EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM002-25233 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
3T3-L1 
Coordinate
chr3:88451970-88455810 
Target genes
Number: 34             
NameEnsembl ID
Cct3ENSMUSG00000001416
0610031J06RikENSMUSG00000001418
Tmem79ENSMUSG00000001420
Smg5ENSMUSG00000001415
Paqr6ENSMUSG00000041423
BglapENSMUSG00000074489
Bglap2ENSMUSG00000074486
Pmf1ENSMUSG00000028066
Slc25a44ENSMUSG00000050144
Sema4aENSMUSG00000028064
LmnaENSMUSG00000028063
Mex3aENSMUSG00000074480
Rab25ENSMUSG00000008601
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Gm10704ENSMUSG00000074479
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
RP23ENSMUSG00000093390
2810403A07RikENSMUSG00000028060
SNORA42ENSMUSG00000084433
Rit1ENSMUSG00000028057
Gm17146ENSMUSG00000091881
5830417I10RikENSMUSG00000078684
Syt11ENSMUSG00000068923
U1ENSMUSG00000064738
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
U6ENSMUSG00000077148
Thbs3ENSMUSG00000028047
Dpm3ENSMUSG00000042737
Adam15ENSMUSG00000028041
Shc1ENSMUSG00000042626
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:88455037-88455055GGAAAGAAGGAAGAATAG+6.13
IRF2MA0051.1chr3:88454688-88454706GGAAAGAGAAAGCAGACC+6.48
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr3:88453554-88453565CTTGAGTGGCT-6.62
Nr5a2MA0505.1chr3:88452518-88452533GCTGGCCTTGGATTC-6.12
POU6F2MA0793.1chr3:88453643-88453653AGCTCATTAT+6.02
SOX10MA0442.2chr3:88454931-88454942AAAACAAAGAC+6.14
Enhancer Sequence
GCAAGGCTGG AAATGAAGCG CCGTTCAGCC TCCAGCGGCT GTTAATGATG CACACATTAG 60
AAAACTCGTT TGCATCTTAT TCATCTGCCA TGCTTGGATA GCACATCTGG TTCTTGCCAC 120
CCCTCTGTTC CCCTCCCTGC CCCTCCCATT TTCATGCCCA CCCTGGCTTA GGTCTCTGAG 180
CAGCAGCCTG TACCGCTCTG TCTCTTGGAG AGGCCGTAAG TGGTTTCAGT TCTTGGTTTT 240
GGCTTATTCC ACTTCCTGTT TCTAGGCCCT ACGCTTAGGC CACGGGGCAG GGACAGGGAA 300
TGCCCATCCC CACAACCTGA GAAGCGGGGT GTGAAGAAGG GTCTCAGGAC CCCACCGAAA 360
AGGGGAATTG AAGTTGCGTG GGCTGCAGCA GGCCTTGTGG GAAGCATCCT TGCCCTCCAG 420
CAGCTTCTGG CCCTCAGGAG GCACTTTCTC TCTAAATCAT GGGATTCTTC GGCTATAGGA 480
ATTGTTTTAT AAATTTATTT ACTTTAGTAT TTATTATCTT TGAGACAAGG TCTTGCAGTG 540
AAGCCCAGGC TGGCCTTGGA TTCAAGGCAA TCCTCTTGCT TCGGCCTCCC AAATGCTGCA 600
ATTACAGGCG CAAGCCAGTA TGCCCAGCCC ACTGTGTTTT TCTTTTACAT AATGGGTGCA 660
AAAAAGTTGC CAGGCCAAAA AACCAGCCCC CACTTCCTCT GCCTGACAAA TGCCTCAGAT 720
TCAAGCCCCC CGATGCTCAG CAGCTGTGCT GGAGGCAGCG CTAAGCACCG GGGCCCAAGC 780
ATGCGAAGGT CAGGTGGACG AGACTATTAC AGAGTCTGGA GAAGAGCAGG ACAGTTTCCC 840
AGCCTTCCCC AGAGGGGCCG GGAGGAAAAC CTAGAACCTG AGATGGATCT TCAGAGTAGG 900
AGTTGGGAGA GCCTGGGCTC CTTCCATTGC CTTATTACCA TAGCCGCAGT CCAGCATCAG 960
CCAGAGCCTT TCCCTTCCTC CTGTCATCAT CTGTCCCTTC CTTGTCCCCC TCCCTGATCC 1020
CACTTTCTGA ACCTAAAGTC TTCATTTTTG CCCCCACCGT CCTCCCTCCC ACCCCCGCTG 1080
CCATTTCAAA GCCCTGTGAC TGCTCTGAGA ACCAGGGTCC TGCTAGCTTT TTGCTTAAAC 1140
CACATAGCTC CCTTAGAGGA GGCTCTAGAC CTGGGCATGC CGCGCTCCAC TTTCCACCCC 1200
CTTTTCTCCA TGCTGCCCCC TCCAAGTCAG GGCTACACAC CGTTCCTTGA GTTGGTTTTG 1260
TCAATATTTA CCCCCTGGGC ACTGTAAAGC AGATGCCCCC AGAAAAGGCA ATATCCGGAC 1320
