EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM023-06796 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
CD4+CD8+ 
Coordinate
chr19:8831740-8833550 
Target genes
Number: 39             
NameEnsembl ID
Gm6425ENSMUSG00000086174
Slc3a2ENSMUSG00000010095
Snhg1ENSMUSG00000090867
SNORD25ENSMUSG00000064721
SNORD26ENSMUSG00000065392
SNORD27ENSMUSG00000065281
SNORD28ENSMUSG00000065280
SNORD29ENSMUSG00000065378
SNORD30ENSMUSG00000065782
SNORD31ENSMUSG00000065305
Snord22ENSMUSG00000065087
Wdr74ENSMUSG00000042729
Stx5aENSMUSG00000010110
Nxf1ENSMUSG00000010097
Tmem223ENSMUSG00000075043
Tmem179bENSMUSG00000079437
Taf6lENSMUSG00000003680
Polr2gENSMUSG00000071662
Zbtb3ENSMUSG00000071661
Ttc9cENSMUSG00000071660
Hnrnpul2ENSMUSG00000071659
Bscl2ENSMUSG00000071657
Gng3ENSMUSG00000071658
Lrrn4clENSMUSG00000071656
Ubxn1ENSMUSG00000071655
AI462493ENSMUSG00000071654
SNORA57ENSMUSG00000070167
1810009A15RikENSMUSG00000071653
Ints5ENSMUSG00000071652
GanabENSMUSG00000071650
B3gat3ENSMUSG00000071649
Rom1ENSMUSG00000071648
Eml3ENSMUSG00000071647
Mta2ENSMUSG00000071646
Tut1ENSMUSG00000071645
Eef1gENSMUSG00000071644
AhnakENSMUSG00000069833
Asrgl1ENSMUSG00000024654
Gm6252ENSMUSG00000073844
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GLI2MA0734.2chr19:8833348-8833363AGACCACCCACTAAG+6.54
Nr5a2MA0505.1chr19:8833384-8833399TCTGGCCTTGAACTC-7.28
Nr5a2MA0505.1chr19:8833100-8833115GCTGGCCTTGAACTC-8.25
Enhancer Sequence
CATACAACGG TCAGTGCGGG GCCTCGGGCC GGGAGGCGAC GCGGTGGGTT GGGGTGGGCG 60
GCCCTGGCCT AGGCCTCAGC CCGGGGGCGG GAGGCCGCGA GGAGCCCTAC GTCCGTAGGT 120
AGCGGTGGCC GCGCGGGCAG GGGGCGCGGG GCGCCGCGGG ACCCAGGGGC TCCAGAGTCG 180
CCCGGATTCA GGCGTTGGAG AACCTGTGGC TCAGGGGTGG GGTGACAAGA TTCCTTTCAA 240
CTTTGAGGGT GGTTGATGCC TGTCAGTTCA GTTTGGCGGC CCGACTCTTC CTTTAAATGT 300
GAGTCAGTAG TCGCTTGGTC GTGGGCTACC CTGGTGCCCT ATTTTTCTTT TTCTTTTTGT 360
GATACGATCA GTCTGTTCTT GTAGCTTGCT GCTTATTGTT TATCAAATTT CTAGTCGGAA 420
CACCTATCCT GACATGTTAA TTCATTGTGG TGGTTAGGAC ACTATGACAG CTGAGGTTTG 480
AATCTGGAGT TGGCTGTACT AAACCCGAGT GAGTTAAACT TTCAGGCCTT GTTTTCCGCC 540
TCTTTCATGT GGGTACCTGT CTCCCAAGTT TGTGTGCATG TGCGTGTGCG TTTGTGTGCG 600
TATGAAATAA TTTCTACCAA GTGCCTAGAA CACAGTAACT GGAGTGGGAA TTTTCTTCCG 660
TGAACCGTAG TTTCACTGTC TCTTAATGTA TTCCTTTTTA CTAGGGTTGC TTGGAGAGGA 720
TCGTTGTTTA GAGGATGCTA GATATTAGGT GGATTTCTTT GAAAGTTATA CCTTTTTTGT 780
ATTTGTGTAA TACTGATGAT TTATCCAGGC CTGAAAAATA GCTACCCAAT GAACCTTTAT 840
TTTAATTCAA ATATAATTAC TTGGTCTCCT TTCTCTAGCC ATTCCCATTG TCAACTCTCT 900
CCCCAAATTC ATCCAACATG CAGAGCCCAT TTAGTGTTAA TGTGTATATA TTTGTTTCTA 960
AAGCTTACCA TTTGGGATTG GATAACCATT TAGGGAATTC ATCCCTAGGG AAGGCTAATT 1020
CTCCCTTACA GGGTCAGCCC TAGTATCCCA GGCTGGCCTC AGTCAGTCTC CCTGTGTCAG 1080
CTTCCCAAGT TCGGTATTGC ATAGACTTTT ACTTTTTTTT GGGGGGGTTG GGCTCCTAGA 1140
GTTAAACTCA AGGTCTGGCA AAAAGGAAAA TAAATAGAAC CAAGTGTAGT AGTGCACTGT 1200
TTAAGGTAAG AGGATCAGAG GTTCCAGGTC ATTCCCTGTG TGCCAGGCCT TCTGTTCTCC 1260
CACAGAGCTA TAGACAAGGA AGGATGAAAA TCCCTTGTTT TTTCGAGACA GGGTTTCTCT 1320
GTGTAGCCCT GGCTGTCCTG GAACTCACTT TGTAGACCAG GCTGGCCTTG AACTCGGAAA 1380
TCCGCCTGCC TCTGCCTCCC AAGTGCTGGG ATTAAAGGCA TGCGCCACCA GGCCCGGCTG 1440
TTATTTTTTT GAGATGGTTC ACCAAGTTGT CCAGACTGAC TTGAAGTTTC AAATTCTGCC 1500
TCAGCCTGGG TGGTGTGTGT GTGTGTGTGA AGGATAGGAT AGGCAAGCAC ATTGTCAACT 1560
GGGCTATATC CTCAGCCCTC CTTTTATTTG TTTTGTCTAC ATATATGCAG ACCACCCACT 1620
AAGAGAGACA GGTCTCAATC CTGGTCTGGC CTTGAACTCT GTAGTTCCAA TCCTCTTCTT 1680
AAACAGTGTA CTACCACACT TGGTTGGCTT GTTTGTTTAT TAATTTATTT ATTGAAACAG 1740
TGTGTCAATG AGTAGTTCTC TCTGTTCTAG AACTCAATGA GTAGACCATG CTGGCATTCA 1800
AAACTCAACA 1810