EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM002-28243 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
3T3-L1 
Coordinate
chr4:140243320-140247000 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:140245289-140245310TTAAACTTTCTTTTTCTTTTT+6.53
IRF2MA0051.1chr4:140244842-140244860GGAAAGAGAAAGGCAATC+6.27
JUN(var.2)MA0489.1chr4:140245984-140245998CTGAGTCATCTCTC-6.02
Lhx3MA0135.1chr4:140243700-140243713TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr4:140243697-140243710AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:140243701-140243714AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr4:140243696-140243709AAATTAATTAATT+6.92
NFE2L1MA0089.2chr4:140245980-140245995ACTGCTGAGTCATCT-7.33
Nfe2l2MA0150.2chr4:140245982-140245997TGCTGAGTCATCTCT-6.47
POU6F1MA0628.1chr4:140243698-140243708ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:140243702-140243712ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr4:140243698-140243708ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr4:140243702-140243712ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr4:140244241-140244261TGGGAGGGGGTGGGAGGGGT-6.3
USF2MA0526.2chr4:140246384-140246400TGGCCACGTGACTAGG-6.5
ZNF263MA0528.1chr4:140244203-140244224GGTGGAGAGGAGAGGAGAGGG+6.01
ZNF263MA0528.1chr4:140244213-140244234AGAGGAGAGGGGAGGGGTGGG+6.28
ZNF263MA0528.1chr4:140245016-140245037CCCTCCCCCCTCCCCTTCTTT-6.46
ZNF263MA0528.1chr4:140244208-140244229AGAGGAGAGGAGAGGGGAGGG+6.76
ZNF263MA0528.1chr4:140245004-140245025TCCTCAGCCCCCCCCTCCCCC-7.26
ZNF263MA0528.1chr4:140245011-140245032CCCCCCCCTCCCCCCTCCCCT-7.55
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_06341chr4:140245107-140247204E14.5_Liver
mSE_09854chr4:140243732-140246464MEF
mSE_10193chr4:140243719-140247978Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
AAATAAAAAA AAAAAAAAAA AAAGGAGGGT CTAGAGAGAT AGCTCAGAGG TTGAGAGCAC 60
TGGCTGTTCT TCCAAAGGAT CCGGGTTCAA TTCCCAGCAC CAATGTGGAC AGCTCCGAAC 120
TGCCTGTAAC TCCAGTTCCA GTGGATCGGA CACCCTTATC CACACAGACA CACATGCAGG 180
CAAAACACCA ATGCACATAA AAAATAATAA ATTGGGAGCT GGTGAGATGG CTCAGTGGTT 240
AAGAGCGCCA ACTGCTCTTC TGAAGGTCCT GAGTTCAAAA GCCAGCAACC ACATGGTGGC 300
TCACAACCAT CTGTAACAAG ATCTGACACC CTCTTCTGGG GTGTCTGAAG ACAGCTACAG 360
TGTACTTACA TATAATAAAT TAATTAATTA ATTAAAAAAA ATAATAATAA ATTAAGGGGC 420
CTGGAGAGAT GGCTCAAGGG GTTAAGAACA CTGACTGTTC TTCTAGAGGT CCTGAGTTCA 480
ATTCCCAGCA GCCACATGGT GGCTCACAAC CATTTGTAAA GGGATCCGAT GGTCTCTTCT 540
GGTGTGTCTG AAGACACAGC TATAGTGTAC TCATATACAT AAAATAAAAT AAATCTTTTT 600
TAAAAAAATA AATAATTTAA AAATGACATT TAAAAACACA ACGGGGTGGG CGAGAGACTT 660
GAGAAAGCCT GAATTAGCTA AAGTACAGCA GCACCCCAGG AGCAATCCAG AAGGTAATGG 720
TCACGGGAGG GTTAATGGAC ATTCCTCTCT GCCAGTGGGC TGGGGGCTAA GGTGGAGTGT 780
CAATTAAGCA AGGCAGTGTG CAGAGAGGCC ACCACCAACT ACTGAGTCAC TGGAAGCAGC 840
CAGCACTGGG ATGGCATGGG AGGGGTGGGG AGGGGAGTGG AGGGGTGGAG AGGAGAGGAG 900
AGGGGAGGGG TGGGGATGAG ATGGGAGGGG GTGGGAGGGG TTCGGAGGGG GTGGTATAGT 960
TATTCACTCC CTGAAGCTCC CAGGGTCCCG CCTGGGGGAA GTTCCTCCGG GTAAGACAGT 1020
CTGGACCTTC TAATGCTTCC CTCCTCCAGA TCCCTTCCGC CCCATCCCCA GAGGCCTATG 1080
