EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM023-10919 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CD4+CD8+ 
Coordinate
chr6:124828440-124829320 
Target genes
Number: 42             
NameEnsembl ID
C1sENSMUSG00000038521
Gm5077ENSMUSG00000079343
Lpcat3ENSMUSG00000004270
Emg1ENSMUSG00000004268
Phb2ENSMUSG00000004264
snoU89ENSMUSG00000088835
Ptpn6ENSMUSG00000004266
Grcc10ENSMUSG00000072772
Atn1ENSMUSG00000004263
Eno2ENSMUSG00000004267
Lrrc23ENSMUSG00000030125
Spsb2ENSMUSG00000038451
Tpi1ENSMUSG00000023456
Usp5ENSMUSG00000038429
Cdca3ENSMUSG00000023505
Gnb3ENSMUSG00000023439
Leprel2ENSMUSG00000023191
Gpr162ENSMUSG00000038390
Cd4ENSMUSG00000023274
Lag3ENSMUSG00000030124
A230083G16RikENSMUSG00000055818
PtmsENSMUSG00000030122
Mlf2ENSMUSG00000030120
U6ENSMUSG00000065765
Cops7aENSMUSG00000030127
C530028O21RikENSMUSG00000030329
Zfp384ENSMUSG00000038346
Ing4ENSMUSG00000030330
AcrbpENSMUSG00000072770
Lpar5ENSMUSG00000067714
Chd4ENSMUSG00000063870
SCARNA11ENSMUSG00000088208
Nop2ENSMUSG00000038279
Iffo1ENSMUSG00000038271
GapdhENSMUSG00000057666
Scarna10ENSMUSG00000089617
Ncapd2ENSMUSG00000038252
Mir3098ENSMUSG00000093157
Vamp1ENSMUSG00000030337
TapbplENSMUSG00000038213
Cd27ENSMUSG00000030336
Tnfrsf1aENSMUSG00000030341
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr6:124828744-124828756GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr6:124828912-124828924GTTTGTTTGTTT+6.32
PBX1MA0070.1chr6:124828921-124828933TTTGATTGATTG-6.18
RREB1MA0073.1chr6:124829289-124829309TGGGGGGTGGGGGGTGGGGG-6.63
RREB1MA0073.1chr6:124829290-124829310GGGGGGTGGGGGGTGGGGGG-6.69
RREB1MA0073.1chr6:124829286-124829306GGTTGGGGGGTGGGGGGTGG-7.22
Enhancer Sequence
CCATGTGGTT GCTGGGAGTT GAACTTAGGA CCTCTGGAAA AGCAGTCAGT GTTCTTAACC 60
CTTGAGCCAT CTCTCCAGCC CAGTGTTTCT CAAACGTCAG CCATTCACAG ACAGTGCACA 120
TGGTGTTGCC AAATCTATCT GCTTTATACA GCATCTTAGA ATGTGTTCAT TTTTAAGAGT 180
AAGTAAATGT AATTTTGAGA CAGTCTTGGT GTCAGAACTT ATCAGCTTCC TGCCTTAGCC 240
TCTTAATGCT AGGATCATAG GACATGCACT GAGGTGTGTG TGTGTGTGTG TAGGTTTTTT 300
GCTTGTTTGT TTGTTTTTGC TTGTTTTTCA AGACAGGGTT TCTCTATGTA GCTCTGGCTG 360
TCACAGAACT CACTCTATAG AATAAGTTGG TCTCAGACTC ACAGAGATCT GTCTGCCTCT 420
GCCTCTTGAG TGCTGGGATT AAAAATGTGC ACTACCACCA CTTGGCTTTG TTGTTTGTTT 480
GTTTGATTGA TTGATTTTTT TGTTGTTGGG GAATCAGGCC AGGGCCCTTA CATGTTCTAG 540
TCAAGCACTC TACATCACTA GCTGTTGCTC TTCACAGGTG TAAACAATGT ATCCTATCAT 600
CTCTTGTAGT ATTACTGTAG TATTAATACT CTTGAGATCA TATATTTTAT ACATTAAGTT 660
TGACAATGTC CATTAAAGTC ATAAATATTA AAAGAATAAA ATTAAGATTC TAGATCCAAG 720
TGTCATCAGC AGTTAGAAAA AGGGAGTCTC AGAAAAGAGG GCCACTGAGA TTGTGTGGCG 780
CCTAGCCATC ATGGGACTTT GGGCTTCTAG GAATAAGGTT CATTCAACTC ACTGTTTCCC 840
TCCCTGGGTT GGGGGGTGGG GGGTGGGGGG ACAGGGAATC 880