EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM002-26529 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
3T3-L1 
Coordinate
chr4:12013450-12014860 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Hnf4aMA0114.3chr4:12013530-12013546AGGGTCAAAGTTTAGA+6.12
IRF1MA0050.2chr4:12014337-12014358AAAACAAAAAAGAAAGTGAGG-6.46
IRF1MA0050.2chr4:12014411-12014432TCTCGGTTTCAGTTTCCTTTG+6.96
IRF9MA0653.1chr4:12014415-12014430GGTTTCAGTTTCCTT-6.66
RXRBMA0855.1chr4:12013530-12013544AGGGTCAAAGTTTA+6.08
RXRGMA0856.1chr4:12013530-12013544AGGGTCAAAGTTTA+6.33
RxraMA0512.2chr4:12013530-12013544AGGGTCAAAGTTTA+6.15
Enhancer Sequence
CAAACACTGA GTGGGTTAAT GAATTCTATA CTTCGGCTTC TTGTTTAGTA AAATGGAGAA 60
AAAAACAGGA CCTACCTAAT AGGGTCAAAG TTTAGAAATA TGTCTGGCAT CATGTTGCTA 120
CTTTTTAAAC TGCAATTATT ATTGAACTAT GAAAACTACT TACTTGCTCT AGGAATTACA 180
TTTCTGCATC ACTAAACCAT ATGTATGTGT GTTTAGTGAG TTTTAATTTT GTCAATATCT 240
TATTGGAAAA TTGCTTTCAT TCAAATACTC TTTCTCTAGA AAGAAAATAA ATGTTGTTTG 300
TAATTACAAG TAGACTCAGC TAGTTAAAGA AAGAATTCTC TAAGGACTAA GTAGAGCCAG 360
CACCTGTAGG AGTCTATGTA CAACACACAC GTCTTCATTC ATTGTCATGA AAGCAATACA 420
ATGCAGAACA CGTTTGCTCT TCACACTCCA TCTTCTGACA CAGTGATCCG CACTGCCTTA 480
AGTGAGACTC TACCAGGCCT AAAGCAGGAG AGTTAACCAG TCTGAGATTC ACAGCATTTT 540
AGACTTCAGT AAATAGGAAA AGACTCATTC TGAGTAGTTA AGGGAGAACT AGACCAATCG 600
ATGCAATTAA GTCTAAAAGG ACAATGTGAG CAAACAGAAG TCATCAACAA TAAAAGGGAC 660
AGGTCCTAAG GGAATATGTA ACCACAGATG CAAAGCCACG CGCTGGGAAT GCAGAGGTAG 720
AAAGTGAGGG AAGCCAGGTG TCCTGGCCCA CGCCTTTAAT CCCAGCACTC AGGAGGCAGA 780
GGCAGGCGGA TTTCTGAGTT CGAGGCCAGC CTGGCCTACA AAGTGAGAGT TCCAGGACAG 840
CCAGGGCTAC ACAGAGAAAC CCTGTGTCGA AAAACAAAAC AAAACAAAAA ACAAAAAAGA 900
AAGTGAGGAA GAGACAAGAG TTCTCTTAGT TTCCAGTATA TGTCACACAG ATGTCACAAC 960
ATCTCGGTTT CAGTTTCCTT TGCTTACAAA ATCTGATTAT AGTCACAGTT GCAAACAGCT 1020
TTAAATATCT TGAATTTGGA AGTAGAATTA ATGGTCACAA GAGTTTACTA ATTCACATTT 1080
CTTCCCTTGC TTTCCTGTCA GGGTACCTCA CTAGACGCCT CAGGTTATTT CTTTTCTATT 1140
TCTATTCTAC TTTTCTTAGG CGGCTTTCAG GTGCCATCCT AAGGATTCCC TGCCAGAGAC 1200
TGACTCCGGG GAATGAGTTC CTGGAGGAGG GTAGGGTGGT GGCGCCTGGG TGACTGATCT 1260
CATTGTGTCA GCCGTATCCT CCCAGGAAAC CCTTTCTTAG GTTTGATAGC TGTGCATTTT 1320
CTGAAACATT CTCCAAATAA AATGTCTGGA GTGCTGGCTG TCAGGAGTGC TTTATTTTGG 1380
TCAGAGTCCA TCCACCCCCA AACCGCCTCA 1410