EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM017-00521 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
C3H10Thalf 
Coordinate
chr10:79302940-79304610 
Target genes
Number: 38             
NameEnsembl ID
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
BsgENSMUSG00000023175
Hcn2ENSMUSG00000020331
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
BC005764ENSMUSG00000035835
CfdENSMUSG00000061780
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Dazap1ENSMUSG00000069565
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Mbd3ENSMUSG00000035478
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArntlMA0603.1chr10:79302979-79302989GCACGTGACC-6.02
CDX2MA0465.1chr10:79304076-79304087TTTTATGGCCT-6.02
ESR1MA0112.3chr10:79303976-79303993GAGGTCACCACGACCCC+6.19
ESR2MA0258.2chr10:79303977-79303992AGGTCACCACGACCC+6.28
Foxq1MA0040.1chr10:79303879-79303890AATAAACAATG-6.02
SP2MA0516.2chr10:79303735-79303752AAGTGGGAGGGACTTTG-6.34
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04504chr10:79303153-79304081E14.5_Brain
mSE_04845chr10:79302976-79304654E14.5_Heart
mSE_05508chr10:79302762-79304677E14.5_Limb
mSE_07352chr10:79302988-79304675Intestine
mSE_08114chr10:79302803-79304677Kidney
mSE_09089chr10:79302817-79304681Lung
mSE_09812chr10:79302961-79304656MEF
mSE_10291chr10:79302623-79304692Embryonic_stem_cells
mSE_11035chr10:79302942-79304508Olfactory_bulb
mSE_11888chr10:79303090-79304641Placenta
mSE_12235chr10:79303866-79304386Spleen
Enhancer Sequence
TGGGTTCCAT CTCCTGCACC ACACAAACAG AACTTGGTGG CACGTGACCA TCATCTCAGC 60
AATCAGGAAA TAGAGGCAGA AGGACCAGGT CATCTTCAGC TACATGTCCA GTTTGAGCTA 120
GCCTTGGCTA CATGAGACCA TGTTCAAAAA GGCAAAAATC AATGCAGGCA GCAGGCACCC 180
TGCATAGCCC TTCCTTGCCC TGTAGTCCTT CAAGCTTGGC AATGTCTAAG GAGCCACTAG 240
GGCATCACCA GAGACAGATG GGAGATCACA TCTAAACCTC CAAACTCAGA AAATTGGGCC 300
AAAGACATCC CTAGCAGGTT TTTCCAGCCC TCAGAGGCAG TAACGTGCAC CTGAATTGCT 360
TGAACTTGCT GGAATTTCTT CCATGGTACA GCAAGCAGAC TCATGGCTGT GTGGGACGTA 420
GACAGGAGGA GTGTAAAGGG GGACAGGGAT GTTGAGGGAT ATGCTAGTGT TTGGATACTG 480
GGTTCCAGCC CAGCCTGTAG GTGGCAGGAA CCCCTTCTTC CTACCTTGAT GCTCTCTGGT 540
GGTATAGCCC CTGCCTAGAA CCCACACAGC GAAGGGCTGG AGGTGTGACC ACAAGGATCC 600
TAAGGACCCT CCCTGCCTAG AATCCTCCAG TTAGAGCCCT GTGTGTGCTC AGGGGTGGAG 660
CCCTGCCTAG AACCCCGCAG TGAGAGGCTG GGAGCAGACT CAGTCCTTAG CTCGACTCTA 720
GCCAAGTACG CAGCTCGGGG TTTATGATAA TATATGGAAG AGTGGAAGAA AATCACCCGC 780
TGTGGAAGTC TGAGGAAGTG GGAGGGACTT TGCCGCGGAA TGTCTGTGCC CACGCCTGGG 840
CTGTAGTGGT AGTCTAACTC CTCACACCCC ATCCCCCAGG CTCCTTCCAA GTCCAGACAG 900
AGAAAGGAAT TCCTGGCTGA GTCTAATTTA AAACAAACAA ATAAACAATG TTTGCAGGGA 960
GGAGAATGAG AGGAATGCGG GCGGGGCTCT TCCCTGCGGG AGAACCGGAG AACTGGGGCC 1020
TCGGACTGCA AGAACAGAGG TCACCACGAC CCCAGCAAAC TCCCACCCCA TCTCTGCAAA 1080
GAGCTGGAAA GCACTGTTAA GCCCACCCCG ACCGGCCTTC CAGGGTTATT CTGTTGTTTT 1140
ATGGCCTTTT TGCTCCGCTG GCTGCAAATT GGGGGAGGGG AGAAAAAAAA AAAAAAAAAA 1200
AAAACACGGG AGGCGGGGTA ACGACAGATT CCGGATCCCT GGTCCCGGAA ACCTTTGTTT 1260
CTTAAGGCTG GGCAGCTGCT CCTCAGAGAC AGTTAGGGCT CTGGACTTGG AGCACCGGTC 1320
AGTGTTTTTA CTTCAAGGAA AGCTCTAACC TAGAGCAAGA GCCCAAAATT TCTCAGGTAG 1380
TTTGAAAAAC AGTGAGGTGG TTTTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1440
GTGTGTTTCT TTCTGAGGTG GTTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 1500
TGTGTGTGTG TGTGTTTCTT TCTTAGTACT TGGTAAGCTG AAGCAGGAGG ATTGCGGCAA 1560
TTTTAATGAC AACTGGGCTA CATGAGACCT TGATTGTCTC CAAACATTGT TGGTGCCCAC 1620
CTGTCATGCC AGCATTCAGG AGGTGGAGGC AGGCGGATCA AATGCAAAAG 1670