EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM017-00527 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
C3H10Thalf 
Coordinate
chr10:79513460-79516220 
Target genes
Number: 47             
NameEnsembl ID
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
BsgENSMUSG00000023175
Hcn2ENSMUSG00000020331
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
CfdENSMUSG00000061780
Med16ENSMUSG00000013833
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Apc2ENSMUSG00000020135
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Adamtsl5ENSMUSG00000043822
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Klf16ENSMUSG00000035397
Scamp4ENSMUSG00000078441
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
Ap3d1ENSMUSG00000020198
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr10:79514262-79514273TTCAAGGTCAT+6.62
EsrraMA0592.2chr10:79515884-79515895TTCAAGGTCAT+6.62
EsrrgMA0643.1chr10:79514263-79514273TCAAGGTCAT+6.02
EsrrgMA0643.1chr10:79515885-79515895TCAAGGTCAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr10:79514202-79514214AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr10:79513792-79513813TTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT+6.09
Nr5a2MA0505.1chr10:79515881-79515896GGGTTCAAGGTCATC+6.92
Nr5a2MA0505.1chr10:79514259-79514274GAGTTCAAGGTCATC+8.03
SOX10MA0442.2chr10:79514116-79514127AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr10:79514116-79514126AAAACAAAGG-6.02
Stat6MA0520.1chr10:79514373-79514388GCTTCTCAGGAACTG-6.51
ZNF263MA0528.1chr10:79514708-79514729TGAGGCGGGGGGGGGGGGGGG+6.69
ZNF740MA0753.2chr10:79514714-79514727GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514715-79514728GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514716-79514729GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514717-79514730GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03546chr10:79513881-79517704Bone_Marrow
mSE_10175chr10:79512205-79516153Embryonic_stem_cells
mSE_11700chr10:79512223-79516177Placenta
Enhancer Sequence
CCGCTTGTAT GGTTTCACGG CCCCAACTTA TTTCGAGCAG TTAAACATGT TCGACAGAGG 60
CAGAAACTCC AAGGCTGTTT GGACGAAGGG GGGAGATTTA CAGTTTAAAT ATAATTTCAG 120
TCTTTTGGTC ACAGACTAGG GGCCTGTTGC CTGGCAGAAT CCCGCCCTTC CTGCGAGTGG 180
CCTTGAGGAA AGAGGGGATG GACTAGCCAC AGGACTCATG GGCCACCTTT GAACCCCAGG 240
GCTTTGATAT GGGGGGACCC GGTTACAGGC CAGCTGTGAG CCCGGAGTCA GTCTCCTTTT 300
GTTATGGGGA TGAAGCTTAA CTGGCTAATC TTTTTTTCTT TTTCTTTTTT TTTTTTTTAA 360
TCCCCCCCCC CTTAACTGGC TAATCTTAAT AACAAACCTG AAGGCTATTC TCTGTCCTCC 420
GTTTAGCGGC CCGGCCTACT GTCCCTAGGT GGCTGCTCTA CCCGGAGCAC TCCCTTAGTT 480
AAATTCCACT TTGCATAACT TAATCTTTCT TAAGTCCTTC TAGCAGGTTG TCCACGACCG 540
