EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM023-10941 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CD4+CD8+ 
Coordinate
chr6:125178410-125180160 
Target genes
Number: 36             
NameEnsembl ID
Lpcat3ENSMUSG00000004270
Emg1ENSMUSG00000004268
Phb2ENSMUSG00000004264
Grcc10ENSMUSG00000072772
Usp5ENSMUSG00000038429
Cdca3ENSMUSG00000023505
Leprel2ENSMUSG00000023191
Cd4ENSMUSG00000023274
Lag3ENSMUSG00000030124
PtmsENSMUSG00000030122
Mlf2ENSMUSG00000030120
U6ENSMUSG00000065765
Cops7aENSMUSG00000030127
C530028O21RikENSMUSG00000030329
Zfp384ENSMUSG00000038346
Ing4ENSMUSG00000030330
AcrbpENSMUSG00000072770
Lpar5ENSMUSG00000067714
Chd4ENSMUSG00000063870
SCARNA11ENSMUSG00000088208
Nop2ENSMUSG00000038279
Iffo1ENSMUSG00000038271
GapdhENSMUSG00000057666
Scarna10ENSMUSG00000089617
Ncapd2ENSMUSG00000038252
Mrpl51ENSMUSG00000030335
Mir3098ENSMUSG00000093157
Vamp1ENSMUSG00000030337
TapbplENSMUSG00000038213
Cd27ENSMUSG00000030336
Tuba3aENSMUSG00000067702
LtbrENSMUSG00000030339
Scnn1aENSMUSG00000030340
Tnfrsf1aENSMUSG00000030341
Plekhg6ENSMUSG00000038167
VwfENSMUSG00000001930
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr6:125179907-125179928AAAAAAAAACCAAAACCAAAA-6
KLF4MA0039.3chr6:125179094-125179105GGAGGGTGTGG-6.32
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01502chr6:125165271-125222080Th_Cells
Enhancer Sequence
GGAACTCCAC TGTAGAGAGA AAGAAAGGGT GACTTACAGA CTGTTTCTTC CTTAAGGTCA 60
CCTGGCCTCT GAGCCATGGA CAGACAGCTC CGGCTCCCTT CCCTGGACAG TGGTACTGAG 120
TTCATTTCCT GTCCAGTGGA GCCATAAATT AATGGTGCAG CAAGGCACAC ATGAGAGCCT 180
AAACCCACAA TCTTCGTGGT TCAGTCCCTC CAAGTGCAAG GACTGCAGAT GTGGACAGTA 240
CGTCCAGCTT CAATAGTCAC GTCTTTCCAT GAATGAAATA CTGTTAAGTC CTGTGTGCAC 300
TGGACCCTTG TTACTGTGAG TAGAGCACTC CCCAGCCTTG ATAGGCTTTT GGGATCCTTG 360
GTTATTGTGA AGCAGAGTGG CCTTGACTTT CAGCTATCAG CCCTAACTGC ACATGGGAGC 420
ATTTGGGGGT GAAGTGTTGT GGTCCCTACA GCCTAGTCAG TCCAGGGGAG GATATCTATG 480
TTAGTCGGGT AGAGAGGAAC TATGACAGCT GACGAAATAG GTCAGAAATA AGTCACGGCT 540
GGGTGGGGGT ATGTTGTTTC ATTTATTTGT AGATCTGAAT AAGTTCAAAA AGGGAGAAGC 600
ACTAAACTAC CCATGGCCAA GGATAGGAGA TGCTGAACAT CTTTTCTGAT GTGGCAAGGC 660
ACATTCAGAA AGGACTGTAG AGCCGGAGGG TGTGGTAGTA TATGCCTGTA CCATCAGCTA 720
CTAAGGAGGC ATGACAGAAT CACAAGTTTC CAGGCCTGCC AGGGCATCTG GGTGAGACCC 780
CTGTTTCACA ATAAAACTGA AAAAGGAATT GAAGCTGTAG TTTAGTAGTA GAGCTCGTGT 840
TTAGCACAAG GCTCTAGGTT CTATCCTCAG TATGGGACAA CATAATACTA AAGGCTAATG 900
TTTTAGGGGT TTGCAGGGAT AGGAGAGGGG CCCCCTCATC GTCATCTTCT GTGGACTTGA 960
TTTTCTCCTT TTTGGAGGCA AAATAATGAA CTGGACTCTC CAGGTGCCTG TCAATATGTT 1020
TCCTCTTGGT TTTGAACCTG GTAGGAGGTA CTAAGTGGGA GAGAATGAGG AATGGGCTCA 1080
CTAGTAAGAG CTACTGAGCA CTTCTTTCTC CCTGTGCTCT GCTGTAATTG CCATGAAGCA 1140
CCAGACCAGA CTCCCTCTCC CTGGGAGGAA ACATGAGTTT GGCTAAATAA GAGTGTAGTG 1200
ACATGTGTAG CTACAGTGTC CTCATGTGTT GCTTCCCCAC TTTGGAGAAA ATACCTGATG 1260
ATTATTATGT TTTGATGCTT GCTCGAATAA GGATCTCCTA GCATCCCCTC TTCTTGACTC 1320
AGGATATTTT AGAAAGAAAA GATGAAGCTC TATGGGTACC TCAGGAGGAC CTGTGGGATA 1380
TTTGTTTTCT TCCTTCTATC CCATCTCTAA CCACAAAAGA AAACAAAATA CCAACCAACA 1440
AACCAACCAA ACAAACAAAA AACAAATTAA AAAAACAACA ACCCCCCCCC CAAAAAAAAA 1500
AAAAAACCAA AACCAAAAAA CCAAAAAACT ATCTTGGGGC TATTGAGATG GCATAGTGCA 1560
TAAAGTGCTT GCTGCCAAGC ATAGTGAACT AGTTCAATCC CTGGAAACCA CATGGTAGGT 1620
TCTATAAGCT GTCCTCTGAT CTCTACCTAT GTGCTGTGGC ATGTGCACAC GTATGTGCGC 1680
ATGGACGCGC ACACACACAC ACACACACAA TAATACAAAA TGTTCCTGTG CCACTGCATT 1740
TTGTTTTCTC 1750