EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM002-25261 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
3T3-L1 
Coordinate
chr3:89010290-89011140 
Target genes
Number: 39             
NameEnsembl ID
Syt11ENSMUSG00000068923
U1ENSMUSG00000064738
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
Rusc1ENSMUSG00000041263
U6ENSMUSG00000077148
FdpsENSMUSG00000059743
Hcn3ENSMUSG00000028051
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
Gm16069ENSMUSG00000086718
Fam189bENSMUSG00000032657
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Muc1ENSMUSG00000042784
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Trim46ENSMUSG00000042766
Dpm3ENSMUSG00000042737
Slc50a1ENSMUSG00000027953
Efna1ENSMUSG00000027954
Gm15998ENSMUSG00000086389
Efna3ENSMUSG00000028039
4731419I09RikENSMUSG00000091513
Efna4ENSMUSG00000028040
Adam15ENSMUSG00000028041
Gm10702ENSMUSG00000074467
Dcst1ENSMUSG00000042672
Gm15417ENSMUSG00000074466
Zbtb7bENSMUSG00000028042
LenepENSMUSG00000078173
Flad1ENSMUSG00000042642
Cks1bENSMUSG00000028044
Shc1ENSMUSG00000042626
Pygo2ENSMUSG00000047824
Pbxip1ENSMUSG00000042613
PmvkENSMUSG00000027952
Ube2q1ENSMUSG00000042572
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:89010490-89010507ACTAATTAATTAATTGA-6.1
Lhx3MA0135.1chr3:89010492-89010505TAATTAATTAATT+6.78
Nr5a2MA0505.1chr3:89010416-89010431GCTGGCCTTGAAGTT-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:89010494-89010504ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:89010494-89010504ATTAATTAAT-6.02
mix-aMA0621.1chr3:89010490-89010501ACTAATTAATT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01437chr3:88963927-89055714Th_Cells
Enhancer Sequence
GTAAGCGCTA GAACTTCCCA GGGTGTCCCA ATGGACTCCA GATCTACCAT CCAAAATGAC 60
TGGCTCCAAT TTTAGAGTAC GTTCCCTGGT GCCAGGGTTG AGATAGGGTC TTGTTATATA 120
AACTCGGCTG GCCTTGAAGT TGTGTTCATG CTTTGACTCG TAAGTGCTGG GATTGTAAGC 180
ATCTACCACT CCTGACTTCT ACTAATTAAT TAATTGATTG TTTGATTTTT GAGACAACAG 240
GATCTCACCA GATAACTCTG GTTGTTCTGA AATTATATAG ACCAAACTGA CCTTCAACTC 300
CTCAAGATCT ACTTGCCCCT TGTCTCCCAA GTGCTGTGAT TGACATCATA TGCCTCCATA 360
CCTGACCTCT CAACTCCTTT TTTATGTGCA GGGAGGTGTA TGTGTGGGCC TTATCTGACA 420
ATTCATCAAG AGCAGCTGAG CTCGGTATAC TTTTTTCTTT GTTTGGTTTT TGACACTAAG 480
TCTCTCCATG ATTAGGCTAG GTTTGCTAGT CACTGAGCCC CAGGGAGCCA CTTGCCCCTA 540
CCTGCCCAGC GCTGGGACAG TGTAAGGCCT TGCATAGGTG TGGGTGCTGG GGGACTCAGG 600
TCCTCAGCTG CATGGCAAGA ACTTTACCAG CTCCAGCTTG TGACTCCTGG AACACCCTAG 660
GCTGGGTCTG GCTGCCTGGG GCACTGCCCA CTCTGAACTT TCCAGGGCCC TGTGAATCAT 720
TGCTGTCAGT GTAAGGCCAT CTGGTTGCTG GGTCCTACCA CCCATTTCTC AGGACATGTA 780
GTTCCTCTCT CACAGCTCTG TGCAGGGCTT GTGGTCAGTG GCTCCCTTCC CTATTGCTCC 840
TTCCCTCTCT 850