CGGCTTCTCA TTCCCAGGGT CCCCTGTTGG TGGCAATGGC TCTGTCTTTC CAGTGCTTGG 600
GGAGCAAGAG GCGAGAAGCT CCGAGGAGCC TGGGGAAATT GGAGACCTGG TCTCAGAAAA 660
CAAAGGAAAT TAGAAACAAA GGCTGGGGCT TAAGGCCTCA CTTGGTATGT GTAAAACCTG 720
GGGTCCACAC CCAGCACCCG ATAAACAAAC AAACTTGTCA TCCCGGCAGG CACTCAGGAG 780
GGTGAAGTAG GGGGATCAGG AGTTCAAGGT CATCCTTGGC TACAAAGTGA GTTTCAGGCC 840
AGCCTGGGCT ACGTGAGACC CTGTCTCCAA AATAACAATG AGGTAAAAGT CAGGCTCTGT 900
CCAGAAGCTG GTAGCTTCTC AGGAACTGCC AAGTAGCTTT TCGCAGAAGC CCAGATCTTC 960
ATTTCCCAAC TGGCTGAATT AGGGTGAAGT TGGGGTCACT TGGGAGAGGA AGGCACTCCA 1020
TATGCAGATC CCTCCCAGAG CCTGGGGCTG GGTTCCTGAG TGGCCGCCTT CAGCCCCAGC 1080
CCTTCAGCCC CAGCCCCTCG TCCAGAAGTA CGGGCCTTTG AGACGCCCTG TGAGGGTGTG 1140
TTGTGTATTT ACAACTTAAG CTAAAGCTCA AGTGCAAGTC CCTTAGAGGT CTTCAGTGAC 1200
TCTCAGTGTC ACCCCAGCTT GGGGGCTGGG AGGAAACAGC TGACTTCCTG AGGCGGGGGG 1260
GGGGGGGGGG CCCTCAGGGC AACTGAGAAC TTACAGGACA GGATTGGGCA AGAATGTATC 1320
TGACACCCCA GATCATCTTA ACCTTGGGGG GGGGGGTGTC TGCCCGTGGG GCGTGAGCTC 1380
CCTTGGACCC AGATCCCCGG GAGGGCTCCT GTCTCGCGGA TGGCTTACTC CAGGGTTCAG 1440
AAAAAGAGGA TTGAAGGGAT TAGAGTCCAG GCGAGGGCGT GGACAGGCAG CTGAGCTGAG 1500
GAATGTCCTG AGTCACTCCT GTGACACGGG GAGGGCAAAG GGCCCAGTGC TGGGCTGAGA 1560
GCTGTGGGGG CTGGACAAGG CCATAGGTGA AGTTGCAGGA GGAACTGTTG GGCCTTCAGC 1620
TTCTCACTTA GGCCCCTAAG ACCTGTGGCT TCTTTGATGT AGGCAGGGAC CTCTGAGGAC 1680
AATAGTAACT ATTTATATGT CTCTTGCCAC CTTGCTTTCC TGACACAGGG TTCACTGTAG 1740
CCTTGGCTGA CCTGGAACTT GCTTACCAGA CCAGGCTGCC CTCTAGGCTC CAAGGGCTGG 1800
GGCTAAGAGT GTGACCACTA GGCCCATCTC CATCTTGGTT TTGAGGCAGG TTCTCTCTCT 1860
GACCACGAGT ACTTGGGTGA CCTGACTTAG CTGCAGGGAT GCTCCAGCCT CGGAATCGCA 1920
GGTTCTGGAA TTACAAGAGC ATCCTTGTGC ACCAGATTGC GTGGGTGCTT CGATTGGGAC 1980
ATAGTCCTGT GTTTTCATGG CAATGGCTTT CTCACCAAGC CCTCTTATCA CCCCCTCAAA 2040
TCAACTTCAC AGGAATCAAT ATCTACAGGT GACAAGATAG GGCCTGGTGT CATTGACCTA 2100
TCTATCACCC TAGTACCTAG GAGTCTAAGG CAGGATTGCT GAGTTCTAAG ACCGGCTGAA 2160
CTGTAAAATT GGGGGTCGAG GGGGGGGGGA GAAGCTACAT CTGGGGTTCG GGACTCAATG 2220
GGTTGAGAGC CCTCACTTGC ATGCTGCAGG TTCTGGGTTC CATCCCTACA CCTCATGGCA 2280
GCACACTTTT GCCATTCCAT AGTTTAGGTT AGCCTGAGCT ACAGGAGGCA ACCTCTGATA 2340
AAGAAAATAG AAATGGAAGG GATGTGGGGA TTGGCCGACA CCGAGATCCC AGCACTCAGT 2400
AGGCTGAGGC TGGCGGTCCA GGGGTTCAAG GTCATCCTCT GCTATATAAA CAGTCCAAGG 2460
CTAGCCTGGG TTACATGAGA TTCTGTTTCC AGTAGAAAAA GGAGACTCCT GTACTTTCAA 2520
AGGGGCTCTT TAAGGGGATG ACTTTGACAC GCTTTCTATT CCCAGAGGTT CCCCAAAGCG 2580
CCCTGGCACC CTGCTCCGCT GCAGGCAACC TCGCGGATAA CTGTCCACAG CCCTCCAACG 2640
CGTCGTCCGC GAGAACGCGG CTCCCGTTTC TCCCGCGTCC CTATCACTGG GCATGCGCAG 2700
TTGCTGATAA CAACAAACTC GTAAGCCCAG CCCCGCCCAA GCCGTCCCTT CATTCAGGCT 2760