GCCTCAAGTT CCTCCTGACA CTCCACCCTC AGCCTTACTA TAAACCCATA GTCAGTGTAA 1140
CCCAACTGTG AGTCACGTGC TTGCAATTCC TGCATCGGAG GCCACGGGAG TCAGACTGCT 1200
TGGACCAACT TAGAGGCTTT TCTCTTGTTA ATTTTTTTTC TACCCTAGTT TTTTTTTTTT 1260
TTTTTTTTTT TTAAAGATTT ACTCAAGTGA AGTCATTTGC CTGCATGTTT ATAACATGTG 1320
TGCCGGGTGC CCAACCAGAG TAAAACCTTG CCCTTCACCC CCCAAAAAAA TATATCCTAG 1380
GCTAAGCGTC ATGGCAGATT TTAATCCCTG CACATGGGAG GCAGAGGCAG GTGAATCTCT 1440
TTGTGAGTTT GAGGCCAGCC TGGTCTATGT AGCAAGTTCC AGGATAGCGA GGAGACCCTG 1500
TATCATTAAA AAAAAAAGAG GAGGAAAGAG AAAGGCAATC CTATCTCTAT GCTCAACCTT 1560
CCCTCTTCCC TGTCAGGACA ATTTGCCAGA GCTGTGACTG GACTTAACCA CAAAGGCTGG 1620
GGAAAGCCAC TCCCCAATTC CTGAAAAATG CCATCCCAGA AAACACAGTG AGGTTCCACC 1680
CCTTTCCTCA GCCCCCCCCT CCCCCCTCCC CTTCTTTAGT TTCTGGAACA ACCCCCACCC 1740
CCACCCCAGA GTAAAATGTA AGTCAGTGAA CTGTAAATCT GTGGGTCTCC CCCAAGATCT 1800
ACGTTTCGTT TCTGTTTCGT TCTTGGCCAA GAACAGAACT CATTTTCTCC CCTCTTCATG 1860
TTGGTTCCTA CGTCACAGCC AGACCCAGGT GTTGGAGCTA AGGGTGGGGC TCATGGGAGA 1920
GGGTTCACCT GGCAGAAATG AGGGCCTTTG GTTTCTTCCT TAGCACCCCT TAAACTTTCT 1980
TTTTCTTTTT TTAATATGTA TGGGTGTTTT GCCTAACCTA CAACTGTTCA TGAGTGTGCC 2040
TGGAGCTCAC GGGTGTCAGA GGAGGGTGCT GGACCCCACG GAAATGGAGT TACAGACAGT 2100
AGTGAGCCGC GCTGTGGGTG CTGGGATTCG AACCTCTGTC TTCTAAAAGA GTAGCCAGCA 2160
CTCTTAGCCA CTGAGCCATC TTTCCAGCCC CTGACGTATC TCAATGAAAA GTGTGCCATG 2220
CTAACCTGAC CGTCGAGGTG TCTCTACAGC TGTCCCCATG CGGAGGTAAA ATGCATGCAT 2280
TAAGCATCTT AGTCTTGGGG GTGATGGCAA GATGGGGAGA CTCAGCAGCT GAAACCATTG 2340
GCTGTCCTTG CAGAGGAAGG GTGCACCCGG CCCTTACATA CACGCAGGCG AAACACTCAT 2400
ATGCGTAAGA TAAAATAAAA TACATGTAAA AAATGACCAA CCCAGAGGGT TTTTCTCTTG 2460
TTAATTTGTT TTCTACACTC GTATTTTTTA AAGATTTATT CATGCATAGA AGTCATTTGC 2520
CTGCATGTAT GTAACATGTG TGCCTGGTGC CCTGCAAAGG TCAGTGTTCC AGATCCCCTA 2580
GGGTTAAGTA TGGTTGTGAG CAACCCTGTG GGCACTAGGA GTTGAACCTC GCTCTTCTGT 2640
AAGAGCACCA AGTGCTCTCA ACTGCTGAGT CATCTCTCCA GCCCCCACAT TTTTTTTAAA 2700
CAGTCCTATC TACAAGGCCC CATTCAGAGA AGCTAAGATG GCTAGTAAGA AAAAAAAAAA 2760
TCCATGTAAT ACATCTGTGA TTTTACCATT GGAGAGGCAG AGGCAGGGGG ATTATGAGTT 2820
GGAGGCTAGC TTGAGTTACA AGTCAAAACT CGTTCTCAAA ATAAAGGGAA AAAAATGATG 2880
AAGTGTTTGC CTGGTGTGTG TGAAGTCTGG CGTTCCATCC CCAGGGTGGC CTGAAACGGA 2940
GCACGGAGCG TGTTGCTGCC CGCCTCTGAA CCCAGCACTA GAGAGGTGGA GGCAGGGGGT 3000
TACTGTCCAG GTGCAACTTC TCTTGGTGAG CTTGCAGACA GAACCTACCC TGTACAGTGT 3060
CACCTGGCCA CGTGACTAGG GCCACTTCCT CAGCGAATCC AAGCGGCGGC CCCTCCCCTT 3120
TTACTTCCGA CAGGGTCCCA TGTAAGCTAA GCTAACCTAA AGCTCACGAC ATTGACACGG 3180
GTGACCTAGA ACTTGTGACC CTCCAGTCTC CACCTCCAGA ATGGTAAGGT CACAAGCAGG 3240
AGCGCCACCA TGCCGGCTTT TAGGAATACC GGGTTTTGTG CATGGGCAAA CACTGAGCTC 3300
TGCCCACTCC ATAGACCAGG AAATGTGCAC ACAAGTGAAA AGCTTGCCCA GGCAGTGTGA 3360
CAGGGCTTAC ACCAGCTAGG AAGGGGAAGG GACCCACATC TCCCCAGAGC TTAGAACCCT 3420
GACAAGGGAA GTCAGAGGAA GACAGTGTGG CCCTCAGATC CAGGGGCAGG AATCCTGAGA 3480
ATTAGACTAA ACCAAGAAAG GGAAAGAGAA CAAATATCTT GTCTCCAGCA CAGGTGGAAG 3540
CAAGTCGGAG CGGCAGATGT CAGACAGAGC ATGCAGCATG TTAATGGTGT AAATTTGGAC 3600
GAGTTAAGTC TCACTTCCCT CATCTTTATG AAGAGGATCA TAAACTTCAC CTTCAAAGAT 3660
AGCCATCAGG TATTAAATGA 3680