EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM009-13411 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Brain 
Coordinate
chr3:5220820-5225430 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221759-5221777TCTTCCTTCCTTCCTTCC-10.05
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221763-5221781CCTTCCTTCCTTCCTTCC-10.83
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221356-5221374CCTCCCTCCCTCCCTTTC-6.13
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221360-5221378CCTCCCTCCCTTTCTTTC-6.14
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221795-5221813CCTTTCTTCCTTTCTTTC-7.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221783-5221801TCTTCCTTTCTTCCTTTC-7.18
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221791-5221809TCTTCCTTTCTTCCTTTC-7.18
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221779-5221797CCTTTCTTCCTTTCTTCC-8.03
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221787-5221805CCTTTCTTCCTTTCTTCC-8.03
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221755-5221773TCTTTCTTCCTTCCTTCC-8.26
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221775-5221793CCTTCCTTTCTTCCTTTC-8
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221767-5221785CCTTCCTTCCTTCCTTTC-9.6
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:5221771-5221789CCTTCCTTCCTTTCTTCC-9.72
IRF1MA0050.2chr3:5221334-5221355CTTCCCTTTCCCTTTCCATTT+6.15
MEOX2MA0706.1chr3:5224323-5224333AGTAATTAAC+6.02
POU2F1MA0785.1chr3:5224862-5224874CATATGCAAATT+6.07
POU2F1MA0785.1chr3:5225147-5225159AATTTGCATATG-6.07
POU2F2MA0507.1chr3:5225154-5225167ATATGCAAATAAA-6.98
RREB1MA0073.1chr3:5220853-5220873CCCCCCCCCAAACACACACA+6.09
RREB1MA0073.1chr3:5220857-5220877CCCCCAAACACACACACACA+7.55
ZNF263MA0528.1chr3:5221763-5221784CCTTCCTTCCTTCCTTCCTTT-6.16
ZNF263MA0528.1chr3:5221771-5221792CCTTCCTTCCTTTCTTCCTTT-6.35
ZNF263MA0528.1chr3:5221755-5221776TCTTTCTTCCTTCCTTCCTTC-6.36
ZNF263MA0528.1chr3:5220965-5220986CCTTCACTTTCCCCCTCCCCC-6.88
ZNF263MA0528.1chr3:5221759-5221780TCTTCCTTCCTTCCTTCCTTC-7.03
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04641chr3:5217848-5223333E14.5_Brain
mSE_05530chr3:5217772-5223340E14.5_Limb
mSE_09724chr3:5217731-5221412MEF
mSE_09724chr3:5221430-5221960MEF
mSE_09724chr3:5221994-5223143MEF
Enhancer Sequence
GGTACCAAAG GTTCAGATCA CAAACATGGA CACCCCCCCC CCAAACACAC ACACACACAC 60
ACACACACAC ACACACACAC ACTCACAGTC AACACTCACA GAACACACAT TCGCCCCACT 120
CCCCCCACCT CTAGCCCCAA CCTTGCCTTC ACTTTCCCCC TCCCCCAAAA AGCACACACA 180
GAACAACATC CCCCACCAGC ACCAAACAAA AACCCAAAGA CAAGTTCAGT GGACGAAGAT 240
