EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM027-12102 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CD8+ 
Coordinate
chr3:115501650-115504970 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr3:115504063-115504075ACAATGTAAACA-6.04
Foxd3MA0041.1chr3:115503211-115503223AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:115503215-115503227AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:115503219-115503231AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:115503223-115503235AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr3:115503227-115503239AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr3:115503240-115503261AAAACAAAACAGAAAGGAAAG-6.3
POU2F1MA0785.1chr3:115504692-115504704AATTTGCATAAA-6.11
Pou2f3MA0627.1chr3:115504689-115504705GTGAATTTGCATAAAC-6.4
RARA(var.2)MA0730.1chr3:115503050-115503067GGGTCATTCGAAGTTCA+6.29
RELMA0101.1chr3:115504182-115504192GGGGATTTCC+6.02
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_12491chr3:115501720-115502930Spleen
mSE_12491chr3:115502970-115505104Spleen
Enhancer Sequence
CCAAATTACC CATGACTTCC ACTTTCTGGT AACTGACATT CCATTTCCAC TTATATAAGT 60
GGCATCATGC AATATTTGTT CTTTGTGTCT ACTTTACTTC ACTTAAAATA AAATCAGTTT 120
TGTAACTCCT GGGAGGGATA GGAAAAGTTC ACAGAGAAGT GGGATTATAA TTGGGAACTG 180
AGAGATGTAG GGGTACACCG TGCAGATCCA CAGTGGCATC CCACTCTGAC GTGAGAGAGC 240
CCAGTGATAG CAGCGAACTT AAAGATACAT TTCAGCAAGT CATAGAGGAT GCACCACCAG 300
GGAAGCTCAA CTGAAGAAGA ACCAGCTAGG GAAGATAATG CTACCCAAAC CCAGGAGTGA 360
AGAGCCAAGT GGGATGCTGA GAGAGCGCCA AACGCTCTGC TGGGCTAGAA TGAAAGGTGC 420
CCTGGAAACT GCTGAGGTGG TAAATATAGA ACAGATTGGG GTGAATACAG CCAATGGTCT 480
GTTTCTCCCA ACTATTTAGC AGAATTGCCT TGAAAATAAA ACATGCCTAT GGAGCTGCTC 540
TCCAGAAACC TACAGAAGAC CTCGAATATC CCTCCATGGT TTTCCTATGC TTGCCGGGTT 600
TCAGGAGGCA CACATGTATC TCAGCAGCGC CTGGGAACCG TTTAACTGCA GCCTGTGTTT 660
TAAGAAGGCG ACGGCTAGGT AGTATGTTGA GGTTACCAAG AGAAACTACT TGAGGTTTAG 720
AAGCAATGAA ATGAGGTTCT GGCTACTTCC TCCCACATGT TACCCAAGAG TGGGTAGTGA 780
TTAAACATCT TGTCACACCT ACTACCCATT CTGGTGAACT TGAACCAAAC CACCGGAGGC 840
TTTTAAGCAG AGCAATGAAG TTATCAGAGT GCCGTGGGAA GGGCAGTTCT GGCAGCCATG 900
CTGGGCAGGC GGCAACCGAT CAGGTAGCAG GTATCCAGAA GAATGCAGAG ATGAAGTTCT 960
GCCAGTGTTT TTTAGCCTTC TTAATGCCGC AACCCTTGAA TACAGTTCCT CATGTTGTGG 1020
TTACCCCACA ACCATAAAAT TGTTTTGTTG CTATTTCATA ACTGTAATTT TGCCTGTGTT 1080
ATGAACCATA TTGCAACTAT CTGGTATGTG ATACTTAGGA GGTGGCGACC CACAGACTGA 1140
GAACTGATTC TCTAAAGGCT TGTCATGTGG TGCTGGTGGA GGGGCTGGTG AAGAGGGAAT 1200
