EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM024-00460 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CD4+Treg 
Coordinate
chr1:138034730-138038950 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr1:138035641-138035652AATGACCTTGA-6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:138034857-138034875GGCAGGAAGGAGGGCAGG+6.76
EsrraMA0592.2chr1:138035642-138035653ATGACCTTGAG-6.02
EsrrgMA0643.1chr1:138035642-138035652ATGACCTTGA-6.02
LEF1MA0768.1chr1:138035003-138035018TCCCCTTTGATCTTG-6.63
NR2C2MA0504.1chr1:138037953-138037968TGACCCCTGACCCCT-7.2
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr1:138037995-138038006CTTGAGTGGTT-6.32
Nr5a2MA0505.1chr1:138035641-138035656AATGACCTTGAGCTT-6.53
RXRBMA0855.1chr1:138037953-138037967TGACCCCTGACCCC-6.04
RXRGMA0856.1chr1:138037953-138037967TGACCCCTGACCCC-6.1
Sox6MA0515.1chr1:138037335-138037345CCATTGTTTT+6.02
Tcf7MA0769.1chr1:138035006-138035018CCTTTGATCTTG-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036000-138036021CCTTCCTTTGGTCCCTCCTCC-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036013-138036034CCTCCTCCCTCCCTCTCCCTC-6.43
ZNF263MA0528.1chr1:138036045-138036066TTCTCTTGCCCCTCCTCCACT-6.4
ZNF263MA0528.1chr1:138035988-138036009CCCTCCCTCTCTCCTTCCTTT-6.72
ZNF263MA0528.1chr1:138035984-138036005TCTCCCCTCCCTCTCTCCTTC-7.16
ZNF263MA0528.1chr1:138036042-138036063CCCTTCTCTTGCCCCTCCTCC-7.73
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02721chr1:138030318-138061695HFSCs
mSE_03461chr1:138034684-138035542Bone_Marrow
mSE_03461chr1:138036579-138037416Bone_Marrow
mSE_04183chr1:138034617-138037628Cortex
mSE_04183chr1:138037696-138040917Cortex
mSE_07308chr1:138029879-138035516Intestine
mSE_07308chr1:138036408-138037452Intestine
mSE_10895chr1:138034628-138037668Olfactory_bulb
mSE_10895chr1:138037696-138041026Olfactory_bulb
mSE_12032chr1:138027259-138035645Spleen
mSE_12032chr1:138036436-138037602Spleen
mSE_12949chr1:138027947-138035722Thymus
mSE_12949chr1:138036419-138037578Thymus
Enhancer Sequence
TGGGATTTCA GTAAAATGGG GCATGCATCC CTCACCCCAT AGTGTTGTGA TAACCCAAGA 60
GTGCATGTGG CACCCAGGTT CTCAGATGCT CTGTTATGTC GTCAGATGAA GCTAGGGAGT 120
GAGAGGAGGC AGGAAGGAGG GCAGGCCTGC TACTGCTACC CCCAAGGAAT GATTTCCTCC 180
GCTCTCAGGC TTGCCCTTCC AGGATCCAAC AATCTTTACA GGCAGGAAGT TCTTTTTGCT 240
AGCTTATCTA AATCCCTGTG GCTGTGGCTA AGTTCCCCTT TGATCTTGCC CAGTCTCTGC 300
