EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

MM024-03061

Organism

Mus musculus

Tissue/cell

CD4+Treg

Coordinate

chr13:101261530-101262410

Target genes

Number: 8
Name	Ensembl ID

Serf1	ENSMUSG00000021643
Smn1	ENSMUSG00000021645
Gm9858	ENSMUSG00000051723
Gtf2h2	ENSMUSG00000021639
Ocln	ENSMUSG00000021638
Taf9	ENSMUSG00000052293
Ccdc125	ENSMUSG00000048924
Cdk7	ENSMUSG00000069089

TF binding sites/motifs

Number: 13

JASPAR ID

Coordinate

Motif Sequence

Strand

-Log10(p-value)

Lhx3	MA0135.1	chr13:101261760-101261773	TAATTAATTAATT	+	6.78
Lhx3	MA0135.1	chr13:101261764-101261777	TAATTAATTAATT	+	6.78
Lhx3	MA0135.1	chr13:101261757-101261770	AATTAATTAATTA	-	6.78
Lhx3	MA0135.1	chr13:101261761-101261774	AATTAATTAATTA	-	6.78
Lhx3	MA0135.1	chr13:101261765-101261778	AATTAATTAATTA	-	6.78
Lhx3	MA0135.1	chr13:101261756-101261769	AAATTAATTAATT	+	6.92
Nr5a2	MA0505.1	chr13:101261686-101261701	AAGTTCAAGGCCACC	+	7.55
POU6F1	MA0628.1	chr13:101261758-101261768	ATTAATTAAT	+	6.02
POU6F1	MA0628.1	chr13:101261762-101261772	ATTAATTAAT	+	6.02
POU6F1	MA0628.1	chr13:101261766-101261776	ATTAATTAAT	+	6.02
POU6F1	MA0628.1	chr13:101261758-101261768	ATTAATTAAT	-	6.02
POU6F1	MA0628.1	chr13:101261762-101261772	ATTAATTAAT	-	6.02
POU6F1	MA0628.1	chr13:101261766-101261776	ATTAATTAAT	-	6.02

Enhancer Sequence

GGGGTTTTCG GAGGGGAAAC CAGGAAAGGG GATAACATTG GAACTGTAAA TAAAAAAAAA 60
ATAATAATTT TAAAAAATAA CAAAACTATG AGCCTGGCTG TGGTGGAGCA CACCTTTAGT 120
CCCAGCACTC GGAAGGCAGA AGCAGGCAGA TCTCTAAAGT TCAAGGCCAC CCTAGTCTAC 180
AAAGTGAGTT CCAGGACTGC CAACACTACA CAGAGAAACC ATCTCCAAAT TAATTAATTA 240
ATTAATTAAA AATAAATAAA ATTTCTGTTC AGGATGAGCA GAGTGGAATA CACCTGTGAT 300
CCCAGCACAC GTGTGTGCGT GTGCACACAC AGTTCGCATA ATATTACTTT TAAGCTTTTT 360
AAATGTTGCT CCACCGCATC AACATTTGCT TTATATTTTA CTCTTCTATT ACTCTCTTAA 420
ATTCAGAGAA AATGAGAAGC AACGAGTAAA CGCCGCACAC TTTTTGGCTG GGTATACGGG 480
GCCTCTTTAT GATGGAGAAT CCAACCGGGG AGAAGTTAGA AGTCCCCACG CCGCAGCCAG 540
ATCACCCGTT TCTTAGACTT TCCGTCATCA CACCCAGCCG CCCCGGGAGA TGCTCACGGT 600
GAGCTCCTCG CGTGCACCCG CGAGCCGCAG CGCGCATGGC CACTGCGGAG GCTCTGCCTC 660
GCCTTACCCT GCCTGGCCCG AGGTCAAGGG TGATTTACTG TCCCCCGTGT TCAGAGAGGG 720
ACAGCTCGGG GCTGCAAACT CGCTTCGGGC CACACAGACT CACGGCAAAC GGCAGCCCTG 780
CAGCGAGAAC TTTCCTCAGG CGGAAGCTGC CGCGCTCCCT GCACACGCCC CCACCCCCTC 840
CGCCCTCCAG GTCCCCCCCG AGGCCAACCC GGGCTTTGCA 880