GGTGTATTGA CACTGACTCA GACAGAGGCA GGTTCACCAA GAAATCTAGC GTTGGTGATT 300
TCTGACAGTT GCATTTCCTC TCCTTGAGCA CCCCCCCCCC AACCCTTTAT TAACTCTGTT 360
CCATGTTTAA TCAAGGATCA TGTAGATGGC AAAAGGAGAG AGAGAGAGAG AGAGACACAC 420
ACACACGGGA CAGAGAGAGG AGAGAGGAAG AGAGAGAGGA GACTGGAAAC AGGAGGGGTT 480
TAATTTTTTC GTTTTTTTCC CCCTTTTTCC TTTCCTTCCC TTTCCCTTTC CATTTCCCTC 540
CCTCCCTCCC TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC TTTCTTTCTT 600
TCTTTCTTTC TCTTTTTATA ATTTTCTTCT CCTGGATTTT CAGTGGCGTG ATCCCTATAC 660
ACGTGGAGTG GTTAGACCTC ATATGTAGTA TTATATTTTT AGTTGGGTGA ATGTTTGGAA 720
GAGTCAGGGA GAGGCTGAGG CTGCCGCTGC CTTTTCGGTT GGTGCTTAGA TTAAGGCTGA 780
GACTTGGCTG CGATTGGGAC GCGACAGTGA CATGGGCATC GATCGCTTCC ATTGAGAGCA 840
AAGCAAAAAC ACAGCCCGGG TATGTAACAC TTGCTGCCAT CCACACTTGC TTTACCTTGT 900
GTTTACTGAC AAAACTGACG GAGCAAGCTC AGACTTCTTT CTTCCTTCCT TCCTTCCTTC 960
CTTTCTTCCT TTCTTCCTTT CTTCCTTTCT TTCGCTTTTT GCTATTTTCT CTTTTCTAAA 1020
TGAAGAATAA AAAGAATAAT GTGTATAACA TTTGTTGAAA AGGATGGGTT TTAATAACGC 1080
ATAAAGGAAA TTTGGGGATT ATTTCACTGC ATCTGTTACT ATTTTAGAGT TTTCCTTCTC 1140
CACTAAGAAG CACATTAAAT AAATAGAAGA TTTTTTTCCA AATTAAAAAT AAAATAAAAT 1200
AAAAAGTAAA TCCTTAAGGG AATGTTTGAT ATTGTTCAAG GGCTGTGGTT TCAAGCAGCA 1260
GGAAGGAACA CAAAAAAATA AAAGATGGCT AGCCAGCTGT TTTAACCTCT TGCACCTGGC 1320
TTCAGTGTAT GGATCATAAG GGTCAAACAG TTGTTTTTAA TGGTTTTAAT ATTTATGGCA 1380
TAAACTGCAG AGAGCATCGC TGTGTGTTTA TTCAATAGCT GGCTGCTCAT GTATTTAAAA 1440
AGTAAACTCT TATTGGAGTG TTTTCCTTTT TTATAGCAAT GGAGATAGGG TCAATGAAAT 1500
ATGAGGGTTG CACCATAAAT CGAAAAGTGA AATGTACCCA AGGAACAAAG GAAGGTCAGG 1560
TGAACTGGCT GTGTAAGTCA CAGCAGCAGC ACCCACTATG GGATAAGGCA GAGACAGTAG 1620
CTCTGGATCT GGGAAGTGAA AGTTTCTAAC TTAATAAAAA CAAGACAACA CATTCGGCTC 1680
TATTGCAGTG TTTTGCAGCT TTTGGCAGGA GTAGTGCAAC TCTTCATTAA TTGTGAGCTA 1740
GTTGGATTAT TTTAAAGGTG CTGCAACAGC AAGGGGAAAC AGAAAGGAGA CTGAGAAAAT 1800
TGCTGTTTAA TATTGAAGAA TTTACTGCTT CCATTCTGAC CATGAGCCTA AATTTACACA 1860
ATGAAATCTG ATTATCTATA ATAACAATAT TAGATCCAGC ATTGGATGGA TGAGAATTGA 1920
GGTGGTTTTG TTGATTGCAA GGGTTTAATG TTGCATTTCA GAATCTGATG TGGTTTGGTC 1980
TCCCTTCCAT TAACTGGAAA ACCCCTGAGG TTTTACAATT ATTTCTTAAA GATAATACAT 2040
TTAAGATTGC ATTGGTAGGC TGAAGAAAAG TCATAAAGGC AAGAAGGGAA GCCCTTAATA 2100
ACTCTTGAGG TTCAGACATG TTCAGCAGTT AGATTGGCTC TGACTTCACC AAGGGTCGAC 2160
AATGTGTCAT TTCCACGAAG CCAAATTGCC CTCTGCCTAT ATGATATTAA TGTGCAAATC 2220
AATATTTCAG GGATTAAATT TCCCTTCTTC ATTTTTTATG GTTTCTACCT CAATAAGTCT 2280
CAAGTCTATT AGAAGAGGCT GTATGATTTA AAACCTTTCA CTGCAGAATG GCTTGTCGTA 2340
GTCTTGTTTC ACAGACCATT TTAGGGTTTT TGTTATAACG ACTAAAGGTG CCCTACAGAA 2400
GTTCTGAGGC AGTGTGGAGC CAGGGTCAGT AGTGTAAGGC CCTCATTTGA TTAAGAGCTA 2460