TGAGGAAGAG CGGTGTCCTT GGCAGGTCAC ATAGCTTAGC GAAGTGACTG TATGAAAGGC 360
AGTCTGGAGA CCACGAGGGT CCTCTGGGTC CCTTCTGTGT CTCTTGCATC CGTGAGCCAA 420
ACACGCACCA CGAAGAAGAC AGCAGCTGGC CTTTCCCTCT GCCCCACCAC CTGTGGTTGG 480
AGCTAGGCAT GGGGATTCAG GCTGGGCACG AGGAGGAGCC AGCGGGTCTA AGCTGCCTTT 540
GGTTTCTATC AAGCTTGGAT ACAGTACAGC CAGATGCTGG GTGATAGGAG TCCTTTATGG 600
TCCCTCTGGA GCTCTCCCAC CAGCCCCCAA GGGCTCATTC TCAACATCCC AAGGGACTCC 660
TTACAACAAG ACAGACATGC TTTTAGCCCC ATGAAACTCC TTCCGAAGTG TCTATGTTGA 720
TTATTGTGGC CATCTGAGGG GTAACTCTAG ATCAGGCCTC TGGTTCCTGA AAGCCTGGGG 780
GTAGAACTGG GGAGAGAGTG TCTCTCGGTC TAGAATCCCT CTAGTGCAAA TCTTACACCA 840
GCTAGTGTTT GTGTGCATGC TAATTTTGTG CAAATCTCAG GAAAAGGCAG CCTCTGGTTC 900
CTTATCAGTC AAATGACCTT GAGCTTGGGA CAGGATAGAG ACAAATTGCT CCTCACTGGC 960
TATGTGATAT ACTATACTGT GGTGGCCCAC CGTGGGCAAA GTGATGGATG GTATCTATCA 1020
AGAAGTTGTC TCACCCCTAA GTACTGATGT CTACTGTACT GGGTGAAATG AGTTCCAGGT 1080
AAAGCCTCAG GTGCATATTT TACATATCAA AGCAGACCTG GCCTCCAAGT TCTCCCAGCA 1140
TCCCTCAGTC CCTACCTGGC ACACCCTTCC CCCAACCCTG GTCTTTCCAG ACCCTTCCCT 1200
CAGGAGGCTC TTTCTTATAT AATCCAGACA TTTTGCGCAC ATGCTCTCTC CCTATCTCCC 1260
CTCCCTCTCT CCTTCCTTTG GTCCCTCCTC CCTCCCTCTC CCTCTCTCCT TTCCCTTCTC 1320
TTGCCCCTCC TCCACTTCCC ATGGTGACTT CCCTCCCTGG CCTTGGTCCT TGGGGCCAGT 1380
GAACTCATCT GAGAGTAGCT TCCAAATAAA CCTGCCTTTA TTATATTCTA ATCCGGCTTG 1440
AACGGTCTCA TTTCACTGGC AGAGAAATAA CCTATCACTA AGGACCAGAG AGATGGCTCA 1500
GCCTGTAAAA GTACTTGATG CTAAATCTGA TAACATAAAT TAAATTCCCA GGACCCAAAT 1560
AGTGGAAGAA GTAGATTCCA GTGGTTGTCC TCTGGCCTCC ACATGTGCAT CCTGCCATAC 1620
ACACACCTTC ACAGGTTTAT TACATGCATG CATCCATACA CACATACAAA CATAAAATGC 1680
TTTGAAAAAA AAGTTTCTGG CTCTGGAACA GCTCTTGGTT ATTTTAATGT CACCGCCTGT 1740
TACTTTTCAT TAGCAGAAAG TCTTTAAGTG TAAAAAGCTG CAGCCTTGGA GGTCTTGAGT 1800
GAGGAATAGG GGAGAGTCCG TTAGGAACTC TGGGAGATAC CTAGCCGCTA GCTAAGTAGG 1860
TAAGACTAGT TTTACCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAACCAC AGCCAACCCC CTAGGAGCCC 1920
AAAGTCACTG GGCGGAGCTT CTGGGAGGGG TGATTGGCTG CCTTTGTGTG ATGTCACTTG 1980
AGGCCCTAAG GTGAAGCTCC GCCTAAACTT TGGTGGCGAC TGTTGGGTCT CTGGCACGTA 2040
CCATGGCTCA CCTAGCCATT ATGCTCTGCA GAAAGCGAGT TTTGCCCTTG GCAGTCTCTC 2100
AGCAGCCCCT GGCCTGCCTC CTCGCTGTGT CCTCTGCCCT TCACTTTGCT ACGGCTCAGT 2160
CCGGCTCCTG ATGAGCCAAA GAACCGCTGA GCTCAGCTCT TCCCGTGGCC CTAGGCTCCG 2220
