EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM023-10338 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CD4+CD8+ 
Coordinate
chr5:149931400-149931960 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr5:149931614-149931625ATATTAATTAA+6.62
IRF1MA0050.2chr5:149931794-149931815AGAAAAAAAGAGAAAGAAAGA-6.17
Lhx3MA0135.1chr5:149931626-149931639TAATTAATTAAAC+6.19
Lhx3MA0135.1chr5:149931615-149931628TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr5:149931618-149931631TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:149931622-149931635TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:149931619-149931632AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:149931623-149931636AATTAATTAATTA-6.78
POU6F1MA0628.1chr5:149931616-149931626ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:149931620-149931630ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:149931624-149931634ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:149931616-149931626ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:149931620-149931630ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:149931624-149931634ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_12992chr5:149929224-149931879Thymus
Enhancer Sequence
CAGACCTATA TGCAGGTAAA CACTCATGAA ATAAAAATTA ATCTTTAAAA GAATGGTGTT 60
CGGGGCTGGA GAGATGGCTC AGCAGTTAAG AGCATTGTTT GCTCTTTGAA GGTTCTGGGT 120
TCAATTCCCA GCCACATGGT GGTTCGCAAC CATCGATACT GGGATCTGAT ACCCTCTGCT 180
GGCATGCAGA TGTCCAAGCA GTTGGAGCAC CTATATATTA ATTAATTAAT TAATTAAACC 240
CTAAAAAATG TTGATCTGAT AGCATTGCCT ATGCAACATG TAAGCATACT CAGATTTTTG 300
GATGCATATA ATGGCCTAAA GATGGCCACA GTGGTAATCT CAAGAAAGTG GGTGTATTAG 360
GGTTTCTATT GCCATGACAA TAAAAAGAGA AAAAAGAAAA AAAGAGAAAG AAAGAAGATA 420
GAAAGTGGGC TCAGTGGTTA AGATCACTGA TTGCTCTTCC AGAGGTCCTG AGTTCAATTC 480
CCAGCAACCA CATGGTGGCT CACAACCATC TGTAATGGGA TCCGATGCCC TCTTCTGGTG 540
TGTCTGAAGA CAGCTACACT 560