CCAGCGGGAC CTGAGGGGGC AGGAGGAAGG ATGCTCAGGC GCGGGAGGAT TACCCACCTT 1380
CCTGGATGGC TGGGAGTAGA ACTGGCATTT TGGAGCCAGT TTAAACATCA TAAAGAGGAA 1440
ATGAAACATC GAGAGGCTAA TTAAATCTTG TTCCCGTCCT TTAATATGTT GTGAGTTGGG 1500
TGATTCTTAA ATGCTCAGCG TCTGTGAACC AGGCTGGCGC CCCGAAGTAT TGCAGTGTCT 1560
TTACAGCTGC TGCTCTTCCG GGGCCTTGAG TGGCTAGTCA CAACCTGGCT ACAAAGCATC 1620
CCCAAAGCCT GGTCCTGAAG GGAGGGATGG AGTAGGAGCT CCATAGGCAA CTTAGCTCAT 1680
TATGGTTGTA AATGACTATG GAAACCAAAG GGATACCTTC TGCTCAGGAG ACAATTGCAA 1740
AGGGAGGCCC CTGTAGTTAG TGTCTGTCTC TTAGCAGAGT GTGATGTTGG TTTCAACTTT 1800
TATTGCCCTT CACCTGGTTT TTTGAGACCC AAGTGGAGCA TGCCAATTTG CCTAGACTGC 1860
CAGTGGGTCT CAGGGCTCCT GCCTTTCTCC CCAGCTCCAC TTGGATCCAG TGGTTTTATA 1920
TTGGGTGCTA GAGCTTGAAC TCAGGCATCA GCACACGTGC TCCAAGTGCT TTTCCCCCAG 1980
CTATGCACTG TATTTGTTTT TGCTGTTGTC TCTAATTTCT GGTAGCGTTA GGGTGTGTGG 2040
TGACGTCAGA GCACGCGGGT GGAGGTTAAG GGACAGCTTT GCATGCTTGG GTCTCGGTAC 2100
ACCTTTATGT GGCTTTGGCA ATCTAACTCA GGTTGCTGGG CTTACGGGCC ATGTGTTTTC 2160
CCTGCTGCGC CATCTTGCTG GTTCTTACTT TATTATGTGT GTGTGTTCTC ACAAATGTGC 2220
GCGCGCGCGT GAGGGTGAGC AATCAGATCA TGAGACTTAC ATTATATTCC ATAAACAAGT 2280
CCATGTAAGA TACCACTGAG ACCTCAGTGG CTCACCTGTA CCTGTCTGCC AGCTGCCCAT 2340
GTTTTCTGTC GTCTTTCCAT TTTCCATGGA AGGTGTCAGT ACCGGGAACC CTGCCTATGG 2400
CACTGCTGGA TCCTTTTATT TTGGAGACTG AACCTTTTAT TCCATTTAAG AAGAGATCTT 2460
GAGCCAGGCG TGGTGGAGCA CGCCTTTAAT CCCAGCTCTT GGGAGGCAGA GGCAGGCGGA 2520
TTTCTGAATT CGAAGTCAGC TTGGTCTACA AAGTGAGCTC CAGGACAGCC AGGGCTACAC 2580
AGAGAAACCC TGTCTCAGAA AAAAACAAGA AAACCCAAAT AAACATCGTG TGGAGGGTTT 2640
AGAAAACTGC TTCCCCGGGT AAAGACCCTT GCCCGAAAGC CTGATGGCCT AAGCTGACTC 2700
CCAGAATCTT AAGAGGGGGG AAAGAGAAAG CAGACCCCAA GCTGTCCTGA TCGCCACATG 2760
CATGTGGAAC ATGTCTCCTC GTCTGAACAC ACTTGAATAA AGTGTAATTT TTTTAAAAAT 2820
CAAAGCAAGG TGCGTTGGCA CATGCCTGTA GTTCCAGCAC ATGGGAGGCA GAAGCAGGTG 2880
AGTGTCTGAG TTCAAGGGAC AGCCTGGTCT ACAGAGTGAA TTCCAGGACA GTTAGGGTTA 2940
GGTCGTAAGA CCGTCTCAAT AAAAACAAAG ACGAGGAAAT GAAAAAACCT TATGTTTGCT 3000
TCTGACACAC GTACAAGTGT GAACACAAAT GTACATGCAA GCATGCATAC ATACATACAT 3060
AAGTACAGGA AAGAAGGAAG AATAGGCTAA AATGATCTGA AAAGCTCAAC TTGTTGGCAC 3120
ATGCCTATAA TTCGAGCATC TGGGATCAAG ATTAAAGATT CCAAGCGACC CTCAGCTTTA 3180
CAGTGTGAGA CCAGCCTGGG TATGATGAAA CCCTGCCTCC AATTTTAGAA GGGGAGAACT 3240
GACTTCTAGA ATAATTTGCG TGGGGGGAAG ATTCCAGCCC ACATGCTCTG GCGCTTGGCT 3300
GAAGTGCAGT TGTACTCAGT GAGACTAGCT TCTGGTTTCT GACCCTCAGC CTACAAAACT 3360
TTTCTGTATC TCTTGACTCC CCACCCCCAC GCCCAGACCC TTGTGATTGT TACCCAATCC 3420
TTGATTGAAA GGGACAGATC TATTCACTAT TCTCAAAGGC TATACACTCA GGGTCTGCAT 3480
CTTGTGGCAG CAAAACGACA GACAAACGTT GAAGGGGAGG CTTCTACATC ATTCCTAATG 3540
GGTACCTCTA AGATGACAAA AAGCTTATTG GCCAGAGAAT ACATTTTTGG GTTTGGTACC 3600
AAAGAGGCAT AACGGGTGCC CTATTCTAAA GTGACAGGGA GAACCGACAC CTGACCTGTT 3660
AGTCTAAACC GGGTGATGGA CGTTAGTTAT CCTGTGAAGT ACTTGCATGA AAGGTCAAGA 3720
CAGTCTCTGA CCGATCTGGT TTATTCTCAG TTCCTCTTTG CCATCTCCAG AGATAAGCTT 3780
TGCCACATCC ACCTCCTGTT TGGACTCCAG CTTCTCCGTT CTGTCACACC CAGAGTTGGT 3840