GCTGGCTGCC TTTGTGCCCG CCTCGCCCGC CTTTAAGTCT CTCGGCTGTG GCTCATCGCT 2280
GCGGGGGTGG AGGCGGCCGC CCACATCACG CCAGCCACTG TTCGCTTGTG AGCGGAGGAA 2340
GCGTGGTGAC CTCAGCCACG GTGCCAGATC CTGCCTCTGA AAAGCCTTGG CTGCGCCACC 2400
CTGCCTGCCG TTTGCCAAAT GGCGAATAGT CCGGCTCTGT TCAGCGAGAT TCCGGGGGTG 2460
GGGGGTAGGG GCTTTCGGAG AGAGGCCCTA GGTCCTCCCA ACAGGGTGGA GAGAAAGGAT 2520
AGAGGGTCTT CAGTGAGAGT CACAGTTAGG CTACCAGCCT TCATTGATAA TAGGCAACAG 2580
GCTTGCCGGC CATAGTGTGC CAATTCCATT GTTTTAAATG TTGCATCTTT CCGCTTGCAG 2640
ATTTTCTATT TTAGGGTATA TTCTAATCAT TCAGTGATGG GTTTCAATAT GCCTGTCTCA 2700
TGTACTTTGA TCTTACACCC ACCACCCTTT TATGTTCCTG TTTCCTCCTG ACTTCTGGTC 2760
TCCCCTTCCC TCAAGTCTTA TTTTTAAGTT TAAATTCTAC ATATGAGAGA AAACGTGATT 2820
AGGGTTTCCT GGGTCCAACT TAGCAACCTC TTGGATCATT AGTCCATTTC CTGCAAATAA 2880
CACAATTCAC TCTTGGCAAT GGCAAAATAG TATTCTATTG TGTTATACAT ACTTTTTTTT 2940
AAGCTATTGA TCTACTGATG ATCACATGGG CTAATATCCA TAACCTTGCT AATTTGAAAA 3000
AAAAAAATCT GTAGAGAACA TGGGTGTGCA GGTGTCTCCG TGGTCTGCTA CATTTGATTC 3060
CCTCTGGGAT ATACCTAGGA GTGGCATATC CAGTTCCTGA GATAGTCTTT CTTGCCTTCT 3120
CAGGTTCTGT GCTTAAGGTG CACGCCCCTA CTTGCCTCTT CCTAGTCCTG GTATAGTTGG 3180
TAGCTCTCAG GGGCCCATGG TACAAATGGA AGAACCTGGC AACTGACCCC TGACCCCTCC 3240
TTCCATGCCA TTGGGAAGGA CACTGCTTGA GTGGTTGCCA TCTGTGCCCG TCCCGCTATA 3300
AAGAGAAACT TCTCCCTTCT GTAGGTCACT GCCATTTTGA GGACAACCCA CAGAAGTGAC 3360
CTCATCCAGA GTGGGACCAG TGGAAGAGGC TGCTGGAGGG GAGGGCGGTA CAATTCTTAA 3420
AAAGCTAAGA CCACGTAGAT CTATATAACC CAAGTGCAGG CTGAGGCTTG GGCCGTGAGA 3480
GACAGGACAG AATCTCCAAA TCTCCACCAG GCACCAGAGA TGAGCTCAGC TGTCACATGA 3540
CACTGTGTCC TCCAGGGCAG GGCAGCCCAG TTCCCTGCTT GGTGCTGCCT GAATGGACAT 3600
GGGGCGTGCA AGCCCGCTCT GACAGGGGAG GAAGTCAGTA GCACTGTGGG CGTGGGGTCT 3660
TTAGAGGAAG CATCGAGGGA GTTGGGAGAG AGCTTCTAGT CTCAGCCTGA GGAGAGATTG 3720
GACCCCAGCC TTGTTTCTCA CTACCTGAGT GACTTAGGCT TGGTTCCTGC TGGGAAGTGG 3780
GGATTAACAT CCTAGCTCAT ACACCACCAA GGCAAAGTGA TGGTGGATGC TGGCTGGCCT 3840
ACTACCCACA CACATGGGAA TGTCTGTGAG ATCTTCCTTC TTTGCTCGCT CCCGCAGCCC 3900
CTCATCCACA AGGCTAACAC ACACTGTGCC TTGTCCAGAT CAGCTATTCT GAGAATTAGT 3960
CACATACCCA CTTCTCCTTA CAAATTGCAT CCCGCTGTTT TGAATAGACT AGCAAGAAGC 4020
TAGATGGCTC TCTGATGTAT CAGGATGTGT AGAACCGAAA ATATAATCCC AGGGAGACCC 4080
CACAGCCCTT GCTACCTAAA GCCCTGACTG ACCCTAGGTG TACCCTTCCA GACTGCTCTC 4140
CCTGACTCTC TTCTTTGCTG CCCCCTTGGA AGCTCTGGCG ACTGGCTACT GAAGACCTTG 4200
GGAGGGCTCT GATAACAGGC 4220