AGATATATTG GAAATATATA TATACATATA TATGTATTTG GGCATGATAT ATACATTCTG 2520
CTGCTTTAAA AATATTATGT TAATCACATT GATTTATTTC AAAATCAATT GATGTCCCTT 2580
TCTTAGTAGT GATTTGTTCA GCATTCTTGT GGACTGTGTT GATTTTCTAA AACACTATGC 2640
ATAAATTAGC CTTGTGTGAA AGTATTTGGA GGAAGAGAGT TTTCATGTAG CAACATTTTC 2700
CTAAGAAGTT CTTTTAGAAA TTATTGTGTC TCACAGTAAT AATCAAATGT TGTCATTTGC 2760
GTGCACTGAT CTCATAGCTA TCATTGAGGT TTCTGACTAA ATGATTAGCT GGTTTCTACT 2820
AAGTGGGGTC TCCTTCCTTT CTGCTATATG TTTACTTTCT AACACCTAGC AGGAGCAATG 2880
TGGCTTTGGA CTCTCTTGGA GAATCACAGT TACATCTGAA AATATGTATA CTGATTGGAA 2940
AATACAAAGT AGAAATGAGG GGAAGGTTGA AATAAAAGAC TGTGTCTTTA TCATAAAATC 3000
TTCAGAAGGC CTACTGCCTA TCATTTGATC CTGTTTTATA GTCTTAAACC ATCTGGACAA 3060
AGTTCTGCAC AGCTGCAAGA ATTTCATATG TGATAGAACA TTTTTTCCAT TCAGTGTGAA 3120
ATGTTCCTTC CTAAAAAAGT ATACCAGACT CGCCTAATTT AGTCTGTTAA AAAGAATGCA 3180
TATGAAAATG GACAAAAGGC TCTTTAATCT CTGCAAGCTG TTTTTGTTGT TGTTGCTTTT 3240
TGTTTTTTCT TAAAGACTCC TGTCTATTTG GGTTTAAAAA ATTGTATTTA TTGAGGAGAT 3300
GATCTGAGGT GTGACATTAA AATAATCTAT GATTTTTGGG CTGGTAGCCA TGTTCCTGCC 3360
CTATTTGCAG AACTACTTTT TATGCCTGTC AAAACACAGA ATTAATCTAT CCTTATTTAC 3420
AATTAATCTC AATAAAATTA ATCTTAACTA TACTTTATTC ACTGGCTTAA AATATCTAAT 3480
TATATTCAAT TAACGGCTGT TATAGTAATT AACATTGCTT AATTGCCTCT GAATGTATTT 3540
ATGTAAAGCT CACTAGTTGC TTCTGTCTCC TTTTTCCTTC TCTAGTTTCT ATTTTTACTG 3600
TTATCAAACC ATTTTTATCT CCCAAGGTTT GACAGTGTCA ATGGTGCAGA ATCTTCCTTA 3660
ACACTTTATT GAAATGAATG TGATCGCTCT CCTGTATTAG ACACTTGTTA GGATCCTTTA 3720
GCTACTCTTC TAACTGACAG CCCTGTCTTC ATCTTATCCA GGATCTCTAG TATACTCACT 3780
AAATATTTTT TGTTATTGTT GCTAGAAATA GGAGAACCCA GGTTAGGCCT TGTATTCATA 3840
AATGAAGAGT TTTTCTGTGT CTGTCTAGGA GCTGTCCCCA TAGGCAGTGT AGGGTTTTGG 3900
GGGTTTTGTT TTGCAGTTTT CCCCCCTCAC TAAAAACATT CTAAGGGTTA AAGACTTGGC 3960
CATGGTTCAA ACTGAGAAGT GCCCAGGGAA AGTGCATGTG AATATGTACA AGTTTCATGT 4020
AATTAGTGCT TAATTATATT AACATATGCA AATTGTCAAC TTAGGAGCTT GTTGAGCTGG 4080
CAAAGATCAG CTAGGCACAA TTGCTATATT GTTCTGAAAC AATAATGGAT TTCAAGTTGG 4140
ATTGTGGAAA CACATAACTA GCTATCTAAT TTAACTCATA CCATGGTGAA ATTTCATTAG 4200
TCTCCATGGA GACTGGCTTA ATTGTGCTGA CTAATGTTCT GGACTTTAGA ATGTCCTAAA 4260
AAGAAATCTT TGTTTGCCTA ATCCACCTTA CAATGATACT TGTTTGTACA TGTTTCCCTT 4320
GTGTGGGAAT TTGCATATGC AAATAAATAG TTTCTCTGCC CCATTTGCCA TGGGTGTTCA 4380
TTACCCATTA TTACTGATCT GTTACTGAGT CTCCCAAGAC TGGATAGTGT CAACCAGTCC 4440
AGCTACATTC TTTCATAATT TGTTTCTGAT TAATAGACTA GAGTGAGTCT TATTCTTTGT 4500
GGGCATCTGC AAGGCAAGGT CAGTTCTTTA TCCTAAAAGC AAAAACAAAA ACAAAGAGTT 4560
TCTGCAGTAA TTAAAGGACT TTTTCTTCTG CTCTGCCTTC TCCTTTTCCC 4610