GCTAAAAATC TTCATAAAAA CAAAAAAATC TAGTACCAAT AAGATCTTGA AAAATGTCTG 1260
TACAGCAGGA ACTCTGGGGT AGCCACTGGC TTAGGGGCAG GGACTGGATA CTTATAGGAC 1320
CATCAGATAT GTTATGTAGA TTACTCCTTG CATAGCTTAT GGGAAGACTT AGCACACTAG 1380
TATATACAAA CTAACTGATA GGGTCATTCG AAGTTCAAAC ATATCCAGGA ACGGTGGTAG 1440
CAAGTACTAA GGTAATCTTA GCACTTGAGA AATAGAGGCA GGAAGATCAC AAGTCTAATG 1500
TCACTTTCAG CTCCATAATC ATTTAAAAGG TAGCCTGACC TGTATGAGAC CTTGTCTTAA 1560
AAAACAAACA AACAAACAAA CAAACAAACA AAAACAAAAC AGAAAGGAAA GAGGGTGGTG 1620
GCACACACAC ACAGAGACAG ACAGACAGAC AAAGACAGAG ACAGACAGGC AGAGACAGAG 1680
AGACAGAGAC AGCGAGAGAC CCAGAGACAG TTAGAGAGAG AAACAGAGAG AAGCACACAG 1740
AGAACCACAA AGAGAGAAAA AGACAGACAG ACACCATCGG GGGTGGTGGG AGAGAGCACA 1800
GAAACACACA CAGAGAAACA GACAGACAGA AAGACATAAC AGACAGACAG ACAGGCAGGC 1860
AGGCAGGCAG ACACAGACAC ACTACATACA CAAACAGGCA CACATGCGCA CACACTAAGA 1920
CACAAACAGA CACACCACAC ACATACACAG ACACATACAC AGAGAGGCAG ACAGACCAAC 1980
AGACAGACAG AAGACAGACA GAAAGACAGA GACAGAGGAG GGGGGAAACG GAGAAAGGCA 2040
GAGAGATATG AGTCTTCCTT ATAAGAACAC TTAGATGCTG CAAACTTTAA CCCAGTGAAA 2100
AGTAACGTGA GGAGTAATAA TTATTTAGAA TGCTACAGTT TCACTAAAAA GACAAACCCA 2160
AAAGTCAGTT GTTTTCCTTT TAGGCGTTTA ATGTCTTCTG TAGTTTTAAA AACAACAGCT 2220
TATGAACATA GAAGTCTTAT TTTCCCCTGT TCATCATCAT ATTTTTGGTT TATCTGATCA 2280
TAAAAGGGTG TGGTTCTCCA TCCACAGCAA CCGCGAAGCA GCCTGAGAAA GAGCAGCCCC 2340
GGGTGGGAAA GCTCTTTTAA GCACACAGCA GTAGGTAGCA GTCAAGAAGA AGCTAGCCAG 2400
TGCTCTTACA CTGACAATGT AAACACTGAT AACTGAGCTC AAAGTGTCCT CACCAGCACT 2460
TCGCCTGCAT TTCTTATCCT GTCATTCATG AAGATGAGAC ATAGCCTTTC TTTTCTTGAA 2520
TAAAAGTTTT AAGGGGATTT CCTCCTTTAT TTCTCTTTGA TTTTCTAGAA GAGAGTTTCA 2580
AATATGTTTT TTGCCATAAA CGAGTACTTT GAATTTAAGT AGATTTTCCC CTTCTTCTGG 2640
AATCAAAATG CAGTCAGAGC TTCTTGCACT CTGCCAGTTG AGAATACAGA GAGCCTCCAA 2700
GTCATGGGCC ACAGGAGGGG AGGTGACCAC TGTGGCCTGT GGCCTAGCAC TTGACTGTTA 2760
CCTGTTACAG CAACTGCTAT ACATTTTGCG TACAATTCAT TTCAGGACAA AAAAACAAAA 2820
CGAAAAAAAA AAACAACACA TAGGAAGGCA AATCTGATCA TGTCAGAAAA GAGAATGAAT 2880
TTGAGGTATT GCATACCTCA CAAGAGTAAA AAAAACAAGA CAGGAAAGTG AGTGGTTTCC 2940
TTAAGATTCC TATGCCACTC AGAGCAGGAA GGAAGCCCCA CCCTCAAAGG CGCAGAGGGA 3000
AACAGCACTA GATAGGTTCC CCTGCACAAA GAGAAAAAGG TGAATTTGCA TAAACATACA 3060
AAGCAGCTGA AAGCATAACT CAATGGCAGA GGGTTTGTCT AGATGCACAG AGCACTGGGT 3120
TCAAACTCCA GGATTGCAAC AAATGAACAA ACAGGCATCT TCATTGCCCG TACCATCTCC 3180
TCCTCTCATA AATGCTGTTC AGTGTCAGGG AAATGCGGCT GCCCTGTATG TAGGACAATC 3240
TACTGTAGCT CTCCACGTGT AGAAGGTACT AGGACTTTGT GCTTCCTCTG TTAAAGCAGG 3300
TGTGCAGGGC ACTTGTGAAC 3320