCTCTTCCC 1920
TCCCTACCCT GTGGCTCCAA GGGAGCCTGC GCATGCATGC TCACTTAGCG GTTGTCCTGG 1980
AGGGGAAAAG AGACAACTTT GGAAGGAAGA TGTTGGTAGG GGGCTGCTCT TCTGCTGCTG 2040
GTGAGGGGTC CTTGTCTAGT TTTGTGGCCT AGCCTTCCTC TCTGAGGCAG GCTGATGACA 2100
CCCTGTAGAA ATTCCCAGAA GAATCATGTG CGCGCGCGCA CACACACACA CACACACACA 2160
CACACACACA CACACACACT CACTCCTTGG CCCATTAAGA ATTCCCTTCC AGCAGGCTGT 2220
GTGGCACACA CCTTTAATCC TAGCACTTTG GAGGCAGAGT CAGGAGAATT TCTGTGAGTT 2280
CTAGGCTACC CTGGTCTACA TATTGAGTTC CAGGCTAGCC AGAACAACAT AGTGAGATCT 2340
GTGTATTTGT TTGTTTTTAA ATTCCCTTCT AACTTAGAGT TTAGATCTGA CCTCAAACTG 2400
GTCTCTGGAG AGCAGCTTGA GGTCGGGGGT GGGGGGGGGT CACAAGAAAC AGGGGTGAGG 2460
GTTGTAGGCT ATTTGTGTAG GTTTGTGGTG CTGGGGATGA AATCCAGGGC TTCACGAATG 2520
TTAAGTAAGC TCTCTGCCAT GAAGCTGCAT ACCATGCCTG TGTCCTGTAT TGATGCAAAC 2580
ACCTACTAAA AAGTGAAAGG AGCTGGGCAG TGATGGTGCA TGCCTGTAAT CTCAGCACTT 2640
GGGAGGCAGA GGCCAGCCTG 2660